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Caracterización molecular de un banco de germoplasma del género Theobroma mediante la técnica RAPD*

Revista Colombiana de Biotecnología 01/2004;
Source: DOAJ

ABSTRACT

Mediante la utilización de marcadores RAPD (Random Amplified Polymorphic DNA), se analizaron 145 materiales (128 de T. grandiflorum y 17 de T. bicolor) pertenecientes al banco de germoplasma ex situ del género Theobroma del Instituto Sinchi, localizado en San José del Guaviare. A partir de un número inicial de 20, se seleccionaron los 5 cebadores capaces de generar mayor número de polimorfismos para generar 114 bandas que lograron distinguir entre más del 99% de los materiales analizados: 57 bandas para T. grandiflorum (84,2% polimórficas), 45 bandas para T. bicolor (26,7% polimórficas) y 12 bandas compartidas entre las dos especies (58,3% polimórficas). A partir de la matriz de semejanza generada utilizando el índice de Dice, representada en un dendrograma UPGMA, y el análisis de componentes principales, se determinó un alto grado de semejanza intraespecífica en los materiales analizados, particularmente en T. bicolor. Luego de comparar este análisis con el morfoagronómico previamente realizado en algunos materiales de T. grandiflorum, se encontró que los grupos generados por dicha evaluación morfológica y agronómica son heterogéneos a nivel molecular. La información obtenida se utilizará como herramienta para la toma de decisiones en cuanto a las estrategias de mantenimiento, enriquecimiento y uso del banco.Palabras clave: Theobroma grandiflorum, Theobroma bicolor, RAPD, caracterización molecular.RAPD markers (Random Amplified Polymorphic DNA) were used for analysing 145 individuals (128 T.grandiflorum and 17 T. bicolor) from the ex situ Theobroma genus germplasm bank at Instituto Sinchi, located atSan José del Guaviare. 5 primers able to generated polymorphism were selected from an initial set of 20,generating 114 bands that enable to us to distinguish between more than 99% of individuals analysed: 57bands for T. grandiflorum (84.2% polymorphic), 45 bands for T. bicolor (26.7% polymorphic) and 12 bands shared between the two species (58.3% polymorphic). A high degree of intra-specific similarity particularly inT. bicolor was established from the similarity matrix obtained by using the Dice index and represented in aUPGMA dendrogram and the principal components analysis (PCA). The comparison of this analysis with aprevious morpho-agronomic evaluation of some T. grandiflorum individuals revealed that the groupsgenerated on the basis of its agronomic and morphological traits were heterogeneous at molecular level. Theobtained information will be used as a tool in strategies regarding maintenance, enrichment and use of thegermplasm bank.Key words: Theobroma grandiflorum, Theobroma bicolour, RAPD, molecular characterisation.

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Available from: Luz Marina Melgarejo, Jan 23, 2014
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    • "Su importancia dentro de los sistemas de producción agrícola se basa en sus frutos de pulpas de aroma y sabor agradable usados en jugos, jaleas, helados, licores, mermeladas, entre otros productos [3] [5]. "
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    ABSTRACT: RESUMEN El Theobroma, es el género de mayor relevancia de la familia de las Esterculiáceas, debido a la importancia económica del árbol de cacao. Por esta razón las especies del género Theobroma, en particular el copoazú y el maraco, se han convertido en el objetivo de estudios, ya que se han catalogado como especies promisorias, de acuerdo al potencial agroeconómico que representan para la región amazónica de donde provienen. En este estudio, se analizaron algunos parámetros fisicoquímicos como el pH, la acidez titulable, sólidos solubles totales, en base a peso fresco, y el contenido de azúcares reductores, contenido de los azúcares fructosa, glucosa y sacarosa, contenido de los ácidos orgánicos málico, oxálico y cítrico, y el contenido de fenoles totales, en base a peso seco de la pulpa de tres especies del género Theobroma, con el fin de comparar sus características fisicoquímicas. Palabras Clave— Theobroma bicolor, Theobroma cacao, Theobroma grandiflorum
    Full-text · Conference Paper · Oct 2014
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    Full-text · Article · Jan 2012
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    ABSTRACT: Cacao (Theobroma cacao L.) is an allogamous plant native to tropical America, but nowadays it is grown in tropical regions across the world. Originally, programs to obtain "improved" cultivars were based on morphological markers. However, there is a trend to use molecular markers. Here we discuss the main applications of molecular biology tools to obtain linkage maps of this important crop, to identify quantitative trait loci involved in major agronomic performance and disease resistance, as well as genome sequencing whose recent publication opens an important opportunity for specific investigations. We emphasize on the lack of information and research on the use of these tools to find markers associated directly with the sensory quality characteristics of almonds, which is one of the main reasons that encouraged its visionary domestication 4 000 years ago and its wide distribution around the world 500 years ago. Knowledge of the individuals who exhibit these characteristics is important, because it’s possible extinction by social or diseases entail loss of valuable scientific and technological information that can be used for conservation and exploitation
    Full-text · Article · Mar 2012
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