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Sistema de evaluación, monitoreo y de alerta e instrumento de información intergubernamental para la implementación de políticas públicas para los mares mexicanos (primera fase)

Authors:

Abstract

Fortalecer el sistema de monitoreo marino para el apoyo de la toma de decisiones y la aplicación de las políticas públicas para los mares mexicanos, la pesca sustentable y la conectividad ecológica y el manejo integrado del paisaje marino.
REPORTE FINAL
Enero 15, 2021
Proyecto de cooperación técnica CONABIO-AFD: Bioconnect (2do. año)
Sistema de evaluación, monitoreo y de alerta e instrumento de información
intergubernamental para la implementación de políticas públicas para los mares
mexicanos (primera fase)
Derivado del: Programa de apoyo para la definición e implementación de la política nacional de     
conectividad ecológica en México: Bioconnect, entre SEMARNAT y AFD.
Agencia financiera
Agencia Francesa de Desarrollo (AFD)
Institución ejecutora
Comisión Nacional para el Conocimiento y Uso de la Biodiversidad (CONABIO)
Responsables del proyecto
Dr. Rainer Andreas Ressl (Director General de Geomática, CONABIO; coordinador del proyecto;  
supervisor general del proyecto). E-mail: rressl@conabio.gob.mx
Dr. Sergio Cerdeira Estrada (Subcoordinador de Monitoreo Marino, CONABIO; coordinador del  
proyecto; responsable del OE-1, OE-2). E-mail: scerdeira@conabio.gob.mx
Dra. Susana Perera Valderrama (Especialista de la Subcoordinación de Monitoreo Marino,      
CONABIO; responsable del OE-1, OE-2). E-mail: sperera@conabio.gob.mx
Dr. Raúl Martell Dubois (Especialista de la Subcoordinación de Monitoreo Marino, CONABIO;    
responsable del OE-1, OE-2). E-mail: rmartell@conabio.gob.mx
Otros miembros del equipo de trabajo en Conabio
M. C. Laura Olivia Rosique de la Cruz, Ing. Pas. Jaime Ernesto Valdez Chavarin, Dr. Hansel         
Caballero Aragón, Ing. José Rosario López Perea,Dr. Sergio Díaz Martínez, Ing. Ricardo   
Escalante Jáuregui, y M.C. Diana Raquel Hernández Robles.
Socios estratégicos:
SEMARNAT, SEMAR, CONACYT e INECC
Tiempos de ejecución: Desde Enero 14, 2020 a Enero 14, 2021 (1 año)
Financiamiento de la AFD al Fideicomiso Fondo para la Biodiversidad:
Monto: $ 2,000,000 MXN (OE-1: $ 490,000 MXN y OE-2: $ 1,510,000 MXN)
Objetivo general del proyecto
Fortalecer el sistema de monitoreo marino para el apoyo de la toma de decisiones y la aplicación de        
las políticas públicas para los mares mexicanos, la pesca sustentable y la conectividad ecológica y el
manejo integrado del paisaje marino.
Antecedentes
Actualmente los mares mexicanos enfrentan una serie de problemas ambientales, entre ellos se
destacan la extinción de la vaquita marina, la sobrepesca y la arribazón de sargazo pelágico. En este       
sentido, la presente inversión busca fortalecer el sistema de monitoreo marino para el apoyo de la     
toma de decisiones y la aplicación de las políticas públicas para los mares mexicanos, la pesca    
sustentable y la conectividad ecológica y el manejo integrado del paisaje. En esta primera fase los   
esfuerzos se enfocarán en el aprovechamiento de los recursos pesqueros en el alto golfo de
california, hábitat de la vaquita marina, y en la detección de las arribazones masivas de sargazo, que        
afectan a los estados del litoral del Caribe Mexicano.
PLAN DE TRABAJO
Actividades (A) y Resultados (R) por Objetivos Específicos (OE):
OE-1. Recopilar la información geoespacial nacional existente relacionada al aprovechamiento de
los recursos pesqueros en los mares mexicanos, particularmente en el alto golfo de california, según
disponibilidad, en estructura de base de datos que incluya la información de los diferentes sectores     
gubernamentales, no-gubernamentales y de academia, así como de los instrumentos que permiten
la conectividad ecológica y el manejo integrado del paisaje marino.
R-1. Base de datos geoespacial relacionada con el aprovechamiento de los recursos   
pesqueros en los mares mexicanos.
A-1.1. Recopilar la información geoespacial nacional existente relacionada al
aprovechamiento de los recursos pesqueros en los mares mexicanos. Se enfocará a
bases de datos existentes en el alto golfo de california.
R-1.1. Base de datos geoespacial sobre el aprovechamiento de los recursos  
pesqueros, particularmente en el alto golfo de california, como parte del
sistema in-situ de monitoreo oceánico (SIDMO) dentro de SIMAR.
OE-2. Desarrollar el Sistema satelital de alerta temprana de Sargazo.
R-2. Detección operacional de sargazo por satélite que pudiera afectar la zona costera del  
Caribe Mexicano.
A-2.1. Detectar el sargazo pelágico en la superficie marina-costera del Golfo de   
México, el Mar Caribe y el Pacífico nororiental tropical y en particular de la zona
económica exclusiva de México, a partir del procesamiento de imágenes satelitales
en tiempo casi-real e histórico, y representar su distribución diaria espacio-temporal.
R-2.1. Prototipo para la detección de Sargazo en los mares mexicanos basado  
en sensores remotos satelitales, incorporados en el sistema de alerta SATsum
dentro de la plataforma SIMAR.
2
A-2.2. Pronosticar la posible arribazón de sargazo en zonas específicas de playas del      
Caribe mexicano en función de los vientos y las corrientes marinas, según
disponibilidad de datos.
R-2.2. Prototipo de productos que pronostiquen la posible arribazón de sargazo  
a la costa basados en imágenes satelitales e información sobre corrientes
marinas y vientos superficiales, incorporados en el sistema de alerta SATsum
dentro de la plataforma SIMAR.
A-2.3. Generar reportes automatizados semanales que sinteticen la detección
satelital de sargazo pelágico en la superficie del mar y su posible arribazón en playas
del Caribe mexicano e impacto ambiental asociado.
R-2.3. Reportes semanales como parte del sistema de alerta SATsum dentro de    
la plataforma SIMAR.
 
3
RESULTADOS
RESULTADO R-1.1. (asociado al OE-1., R-1., A-1.1.)
Base de datos geoespacial sobre el aprovechamiento de los recursos pesqueros,
particularmente en el alto golfo de california, como parte del sistema in-situ de monitoreo
oceánico (SIDMO) dentro de SIMAR.
1. OBIS: Sistema de Información sobre Biodiversidad Oceánica (IOC-COI-UNESCO)
Base de datos disponible en la plataforma SIMAR de Conabio, dentro de la sección de BIOinfo: Base        
de datos de la biodiversidad marina, asociado a SIDMO: Sistema in-situ de monitoreo oceánico,      
como parte del Centro de Datos. (https://simar.conabio.gob.mx/) (Fig. 1).
OBIS coordina y gestiona la base de datos y el conocimiento sobre biodiversidad marina a escala
mundial, desde las bacterias hasta los cetáceos, contribuyendo a la planificación y generación de
políticas de conservación del océano a escala mundial. OBIS es un centro de intercambio de     
información y datos de acceso abierto mundial sobre la biodiversidad marina para la ciencia, la      
conservación y el desarrollo sostenible.
OBIS ofrece al público en general su plataforma web “OBIS Mapper“, que permite consultar datos. Así
mismo, ofrece otras alternativas de acceso y herramientas para desarrolladores, que permite incluirla
en SIMAR. En esta revisión, se descargaron los datos de registros dentro del polígono delimitado por
las coordenadas de SIMAR. Los datos fueron cargados en Postgresql y se utilizan puntos de puntos
de acceso (o endpoints) para la extracción de datos. Algunos de los términos de consulta son taxón,      
área, país, etc. Estos resultados pueden ser solicitados en forma de puntos ya que permite ubicar de
una manera más precisa los datos.
Para más información sobre esta base de datos consulte el sitio web de OBIS , así como el Anexo
1
1.1.1. y el 1.1.6.
1 https://obis.org/
4
Figura 1. Acceso a OBIS desde SIMAR
2. SNIB: Sistema Nacional de Información sobre Biodiversidad de México (CONABIO,    
México)
Base de datos disponible en la plataforma SIMAR de Conabio, dentro de la sección de BIOinfo: Base        
de datos de la biodiversidad marina, asociado a SIDMO: Sistema in-situ de monitoreo oceánico,      
como parte del Centro de Datos. (https://simar.conabio.gob.mx/) (Fig. 2)
La base de datos del SNIB ha sido desarrollada por la CONABIO la cual compila, organiza, genera y
distribuye información sobre la diversidad biológica de México para adoptar las medidas que requiere
el país en la gestión de su capital natural. Fue creada con el fin de apoyar la toma de decisiones          
encaminadas a la conservación y el uso sustentable del capital natural de México y para atender los
grandes problemas ambientales que lo afectan, basados en la mejor información y el más amplio
conocimiento científico, que al mismo tiempo sean de fácil acceso.
En esta revisión, se tiene los datos cargados en PostgreSQL y se utilizan puntos de puntos de acceso
(o endpoints) para la consulta y extracción de datos. Algunos de los términos de consulta son taxón,      
área, etc. Estos resultados pueden ser solicitados en forma de puntos ya que permite ubicar de una      
manera más precisa los datos y mostrar información adicional.
5
Para más información sobre esta base de datos consulte (Koleff y Jimenez, 2021) , el sitio web de
2
SNIB-Conabio , por referencia geográfica, por referencia taxonómica, por proyecto financiado por la     
3
Conabio, así como por el Anexo 1.1.2. y el 1.1.6.
Figura 2. Acceso a SNIB desde SIMAR
3. Especies-COBI-TNC: Base de datos de especies marinas prioritarias para la conservación  
en el Golfo de California y costa occidental de Baja California Sur (COBI-TNC, México)
Base de datos disponible en la plataforma SIMAR de Conabio, dentro de la sección de BIOinfo: Base        
de datos de la biodiversidad marina, asociado a SIDMO: Sistema in-situ de monitoreo oceánico,      
como parte del Centro de Datos. (https://simar.conabio.gob.mx/) (Fig. 3)
Como resultado de los procesos de planificación para la conservación marina del Golfo de California y      
costa occidental de Baja California Sur, llevado a cabo por COBI-TNC en 2006, se elaboraron bases de
datos de especies prioritarias para la conservación o que estuvieran bajo algún esquema de
protección, así como para establecer zonas de diversidad y abundancia de tortugas marinas, aves
acuáticas y cetáceos, y registros de tiburones y rayas. Dichas bases se construyeron con registros     
proporcionados por los expertos y reportes en la literatura.
2 Koleff, P., y R. Jiménez 2012. Sistema Nacional de Información sobre Biodiversidad. Conabio, Biodiversitas,
100: 4-5
3 https://www.snib.mx/
6
Los datos se alojan en una base de datos en Postgresql. Se realizó adicionalmente un proceso básico
de revisión de los nombres científicos (ver anexo 1.1.3). Las consultas se realizan a través de
endpoints que permiten consultar el taxón y mostrar los datos relacionados. Los datos se muestran      
en forma de punto que permite una mayor precisión y mostrar información adicional.
Para más información sobre esta base puede revisar a (Ulloa et al, 2006) , así como el Anexo 1.1.3.
4
Figura 3. Acceso a Especies-COBI-TNC desde SIMAR
4. Pesquerías-FAO: Estadística de la Producción Mundial Pesquera (1950-2018) (FAO)
Base de datos disponible en la plataforma SIMAR de Conabio, dentro de la sección de infoPESCA:    
Base de datos pesqueros, asociado a SIDMO: Sistema in-situ de monitoreo oceánico, como parte del       
Centro de Datos. (https://simar.conabio.gob.mx/) (Fig. 4)
Esta base de datos contiene las series anuales de la producción pesquera mundial (captura y
acuicultura) desde 1950. Esta base de datos presenta el volumen de especies acuáticas capturadas
por país o zona, por especies, por las principales zonas pesqueras de la FAO y por año, de todos los
tipos de pesca: comercial, industrial, recreativa o de subsistencia. También se presentan la
producción maricultora, acuicultora y otros tipos de cría de peces.
4 Ulloa, R., J. Torre, L. Bourillón, A. Gondor y N. Alcantar. 2006. Planeación ecorregional para la conservación
marina: Golfo de California y costa occidental de Baja California Sur. Informe final a The Nature Conservancy.
Guaymas (México): Comunidad y Biodiversidad, A.C., 153 pp.
7
La base está alojada en Postgresql y cuenta con los campos y tablas relacionadas de origen. La
consulta de la información puede realizarse a través un área determinada (áreas pesqueras) y de
endpoints asociados a los taxones. La información recuperada incluye datos de montos de producto      
pesquero por especie por año.
Para más información sobre esta base de datos consulte el sitio web “Global Production”. , así como  
5 6
el Anexo 1.1.4.
Figura 4. Acceso a Pesquerías-FAO desde SIMAR
5. Pesquerías-CONAPESCA: Registros de la Producción Pesquera y Acuícola de México  
(2006-2014) (CONAPESCA, México)
Base de datos disponible en la plataforma SIMAR de Conabio, dentro de la sección de infoPESCA:    
Base de datos pesqueros, asociado a SIDMO: Sistema in-situ de monitoreo oceánico, como parte del       
Centro de Datos. (https://simar.conabio.gob.mx/) (Fig. 5)
5 http://www.fao.org/fishery/statistics/global-production/es
6 FAO. 2020. Fishery and Aquaculture Statistics. Global production by production source 1950-2018 (FishstatJ).
In: FAO Fisheries and Aquaculture Department [online]. Rome. Updated 2020.
www.fao.org/fishery/statistics/software/fishstatj/en
8
Esta base de datos contiene los registros de la Producción Pesquera y Acuícola de México
(2006-2014) por estado u oficina de pesca de la CONAPESCA.
7
La base de datos se encuentra alojada Postgresql. Para facilitar su manejo, se normalizaron parte de
los datos (estado, oficina, origen) generando catálogos en tablas independientes. La consulta de la
información se realiza a través de áreas correspondientes a los estados y a endpoints asociados con  
el taxón. Cabe señalar que la información recuperada actualmente es un agrupado a nivel estatal de
montos de producción pesquera y costo promedio del producto, por año. 
Para más información sobre esta base de datos consulte el sitio web “Datos Abiertos”, así como el  
Anexo 1.1.5.
Figura 5. Acceso a Pesquerías-CONAPESCA desde SIMAR
6. Zonas de Refugio Pesquero en México (ZRP-México-2020) (COBI)
Información geoespacial disponible en la plataforma SIMAR de Conabio, dentro la sección de  
Refugios Pesqueros, asociado al Servicio de información geoespacial (GEOdat), como parte del      
Centro de Datos. (https://simar.conabio.gob.mx/) (Fig. 6)
7 CONAPESCA. 2018. Registros de la Producción Pesquera y Acuícola de México (2006-2014).
https://datos.gob.mx/busca/dataset/produccion-pesquera
9
Ofrece la ubicación de las Zonas de refugio pesquero vigentes y no vigentes de México y sus      
respectivos decretos (Fulton, 2020) . Son datos geoespaciales sobre el aprovechamiento de los
8
recursos pesqueros, particularmente en el Alto Golfo de California.
Figura 6. Visualización de las zonas de refugio pesquero en la plataforma SIMAR.
7. Zonas de pesca en la ecorregión Golfo de California - 2006
Información geoespacial disponible en la plataforma SIMAR de Conabio, dentro la sección de Zonas    
de pesca en la ecorregión Golfo de California - 2006, asociado al Servicio de información    
geoespacial (GEOdat), como parte del Centro de Datos. (https://simar.conabio.gob.mx/) (Fig. 7)
Áreas marino-costeras en las cuales se lleva a cabo el aprovechamiento de especies en diferentes
procesos o actividades como la pesca industrial, la pesca ribereña, la pesca de autoconsumo, la
pesca para uso ornamental (acuarios) y la pesca deportiva :
9
A. Zonas de pesca deportiva
B. Zonas de pesca de moluscos
C. Zonas de pesca de escama
D. Zonas de pesca de equinodermos
E. Zonas de pesca de crustáceos
F. Zonas de pesca de peces cartilaginosos
G. Zonas de pesca industrial de camarón
H. Zonas de pesca ribereña de camarón
I. Granjas de camarón
J. Zonas de pesca de calamar
K. Zonas de pesca de sardina
L. Zonas de reclutamiento de sardina
M. Zonas de elevada productividad primaria
8 Fulton, S., 2020, Ubicación de las ZRP, elaborado con los Acuerdos Secretariales del Diario Oficial de la
Federación, Comunidad y Biodiversidad A.C (COBI)
9 Ulloa, R., J. Torre, L. Bourillón, A. Gondor y N. Alcantar. 2006. Planeación ecorregional para la conservación
marina: Golfo de California y costa occidental de Baja California Sur. Informe final a The Nature Conservancy.
Guaymas (México): Comunidad y Biodiversidad, A.C., 153 pp
10
Figura 7. Visualización de las zonas de pesca en la ecorregión Golfo de California - 2006 en la plataforma
SIMAR.
Producto complementario dentro de la base de datos SIMAR, que se hará visible y
disponible para consulta durante marzo 2021.
8. ModelosGolfoC: Modelos de distribución potencial de especies marinas en el Golfo de  
California (COBI-TNC, México, 2017)
La base de datos estará disponible en la plataforma SIMAR de Conabio dentro de la sección de  
EcoMOD: Modelos de distribución potencial de especies y ecosistemas marino-costeros, asociado a    
SIDMO: Sistema in-situ de monitoreo oceánico, como parte del Centro de Datos.    
(https://simar.conabio.gob.mx/). La base de datos la conforman modelos de distribución de especies
mediante el uso de MaxEnt (Elith et al. 2011) , a partir de registros de ocurrencia de 189 especies
10
entre peces e invertebrados, recopilados de datos de seguimiento, colecciones científicas, planes    
anteriores y registros publicados. Para más información sobre esta base de datos consulte
(Álvarez-Romero et al, 2018) , el material suplementario , así como el Anexo 1.1.7.
11 12
10 Elith J, Phillips SJ, Hastie T, Dudík M, Chee YE, Yates CJ (2011) A statistical explanation of MaxEnt for
ecologists. Diversity and Distributions, 17, 43-57.
11 Álvarez-Romero, J. G., Munguía-Vega, A., Beger, M., del Mar Mancha-Cisneros, M., Suárez-Castillo, A. N.,
Gurney, G. G., ... & Adams, V. M. (2018). Designing connected marine reserves in the face of global warming.
Global change biology, 24(2), e671-e691. https://onlinelibrary.wiley.com/doi/abs/10.1111/gcb.13989
12 Material Suplementario:
https://onlinelibrary.wiley.com/action/downloadSupplement?doi=10.1111%2Fgcb.13989&file=gcb13989-sup-000
1-SupInfo.pdf
11
RESULTADO R-2.1. (asociado al OE-2., R-2., A-2.1.)
Prototipo para la detección de Sargazo en los mares mexicanos basado en sensores
remotos satelitales, incorporados en el sistema de alerta SATsum dentro de la plataforma
SIMAR.
El Sistema satelital de alerta temprana de Sargazo (SATsum) está desarrollado como parte integral      
del Sistema de información y análisis marino costero (SIMAR) <https://simar.conabio.gob.mx/>,  
basado en geointeligencia bioinformática para el conocimiento y la conservación de los mares y    
costas de la cuenca del Gran Caribe (Mar Caribe y el Golfo de México) y del Pacífico nororiental
tropical. SIMAR tiene dentro de sus objetivos la integración de sistemas de información y análisis de
la biodiversidad así como de sistemas de alertas tempranas que contribuyan a una responsable y
precisa toma de decisiones de comunidades y gobiernos; además de estudiar los cambios en los
ecosistemas marino costeros mexicanos a corto y largo plazo, mediante herramientas de análisis de    
series de tiempo (Fig. 8).
SIMAR integra, gestiona y visualiza grandes volúmenes de datos multiescalares derivado de    
muestreos y monitoreos in situ (sobre parámetros ambientales físico-químico y registros de
biodiversidad) y de observaciones satelitales (de temperatura y color del océano), así como de   
modelos climáticos (bajo los escenarios de cambio climático) e información geoespacial; de igual
forma incorpora algoritmos y herramientas tecnológicas de geovisualización y análisis sobre una    
plataforma web <https://simar.conabio.gob.mx>, apoyando así a la conservación y el uso sostenible
de la biodiversidad marina-costera, en un contexto de cambio y variabilidad climática, y contribuyendo
a una responsable y precisa toma de decisiones de comunidades y gobiernos.
Figura 8. Diagrama con la arquitectura de SIMAR
12
El Sistema satelital de alerta temprana de Sargazo (SATsum) es un servicio gratuito 24/7 del  
gobierno de méxico que permite la detección diaria de sargazo pelágico en la superficie del mar  
mediante imágenes proveniente de 4 sensores satelitales, con la correspondiente emisión de una    
alertas temprana para la toma de decisiones.
Para ello se basa en:
-El uso de los siguientes 4 sensores ópticos satelitales de color del océano, con una     
resolución espacial de 1 km y una resolución temporal de 2 a 3 veces al día:
Sensor MODIS a bordo del satélite Aqua, de NASA
Sensor MODIS a bordo del satélite Terra, de NASA
Sensor VIIRS a bordo del satélite SNPP, Suomi NPP, de NASA-NOAA
Sensor VIIRS a bordo del satélite JPSS-1, NOAA-20, de NASA-NOAA
-El uso de los siguientes 1 sensor óptico satelital de color del océano, con una resolución    
espacial de 250 m yuna resolución temporal de 2 a 3 veces al día:
Sensor MODIS a bordo del satélite Aqua, de NASA
SATsum permite la generación operacional y visualización de los siguientes productos:
I. Índices de color del océano asociados a la presencia de sargazo pelagico flotante,
estimados a partir de sensores satelitales a 1-km - Diario (Fig. 9)
Producto 1. Índice Alternativo de Algas Flotantes diario - Aqua / MODIS (AFAI-Aqua)
Producto 2. Índice Alternativo de Algas Flotantes diario - Terra / MODIS (AFAI-Terra)
Producto 3. Índice Alternativo de Algas Flotantes diario - VIIRS / SNPP (AFAI-VIIRS-SNPP)
Producto 4. Índice Alternativo de Algas Flotantes diario - VIIRS / JPSS-1 (AFAI-VIIRS-JPSS-1)
Producto 5. Máximo del Índice Alternativo de Algas Flotantes diarios - MODIS/VIIRS   
(Max-D-AFAI)
II. Índices de color del océano asociados a la presencia de sargazo pelagico flotante,
estimados a partir de sensores satelitales a 1-km - Semanal
Producto 6. Máximo del Índice Alternativo de Algas Flotantes semanal - MODIS/Aqua  
(Max-W-AFAI) (Fig. 10)
Producto 7. Cobertura potencial estimada de sargazo flotante semanal basado en AFAI -  
Aqua/MODIS (DSC-W-Aqua) (Fig. 11)
Producto 8. Alerta regional de sargazo flotante por satélite (R-FSA) (Reportes para el Golfo de  
México y el Mar Caribe) (RESULTADO R-2.3.)
III. Índices de color del océano asociados a la presencia de sargazo pelagico flotante,
estimados a partir de sensores satelitales a 250 m - Diario
Producto 9. Índice Normalizado de Algas Flotantes diario - Aqua / MODIS (NFAI-Aqua) (Fig.  
12)
13
Figura 9. SATsum-SIMAR. 12 de julio del 2020. Índices de color del océano asociados a la presencia de sargazo
pelagico flotante, estimados a partir de sensores satelitales a 1-km - Diario.
Figura 10. SATsum-SIMAR. Semana 3/2021: Enero 18-24, 2021. Índices de color del océano asociados a la
presencia de sargazo pelagico flotante, estimados a partir de sensores satelitales a 1-km - Semanal. Máximo del
Índice Alternativo de Algas Flotantes semanal - MODIS/Aqua (Max-W-AFAI).
14
Figura 11. SATsum-SIMAR. Semana 3/2021: Enero 18-24, 2021. Índices de color del océano asociados a la
presencia de sargazo pelagico flotante, estimados a partir de sensores satelitales a 1-km - Semanal. Cobertura
potencial estimada de sargazo flotante semanal basado en AFAI - Aqua/MODIS (DSC-W-Aqua).
Figura 12. SATsum-SIMAR. Julio 12, 2020. Índices de color del océano asociados a la presencia de sargazo
pelagico flotante, estimados a partir de sensores satelitales a 250 m - Diario. Índice Normalizado de Algas
Flotantes diario - Aqua / MODIS (NFAI-Aqua).
15
El algoritmo del Índice Alternativo de Algas Flotantes (AFAI) para MODIS y VIIRS se describe en el
Anexo 2.1.1. El algoritmo para estimar la cobertura de sargazo en superficie para el sensor
MODIS/AQUA se describe en el Anexo 2.1.2. El algoritmo para obtener el Máximo del Índice
Alternativo de Algas Flotantes semanal - MODIS/Aqua (Max-W-AFAI) se describe en el anexo 2.1.3. El
algoritmo para determinar la cobertura potencial estimada de sargazo flotante semanal basado en
AFAI - Aqua/MODIS (DSC-W-Aqua) se describe en el anexo 2.1.4. El algoritmo para determinar el 
Índice Normalizado de Algas Flotantes diario - Aqua / MODIS (NFAI-Aqua)) se describe en el anexo
2.1.5.
Como parte del Prototipo para la detección de Sargazo en los mares mexicanos basado en
sensores remotos satelitales se realizó la siguiente actividad (Resultado R-2.1.):
I. EcoSPECTRA, una biblioteca espectral de alta resolución en ecosistemas marinos.
Fase 1. Trabajo de campo, compilación, y análisis para validación espectral.
Las mediciones del color del océano a partir de imágenes de satélite son una herramienta poderosa
en aplicaciones oceanográficas, resulta muy útil para conocer la variabilidad espacio-temporal de la
superficie del océano. Las aplicaciones de estos estudios son muy vastas, se destacan la
productividad primaria oceánica, los flujos de carbono, pesquerías, detección de florecimientos
algales y más recientemente la detección y seguimiento de manchas de sargazo. Las mediciones in
situ de las firmas espectrales son fundamentales para calibrar y validar los resultados de las
mediciones satelitales.
Para la medición in situ de firmas espectrales en este proyecto se utilizó el espectrorradiómetro
GER-1500. El GER 1500 es un espectrorradiómetro de campo con un intervalo de longitud de onda que
va desde el Ultravioleta pasando por el visible y llegando hasta el infrarrojo cercano, o sea desde la
longitud de onda de 350 a la de 1050 nm, con una resolución de 1 nm.
Entre el 28 de junio-4 julio de 2019 se capturaron in situ con el espectroradiómetro GER-1500 un total       
de 1638 espectros de diferentes ambientes superficiales. A los efectos de este proyecto se midieron    
firmas correspondientes a las siguientes condiciones: sargazo en la superficie del mar, aguas limpias
someras, aguas limpias profundas, arena limpia y arena cubierta de sargazo en la playa con diferentes
estados de degradación.
Fueron capturados más de 50 registros en cada estación (en 3 filamentos de sargazo se tomaron
más de 400 registros) para obtener un número suficiente de espectros de cada objeto, de forma tal          
que permita hacer un análisis estadístico representativo de cada uno.
Se anexan una tabla con toda la información referente a las estaciones donde se realizaron las
mediciones con el espectrorradiómetro y un esquema con la ubicación de dichas estaciones.
Igualmente se anexan los espectros medidos sobre 5 objetos: sargazo en aguas oceánicas, sargazo
en aguas costeras, sargazo sobre la arena, aguas oceánicas limpias y aguas someras limpias. Los
espectros se acompañan de fotografías panorámicas del lugar donde fueron medidos así como de
gráficas con los principales valores estadísticos de cada estación, los cuales incluyen el espectro
medio y la desviación estándar.
La base de datos con la totalidad de las firmas espectrales medidas se denomina EcoSPECTRA:  
Biblioteca espectral de alta resolución en ecosistemas marinos y podrá consultarse en línea desde la      
plataforma SIMAR en el módulo creado para tal fin a partir de marzo 2021 como parte de una segunda
fase en desarrollo (ver guía sobre firmas espectrales en el Anexo 2.1.6). 
16
RESULTADO R-2.2. (asociado al OE-2., R-2., A-2.2.)
Prototipo de productos que pronostiquen la posible arribazón de sargazo a la costa basados
en imágenes satelitales e información sobre corrientes marinas y vientos superficiales,
incorporados en el sistema de alerta SATsum dentro de la plataforma SIMAR.
Para generar una estimación diaria del pronóstico de deriva del sargazo pelágico en las aguas del    
Mar Caribe, y en particular estimar la probabilidad de arribazón de sargazo a las playas del Caribe    
mexicano, se requerirá de tener operacionalmente los productos de modelos de dirección y velocidad
de vientos y corrientes marinas. Hoy en día, tenemos disponible operacionalmente dentro del sistema
de modelos climáticos océano-atmósfera (SIMOD), en la sección de modelos meteorológicos,
oceanográficos y climatológicos, como parte de SIMAR, el producto:
Producto 1. Vientos superficiales derivados del modelo GFS a 22 km de NOAA (cada 6 horas).     
(Fig. 13)
Figura 13. SATsum - SIMAR. Julio 12, 2020. Modelos de vientos superficiales junto al producto diario AFAI.
Por otra parte, se tendrá disponible los modelos de las corrientes marinas superficiales y su
pronóstico para 7 días derivadas ambas del análisis de GOFS 3.1, 41-layer HYCOM + NCODA Global, a
1/12° de resolución espacial.
Ambos productos formarán parte de los insumos necesarios para producir semanalmente un
pronóstico de deriva del sargazo en aguas del Caribe mexicano, como parte de una segunda fase.
 
17
RESULTADO R-2.3. (asociado al OE-2., R-2., A-2.3.)
Reportes semanales como parte del sistema de alerta SATsum dentro de la plataforma
SIMAR.
Como parte del Sistema satelital de alerta temprana de Sargazo (SATsum) actualmente se emite un        
Boletín semanal (cada lunes) con el reporte de la condición de la cobertura de Sargazo pelágico para
dos regiones del Océano Atlántico: el Golfo de México y el Mar Caribe, así como el máximo del índice
alternativo de algas flotantes semanal. El Boletín se genera automáticamente a partir del análisis de
los productos diarios de dicha semana (Fig. 14 y 15).
El Boletín incluye además el área con cobertura potencial estimada de sargazo para ambas regiones,
así como el viento superficial para el Mar Caribe para el día de la generación del reporte. La      
información del viento resulta relevante para la estimación de las condiciones oceánicas y
atmosféricas que influyen en el desplazamiento del sargazo flotante.
Un ejemplo del Boletín semanal de Sargazo se muestra en detalles en el Anexo 2.2.1.
Figura 14. SATsum-SIMAR. Semana 3/2021: Enero 18-24, 2021. Índices de color del océano asociados a la
presencia de sargazo pelagico flotante, estimados a partir de sensores satelitales a 1-km - Semanal. Alerta
regional de sargazo flotante por satélite (R-FSA) (Reportes para el Golfo de México y el Mar Caribe).
18
Figura 15. SATsum-SIMAR. Semana 3/2021: Enero 18-24, 2021. Índices de color del océano asociados a la
presencia de sargazo pelagico flotante, estimados a partir de sensores satelitales a 1-km - Semanal. Alerta
regional de sargazo flotante por satélite (R-FSA) (Reporte para el Golfo de México). Boletín semanal de Alerta
regional de sargazo flotante por satélite (R-FSA).
 
19
ANEXOS
REPORTE FINAL
Proyecto de cooperación técnica CONABIO-AFD: Bioconnect (2do. año)
Sistema de evaluación, monitoreo y de alerta e instrumento de información
intergubernamental para la implementación de políticas públicas para los mares
mexicanos (primera fase)
 
20
ANEXO 1.1.1
OBIS: Sistema de Información sobre Biodiversidad Oceánica (IOC-COI-UNESCO)
La base de datos de OBIS fue obtenida desde el mapper recortando para la zona del Gran Caribe (Mar
Caribe y el Golfo de México) y del Pacífico nororiental tropical (Lat. 1.0°, 33.0°; Lon. -123.0°, -59.0°).
13
Para esta base se presentan las características y filtros de información propuestos. Al tratarse de una
Base independiente, únicamente se realizará consulta de la información. Los datos de búsqueda y
recuperados por una consulta en SIMAR serán los más relevantes en el uso de la plataforma, entre
estos “scientificName”, “decimalLongitude”, “decimalLatitude” y “eventDate”, entre otros (ver Tabla 1).
Adicionalmente, el resto de los campos podrán ser descargados completos.
Tabla 1. Campos seleccionados para su visualización inicial por búsqueda en SIMAR, uso como criterio de
búsqueda y observaciones para la base OBIS.
13 https://mapper.obis.org/?geometry=POLYGON((-123.0%2033.0,-59.0%2033.0,-59.0%201.0,-123.0%201.0,-123.0%2033.0))
21
Nombre del campo
Seleccionados para
mostrar en la capa
Uso en
consultas
Observaciones
id
x
scientificName
x
criterio de búsqueda
scientificNameAuthorship
x
eventDate
x
criterio secundario
decimalLongitude
x
decimalLatitude
x
institutionCode
collectionCode
catalogNumber
scientificNameID
originalscientificname
absence
acceptedNameUsage
x
acceptedNameUsageID
accessRights
x
ver si aplica licencia
general
aphiaID
associatedMedia
associatedOccurrences
associatedReferences
associatedSequences
associatedTaxa
basisOfRecord
behavior
bibliographicCitation
22
brackish
category
class
x
classid
collectionID
continent
coordinatePrecision
coordinateUncertaintyInMeters
country
x
Criterio
secundario
countryCode
county
dataGeneralizations
datasetID
datasetName
dataset_id
dateIdentified
date_end
date_mid
date_start
date_year
day
x
disposition
division
divisionid
dropped
dynamicProperties
endDayOfYear
establishmentMeans
eventID
eventRemarks
eventTime
family
x
criterio secundario
familyid
fieldNotes
fieldNumber
footprintSRS
footprintWKT
forma
x
formaid
genus
x
criterio secundario
genusid
geodeticDatum
23
georeferenceProtocol
georeferenceRemarks
georeferenceSources
georeferenceVerificationStatus
georeferencedBy
georeferencedDate
group
hab
habitat
x
higherClassification
higherGeography
higherGeographyID
identificationID
identificationQualifier
identificationReferences
identificationRemarks
identificationVerificationStatus
identifiedBy
individualCount
individualID
informationWithheld
infraclass
infraclassid
infrakingdom
infrakingdomid
infraorder
infraorderid
infraphylum
infraphylumid
infraspecificEpithet
institutionID
island
islandGroup
kingdom
kingdomid
language
license
lifeStage
locality
x
locationAccordingTo
locationID
locationRemarks
lowestBiostratigraphicZone
24
marine
materialSampleID
maximumDepthInMeters
maximumDistanceAboveSurfaceInMeters
maximumElevationInMeters
minimumDepthInMeters
minimumDistanceAboveSurfaceInMeters
minimumElevationInMeters
modified
month
x
municipality
nameAccordingTo
nameAccordingToID
namePublishedIn
namePublishedInID
namePublishedInYear
node_id
nomenclaturalCode
nomenclaturalStatus
occurrenceID
x
occurrenceRemarks
occurrenceStatus
order
orderid
organismID
organismName
organismQuantity
organismQuantityType
organismRemarks
organismScope
originalNameUsage
originalNameUsageID
originalScientificName
otherCatalogNumbers
ownerInstitutionCode
parentEventID
parentNameUsage
parentNameUsageID
parvorder
parvorderid
phylum
x
phylum (division)
x
phylum (division)id
25
phylumid
preparations
previousIdentifications
recordNumber
recordedBy
references
reproductiveCondition
rights
rightsHolder
sampleSizeUnit
sampleSizeValue
samplingEffort
samplingProtocol
section
sectionid
sex
species
x
speciesid
specificEpithet
startDayOfYear
stateProvince
subclass
subclassid
subdivision
subdivisionid
subfamily
subfamilyid
subforma
subformaid
subgenus
subgenusid
subkingdom
subkingdomid
suborder
suborderid
subphylum
subphylum (subdivision)
subphylum (subdivision)id
subphylumid
subsection
subsectionid
subspecies
x
subspeciesid
El proceso de consulta y visualización de la información se muestra en la Figura 1.
26
subterclass
subterclassid
subtribe
subtribeid
subvariety
subvarietyid
superclass
superclassid
superfamily
superfamilyid
superorder
superorderid
supertribe
supertribeid
taxonConceptID
taxonID
x
taxonRank
taxonRemarks
taxonomicStatus
terrestrial
tribe
tribeid
type
typeStatus
variety
x
varietyid
verbatimCoordinateSystem
verbatimCoordinates
verbatimDepth
verbatimElevation
verbatimEventDate
verbatimLatitude
verbatimLocality
verbatimLongitude
verbatimSRS
verbatimTaxonRank
vernacularName
x
waterBody
x
criterio secundario
year
x
flags
Figura. 1 Proceso para la consulta de datos de la Base de datos de OBIS.
 
27
ANEXO 1.1.2.
SNIB: Sistema Nacional de Información sobre Biodiversidad de México (CONABIO, México)
Para esta base se presentan las características y filtros de información propuestos. Al tratarse de una
Base independiente de la CONABIO, se adecuarán las consultas a los formatos que se tengan acceso.
Los datos de búsqueda y recuperados por una consulta en SIMAR serán los más relevantes en el uso
de la plataforma, entre estos “especieválida”, “latitud”, “longitud” y “fechacolecta”, entre otros (ver
Tabla 1). Adicionalmente, el resto de los campos podrán ser descargados completos
Tabla 1. Campos seleccionados para su visualización inicial por búsqueda en SIMAR, uso como criterio de
búsqueda y observaciones para la base del SNIB.
28
Nombre del campo
Seleccionados para
mostrar en la capa
Uso en consultas
grupobio
X
Criterio secundario
subgrupobio
X
Criterio secundario
familiavalida
X
Criterio secundario
generovalido
Criterio secundario
especievalida
X
Criterio búsqueda inicial
nom059
X
cites
X
iucn
X
prioritaria
X
exoticainvasora
X
longitud
X
latitud
X
estadomapa
X
municipiomapa
X
localidad
X
Criterio secundario
fechacolecta
X
Criterio secundario
anp
probablelocnodecampo
categoriaresidenciaaves
formadecrecimiento
fuente
X
taxonextinto
usvserieVI
urlejemplar
Filtrado de
valores únicos
idejemplar
X
Filtrado de
valores únicos
ultimafechaactualizacion
idnombrecatvalido
29
idnombrecat
reino
phylumdivision
clase
orden
familia
genero
especie
calificadordeterminacion
categoriainfraespecie
categoriainfraespecie2
autor
estatustax
reftax
taxonvalidado
reinovalido
phylumdivisionvalido
X
clasevalida
X
ordenvalido
X
categoriainfraespecievalida
X
categoriainfraespecie2valida
autorvalido
X
reftaxvalido
nombrecomun
X
ambiente
X
Campo de
pre-filtrado
validacionambiente
x
Campo de
-prefiltrado
endemismo
nivelprioridad
region
x
datum
geovalidacion
paismapa
claveestadomapa
mt24claveestadomapa
mt24nombreestadomapa
clavemunicipiomapa
mt24clavemunicipiomapa
mt24nombremunicipiomapa
incertidumbreXY
altitudmapa
x
usvserieI
30
usvserieII
usvserieIII
usvserieIV
usvserieV
coleccion
institucion
paiscoleccion
numcatalogo
numcolecta
procedenciaejemplar
determinador
fechadeterminacion
diadeterminacion
mesdeterminacion
aniodeterminacion
colector
diacolecta
Criterio
secundario
mescolecta
Criterio
secundario
aniocolecta
Criterio
secundario
tipo
ejemplarfosil
proyecto
formadecitar
licenciauso
x
urlproyecto
urlorigen
obsusoinfo
version
idestadomapa
idmunicipiomapa
mt24idestadomapa
mt24idmunicipiomapa
idanpfederal1
idanpfederal2
especievalidabusqueda
comentarioscat
comentarioscatvalido
homonimosgenero
homonimosespecie
homonimosinfraespecie
Debido al tamaño de la base de datos, se deberá ejecutar una consulta de agrupado para mostrar únicamente      
registros únicos. Para ello, se deben tomar en cuenta los campos: “urlejemplar” y “idejemplar” ya que son
índices con valores únicos. En este proceso se debe tomar en cuenta que algunos datos presentan valores
idénticos excepto por el número de catálogo campo “numcatalogo” o el número de colecta campo
“numcolecta”. Diferencias en dicho valor podrían indicar copias o respaldos reales de ejemplares de colecta en
el mismo sitio, y no propiamente un registro duplicado. Se recomienda posterior al agrupamiento recuperar los
campos de urlejemplar” y “idejemplar” para que los usuarios recuperen los datos de forma apropiada.
El proceso de consulta y visualización de la información se muestra en la Figura 1.
Figura. 1. Proceso para la consulta de datos de la Base de datos de SNIB.
 
31
homonimosgenerocatvalido
homonimosespeciecatvalido
homonimosinfraespeciecatvalido
categoriataxonomica
ANEXO 1.1.3.
Especies-COBI-TNC: Base de datos de especies marinas prioritarias para la conservación en
el Golfo de California y costa occidental de Baja California Sur (COBI-TNC, México)
La base fue generada en el proyecto y publicación Planeación ecorregional para la conservación
marina: Golfo de California y costa Occidental de Baja california sur . Consiste en la compilación de
14
información sobre especies y su distribución espacial obtenida a partir de archivos Excel y csv. Tabla
1.
La base de datos consiste en dos tablas relacionadas. La primera nombrada “bd_espacial_cobi” que
incluye el total de registros de especies combinados de 55,254 (Tabla 1). La segunda nombrada         
“catalog_taxon_cobi” (Tabla 2) incluye un catálogo taxonómico con los nombres actualizados de
acuerdo con los catálogos de la CONABIO . Ambas bases se relacionan de la siguiente manera:    
15
bd_espacial_cobi.id_taxonomia= catalog_taxon_cobi.id (Fig. 1)
Debido a la complejidad y heterogeneidad de las tablas originales, los datos no fueron normalizados.
Sin embargo, se procedió a limpiar la información en medida de lo posible haciendo particular énfasis
en las coordenadas y las fechas. Para un intervalo de tiempo, únicamente se mantuvo el campo “año”
y se generó el campo “año_fin” para colocar el año de término. Algunos comentarios a la fecha fueron
añadidos en el nuevo campo “comentarios_fecha”.
14 Ulloa, R., J. Torre, L. Bourillón, A. Gondor y N. Alcantar. 2006. Planeación ecorregional para la conservación marina: Golfo de California y
costa occidental de Baja California Sur. Informe final a The Nature Conservancy. Guaymas (México): Comunidad y Biodiversidad, A.C., 153
pp.
15 CONABIO (comp.) 2021. Catálogo de autoridades taxonómicas de especies de flora y fauna con distribución en México. Base de datos
SNIB-CONABIO, México.
32
Tabla 1. Listado de archivos utilizados para la
base de datos
Nombre de los archivos
BD_ESPACIAL_Algas.xls
BD_ESPACIAL_Aves.xls
BD_ESPACIAL_Cetaceos.xls
BD_ESPACIAL_Coral.xls
BD_ESPACIAL_Lobo_Marino.xls
BD_ESPACIAL_Pastos_Marinos.xls
BD_ESPACIAL_Peces.xls
BD_ESPACIAL_Tiburon.xls
Nidos_aves.csv
Nidos_tortugas.csv
Figura 1. bd_espacial_cobi.id_taxonomia= catalog_taxon_cobi.id
Adicionalmente, y con la finalidad de dar un mejor uso a la información, se procedió a validar los     
nombres de acuerdo con el catálogo de autoridades taxonómicas de CONABIO (ver arriba). A pesar de       
la validación, algunos taxones reportados en los datos de origen presentaron problemas en su
confirmación. En total se encontraron 1576 nombres taxonómicos de los cuales 1407 fueron    
confirmados; 2 interpretados de acuerdo con el nombre y posición taxonómica; 132 validados a una
categoría taxonómica superior; 15 correspondientes a variedades y subespecies típicas; y 20 que no    
fue posible encontrar el nombre y posición taxonómica.
A partir de esta revisión, se sugiere utilizar los datos ecológicos y geográficos de la tabla original
“bd_espacial_cobi” pero realizando la búsqueda taxonómica a partir de la tabla “catalog_taxon_cobi”.
Otros campos como categorías de la NOM, Prioritarias, Invasoras y Cites vienen actualizadas en la
tabla taxonómica y se recomienda su uso sobre la tabla original.
Criterios de búsqueda
Para una visualización inicial y debido a la calidad de los datos, se propone únicamente utilizar los
campos “principales” latitud, longitud, dia, mes, año, local y refern de la tabla bd_espacial_cobi, y los
campos idcat, Ultimacategoriataxonomica, nombrecientifico, autortaxon, divisionphylum, clase, orden,
33
familia, estatus, cites, iucn, nom059, prioritarias, nombrecomun de la tabla catalog_taxon_cobi (ver
Cuadro 1). Adicionalmente, se propone filtrar y no incluir los registros que no forman parte de la
CONABIO y con potencial de mostrarse en otras bases. Es posible incluir una consulta que permita la
visualización y descarga de todos los campos de ambas tablas a petición del usuario.
Cuadro 1. Campos principales.
Para esta base la búsqueda puede iniciarse a partir de tres vías: 1) nombre científico validado (tabla
catalog_taxon_cobi.nombrecientifico); 2) espacialmente por coordenadas; y 3) registros completos.
Posteriormente, y dependiendo del uso, se pueden incluir otros criterios como fuente
(bd_espacial_cobi.refern) u otro campo. Filtros y ordenamiento secundario pueden realizarse a través
de los campos mencionados anteriormente como “principales”.
Tabla 1. Tabla en base de datos bd_espacial_cobi
34
Posició
n
ordinal
Nombre de la
columna
Tipo
de
dato
Tamaño
de la
columna
Notas
Autoincrement
o
Valores
nulos
1
fid
int4
10
(null)
NO
SI
2
id_taxonomia
int4
10
(null)
NO
NO
3
id_reg
int4
10
(null)
NO
SI
4
code_gral
int4
10
(null)
NO
SI
5
zsp1
int4
10
Identificador de
especie
NO
SI
6
select
varch
ar
4
Identificador como
objeto de
conservación
NO
SI
7
clase_original
varch
ar
20
Taxonómica
NO
SI
8
orden_original
varch
ar
25
Taxonómica
NO
SI
9
familia_original
varch
ar
25
Taxonómica
NO
SI
10
genero_original
varch
ar
25
Taxonómica
NO
SI
11
especie_original
varch
ar
50
Taxonómica
NO
SI
12
variedad_subespecie_
original
varch
ar
25
Taxonómica
NO
SI
13
nom_cien_original
varch
ar
75
Taxonómica
NO
NO
14
sino_nom_original
varch
ar
255
Sinonímia (si aplica)
NO
SI
15
abrev_original
varch
ar
7
Abreviación (6
caracteres, 3 de
NO
SI
35
género y 3 de
especie)
16
aut_anios_original
varch
ar
100
Autor y año
NO
SI
17
nom_com_es
varch
ar
150
Nombre común en
español
NO
SI
18
nom_com_in
varch
ar
150
Nombre común en
inglés
NO
SI
19
latitud
float8
17
Posición geográfica
(grados)
NO
SI
20
longitud
float8
17
Posición geográfica
(grados)
NO
SI
21
x_coord
float8
17
Posición geográfica
(cónica
transformada de
Lambert)
NO
SI
22
y_coord
float8
17
Posición geográfica
(cónica
transformada de
Lambert)
NO
SI
23
dia
int4
10
Fecha del registro
NO
SI
24
mes
int4
10
Fecha del registro
NO
SI
25
año
int4
10
Fecha del registro
NO
SI
26
año_fin
int4
10
Fecha del registro.
Dato interpretado
desde la Base de
datos
NO
SI
27
comentarios_fecha
varch
ar
150
Comentarios
añadidos a la fecha
durante revisión
NO
SI
28
no_indv_u
varch
ar
150
Número de individuos
(Si aplica)
NO
SI
29
no_nidos
varch
ar
150
número de nidos (Si
aplica)
NO
SI
30
frecuencia
varch
ar
150
Frecuencia de
observación (Si
aplica)
NO
SI
31
local
varch
ar
255
Localidad
NO
SI
32
clas_local
varch
ar
255
Clasificación de la
localidad (Si aplica)
NO
SI
33
iucn_original
varch
ar
50
Categoría (si aplica)
NO
SI
34
cites_original
varch
ar
50
Categoría (si aplica)
NO
SI
35
nom_059_original
varch
ar
20
Categoría (si aplica)
NO
SI
36
natureserve
varch
ar
20
Categoría (si aplica)
NO
SI
37
afs
varch
ar
20
Categoría (si aplica)
NO
SI
38
endemica
int4
10
Categoría (si aplica)
NO
SI
39
const_habitat
int4
10
Categoría (si aplica)
NO
SI
Tabla 2. Tabla de Base de datos catalog_taxon_cobi.
36
40
paraguas
int4
10
Categoría (si aplica)
NO
SI
41
esp_clave
int4
10
Categoría (si aplica)
NO
SI
42
migratorias
int4
10
Categoría (si aplica)
NO
SI
43
especif_habitat
int4
10
Categoría (si aplica)
NO
SI
44
esp_emblematica
int4
10
Categoría (si aplica)
NO
SI
45
gra_amenaza
int4
10
Categoría (si aplica)
NO
SI
46
distrib
varch
ar
100
Tipo de distribución
NO
SI
47
habitat
varch
ar
150
Tipo de hábitat
NO
SI
48
estac
varch
ar
100
estacionalidad
NO
SI
49
invest
text
21474836
47
Nombre del
investigador
propietario del
registro
NO
SI
50
refern
text
21474836
47
referencia
bibliográfica del
registro (si aplica)
NO
SI
51
restri
varch
ar
50
restricciones del
registro (si aplica)
NO
SI
52
perm_gc
varch
ar
150
Permanencia dentro
de la ecorregión
NO
SI
53
epc_repr
varch
ar
50
Época reproductiva
NO
SI
54
rev_por
text
21474836
47
Revisor
NO
SI
55
coment
text
21474836
47
Comentarios (si
aplica)
NO
SI
56
id_regi
int4
10
(null)
NO
SI
57
id_marxan
int4
10
(null)
NO
SI
58
tabla_origen
varch
ar
30
origen de los datos
NO
NO
59
id
serial
10
(null)
YES
NO
Posición
ordinal
Nombre de la
columna
Tipo
del
campo
Tamaño
de la
columna
Notas
Autoincrement
o
Valores
Nulos
1
id
serial
10
identificador de la
tabla
SI
NO
2
idcat
varchar
20
identificador de
catalogos
NO
SI
3
id_valido
int4
10
id del nombre válido
NO
SI
4
idcatvalido
varchar
20
identificador del
nombre válido de
catálgos
NO
SI
5
ultimacategoriataxon
omica
varchar
20
categoría taxonómica
del nombre
NO
SI
37
6
nombrecientifico
varchar
45
nombre científico de
acuerdo a catálogos
NO
SI
7
autortaxon
varchar
100
autoridad taxonómica
del nombre
NO
SI
8
reino
varchar
30
nombre del reino
NO
SI
9
divisionphylum
varchar
30
nombre de la división
o el phylum
NO
SI
10
clase
varchar
30
nombre de la clase
NO
SI
11
orden
varchar
30
nombre del orden
NO
SI
12
familia
varchar
30
nombre de la familia
NO
SI
13
genero
varchar
30
nombre del género
NO
SI
14
especie_epiteto
varchar
30
nombre del epíteto
específico
NO
SI
15
categinfra
varchar
30
nombre de la
categoría subespecie,
variedad o forma
correspondiente
NO
SI
16
nombreinfra
varchar
30
nombre de la
subespecie, variedad
o forma
NO
SI
17
estatus
varchar
75
estatus taxonómico
del nombre
NO
SI
18
cites
varchar
20
categoría de la
especies de acuerdo a
cites
NO
SI
19
observacioncites
text
2147483
647
observaciones a la
categoría cites
asignada
NO
SI
20
iucn
varchar
100
categoría de la
especie de acuerdo a
IUCN
NO
SI
21
observacioniucn
text
2147483
647
observaciones a la
categoría IUCN
NO
SI
22
nom059
varchar
100
categoría de la
especie de acuerdo a
la MOM 059
NO
SI
23
observacionnom
text
2147483
647
observaciones a la
categoría nom 059
NO
SI
24
prioritarias
varchar
20
categoría de la
especie de acuerdo a
su carácter prioritario
NO
SI
25
nivelprioritarias
varchar
20
nivel de prioridad de la
especie
NO
SI
26
observacionprioritari
as
text
2147483
647
observaciones a la
categoría de prioridad
NO
SI
27
invasoras
varchar
20
especie catalogada
como invasora
NO
SI
28
endemismo
varchar
20
nivel de endemismo
NO
SI
29
nombrecomun
varchar
150
nombres comunes
asociados a la
especie
NO
SI
ANEXO 1.1.4.
Pesquerías-FAO: Estadística de la Producción Mundial Pesquera (1950-2018) (FAO)
Características
La base fue cargada a Postgresql sin modificaciones mayores. En este caso, se utilizó el archivo
“GlobalProduction_2020.1.0.zip” descargable del sitio web . El archivo contiene tablas
16
independientes relacionadas por índices y documentación relacionada a su uso . Al utilizar la
17
información se deberá citar la base de forma adecuada ,.
18 19
La base consiste en siete tablas en un modelo relacional (Fig. 1):
cl_ci_unit. Que contiene un catálogo de unidades de muestra (peso, volumen, costos, etc.;    
Tabla 1)
cl_fi_country_groups. Que es un catálogo de países con sus respectivos nombres en diferentes
idiomas, continente y regiones geográficas a las que pertenece (Tabla 2).
cl_fi_production_source. Corresponde a un catálogo de origen del recurso pesquero (Tabla 3).
cl_fi_species_groups. Contiene un catálogo de especies con nombre científico y nombre
común (Tabla 4).
cl_fi_symbol. Es un identificador general del producto registrado (Tabla 5).
cl_waterarea_groups. Contiene un catálogo de regiones marinas (Tabla 6).
st_fi_production. Es la tabla principal que contiene los registros pesqueros y las llaves
foráneas de cada catálogo (Tabla 7).
La base contiene registros pesqueros a nivel mundial 1,075,870 registros, de los cuales, 11,817
corresponden a México.
16 FAO. 2020. Fishery and Aquaculture Statistics. Global production by production source 1950-2018 (FishstatJ). In: FAO Fisheries and
Aquaculture Department [online]. Rome. Updated 2020. www.fao.org/fishery/statistics/software/fishstatj/en
17 http://www.fao.org/contact-us/terms/db-terms-of-use/en/
18 FAO. 2020. Fishery and Aquaculture Statistics. Global production by production source 1950-2018 (FishstatJ). In: FAO Fisheries and
Aquaculture Department [online]. Rome. Updated 2020. www.fao.org/fishery/statistics/software/fishstatj/en
19 "FAO.[NAME OF DATABASE]. License: CC BY–NC–SA 3.0 IGO. Extracted from: [insert URL of database]. Data of Access: [insert date that
the dataset was accessed in the following format DD–MM–YEAR]."
38
Figura. 1 Relaciones de las tablas FAO.
39
Criterios de búsqueda
Para la consulta general de la información se generó una consulta sql que recupera la información
con sus campos relacionados (Cuadro 1).
Cuadro 1. Modo de consultar la información.
Dentro de cada catálogo se recuperó el nombre en español para su mejor interpretación. Es necesario    
en la consulta condicionar la búsqueda inicialmente a áreas de interés o países dentro de SIMAR y
descartar la información adicional.
La búsqueda de información puede realizarse por cuatro vías iniciales distintas. 1) Nombre científico
de la especie; 2) Nombre del área marina; 3) País; 4) todos los registros. Un criterio secundario es el
año del registro. El resto de los campos se mostrarán y descargarán para análisis y fines informativos    
Fig. 2.
Figura. 2. Proceso para la consulta de datos de la Base de datos de FAO.
Al no contar con coordenadas para la visualización, la búsqueda desde un criterio espacial deberá
ajustarse a los países o áreas predefinidas.
40
41
Tabla 1. cl_ci_unit
Posición
Ordinal
Nombre de
columna
Tipo de
campo
Tamaño
columna
Notas
Autoincrement
o
Valores
nulos
1
id
int2
5
identificador
autonumérico de la
tabla
SI
NO
2
code
varchar
3
código de la unidad
NO
NO
3
name_en
varchar
30
nombre de la unidad
en inglés
NO
NO
4
name_fr
varchar
30
nombre de la unidad
en
NO
NO
5
name_es
varchar
30
nombre de la unidad
en
NO
NO
Tabla2. cl_fi_country_groups
Posición
Ordinal
Nombre de
columna
Tipo de
campo
Tamaño
columna
Notas
Autoincrement
o
Valores
nulos
1
id
int2
5
identificador de la
tabla
SI
NO
2
un_code
varchar
4
código del país según
Naciones Unidas
NO
NO
3
identifier
int4
10
identificador
NO
NO
4
iso2_code
varchar
2
código del país iso de
dos letras
NO
SI
5
iso3_code
varchar
3
código del país iso de
tresletras
NO
SI
6
name_en
varchar
50
nombre en inglés del
país
NO
SI
7
name_fr
varchar
50
nombre en francés
del país
NO
SI
8
name_es
varchar
50
nombre en español
del país
NO
SI
9
name_ar
varchar
50
nombre en árabe del
país
NO
SI
10
name_cn
varchar
50
nombre en chino del
país
NO
SI
11
name_ru
varchar
80
nombre en ruso del
país
NO
SI
12
official_name_e
n
varchar
100
nombre oficial del
país en inglés
NO
SI
13
official_name_fr
varchar
100
nombre oficial del
país en francés
NO
SI
14
official_name_e
s
varchar
100
nombre oficial del
país en español
NO
SI
15
official_name_ar
varchar
100
nombre oficial del
país en árabe
NO
SI
16
official_name_c
n
varchar
100
nombre oficial del
país en chino
NO
SI
17
official_name_ru
varchar
100
nombre oficial del
país en ruso
NO
SI
42
18
continent_group
varchar
50
continente al que
pertenece el país
NO
SI
19
ecoclass_group
varchar
50
clasificación
económica del país
NO
SI
20
georegion_group
varchar
50
región geográfica del
país
NO
SI
Tabla 3. cl_fi_production_source
Posición
Ordinal
Nombre de
columna
Tipo de
campo
Tamaño
columna
Notas
Autoincrement
o
Valores
nulos
1
identifier
int2
5
Identificador de la
tabla
SI
NO
2
code
varchar
20
referido al nombre
estandarizado
ocupado para la
fuente de producción
NO
NO
3
name_en
varchar
50
nombre en inglés del
origen de la
producción
NO
NO
4
name_fr
varchar
50
nombre en francés
del origen de la
producción
NO
NO
5
name_es
varchar
50
nombre en español
del origen de la
producción
NO
NO
Tabla 4. cl_fi_species_groups
Posición
Ordinal
Nombre de
columna
Tipo de
campo
Tamaño
columna
Notas
Autoincrement
o
Valores
nulos
1
id
serial
10
identificador de la
tabla
SI
NO
2
3alpha_code
varchar
3
código
alphanumérico de
tres letras de la
especie
NO
NO
3
taxonomic_code
varchar
15
Código taxonómico
de la especie.
NO
NO
4
identifier
varchar
10
(null)
NO
NO
5
name_en
varchar
100
nombre de especies o
grupos en inglés
NO
SI
6
name_es
varchar
100
nombre de la especie
o grupos en español
NO
SI
7
name_ar
varchar
100
nombre de la especie
o grupos en árabe
NO
SI
8
name_cn
varchar
100
nombre de la especie
o grupos en chino
NO
SI
9
name_ru
varchar
100
nombre de la especie
o grupos en ruso
NO
SI
10
scientific_name
varchar
40
(null)
NO
NO
11
author
varchar
150
(null)
NO
SI
12
family
varchar
40
(null)
NO
SI
13
order
varchar
40
(null)
NO
NO
43
14
major_group
varchar
50
(null)
NO
NO
15
yearbook_group
varchar
40
(null)
NO
SI
16
isscaap_group
varchar
40
(null)
NO
SI
17
cpc_class
text
2147483647
(null)
NO
SI
18
cpc_group
text
2147483647
(null)
NO
SI
19
name_fr
varchar
100
nombre de la especie
o grupo en francés
NO
SI
Tabla5. cl_fi_symbol
Posición
Ordinal
Nombre de
columna
Tipo de
campo
Tamaño
columna
Notas
Autoincrement
o
Valores
nulos
1
code
int2
5
identificador de la
tabla
SI
NO
2
symbol
varchar
2
simbología
NO
NO
3
name
varchar
15
nombre del atributo
NO
NO
4
description
text
2147483647
descripción del
significado del
símbolo respecto a la
prodcucción
NO
SI
Tabla6. cl_waterarea_groups
Posición
Ordinal
Nombre de
columna
Tipo de
campo
Tamaño
columna
Notas
Autoincrement
o
Valores
nulos
1
id
int2
5
identificador de la
tabla
SI
NO
2
code
varchar
2
código estandarizado
del área
NO
NO
3
name_en
varchar
50
nombre en inglés del
área
NO
NO
4
name_fr
varchar
50
nombre en francés
del área
NO
NO
5
name_es
varchar
50
nombre en español
del área
NO
NO
6
ocean_group
varchar
40
grupo oceánico a la
que pertenece el área
NO
SI
7
inlandmarine
varchar
8
(null)
NO
NO
8
faregion_group
varchar
20
(null)
NO
SI
Tabla7. st_fi_production
Posición
Ordinal
Nombre de
columna
Tipo de
campo
Tamaño
columna
Notas
Autoincrement
o
Valores
nulos
1
id
bigserial
19
identificador de
registros de la tabla
SI
NO
2
country_id
int4
10
llave foránea del país
NO
NO
3
area_id
int4
10
llave foránea del área
NO
NO
4
source
int4
10
llave foránea de la
fuente del recurso
NO
NO
 
44
5
species_id
int4
10
llave foránea de la
especie o grupo
NO
NO
6
unit_id
int4
10
llave foránea de la
unidad de captura o
cultivo
NO
NO
7
quantity
float8
17
cantidad del recurso
NO
NO
8
symbol
varchar
2
simbología
complementaria
NO
SI
9
symbol_id
int4
10
id de la simbología
complementaria
NO
SI
10
year
int4
10
año de captura de
registro
NO
NO
ANEXO 1.1.5.
Pesquerías-CONAPESCA: Registros de la Producción Pesquera y Acuícola de México
(2006-2014) (CONAPESCA, México)
Características
Se proporcionaron dos fuentes de datos, una a nivel estatal (listado de archivos en Tabla 1) y otro a
nivel municipal y oficinas (listado de archivos en Tabla 2). A partir de estos datos se generó una base
de datos que contiene conjuntos de información independiente excepto por el catálogo de estados de      
la República mexicana, tabla “prod_pesc_ent_fed”.
Los datos del listado a nivel estatal fueron capturados directamente en la tabla
“prod_estados_pesquerias”. Por otra parte, los datos de pesca a nivel de oficinas fue normalizado y
capturado en las tablas: prod_pesc_ent_fed, que contiene el catálogo de estados de la república;     
prod_pesc_nombre_com, que contiene el catálogo de los nombres comunes de las especies con un
total de 699 registros; prod_pesc_nombre_principal, que contiene el catálogo de nombres
principalmente usados para el producto pesquero, 58 registros; prod_pesc_oficinas, que corresponde
al catálogo de oficinas en las que se registra la captura, 161 registros; prod_pesc_origen, origen del
producto pesquero ya sea capturado o cultivo; prod_pesc_mes, que corresponde al catálogo de
meses del año; y finalmente producción_pesquera_anual, que corresponde a la tabla principal en
donde se registran los datos de pesca (monto, características, costos, etc) con un total de 416,580
registros combinados (características en Tablas 3-10).
45
Tabla 1. Listado de archivos usados para la construcción de la base    
de datos pesqueros por estado.
produccion_estado_2011.xls
produccion_estado_2012.xls
produccion_estado_2013.xls
produccion_estado_2014.xls
produccion_estado_2015.xls
produccion_estado_2016.xls
produccion_estado_2017.xls
produccion_estado_2018.xls
Tabla 2. Listado de archivos usados para la construcción de la base    
de datos pesqueros por municipios y secretarías.
Produccion_Pesquera_2006.csv
Produccion_Pesquera_2007.csv
Produccion_Pesquera_2008.csv
Produccion_Pesquera_2009.csv
Produccion_Pesquera_2010.csv
Produccion_Pesquera_2011.csv
Produccion_Pesquera_2012.CSV
Produccion_Pesquera_2013.csv
Produccion_Pesquera_2014.csv
La tabla “prod_estados_pesquerias” se relaciona con “prod_pesc_ent_fed” (relación de los campos
“entidad_federativa_id”=“id_tabla”, respectivamente) para recuperar el nombre único y completo de la
entidad federativa, así como otras relaciones (Fig. 1). Por otro lado, la tabla
“producción_pesquera_anual” se relaciona con las otras tablas de la base de datos para recuperar la
información completa.
De la integración de la información únicamente se homologaron los datos correspondientes a las
oficinas de registro. Esto debido a que se encontraron variantes en el nombre de las oficinas con una
misma clave. Se utilizó para la homologación el nombre con mayor uso. Se debe tomar en
consideración que los datos pesqueros no presentan nombres científicos que permitan recuperar con
precisión el taxón real objeto de captura o cultivo. Los nombres comunes utilizados pueden
representar a más de una especie. Finalmente, se requieren los datos espaciales (coordenadas) que
permitan localizar de forma adecuada la posición geográfica de las oficinas de registro pesquero. (en
proceso).
Criterios de búsqueda
Para la base de datos con datos a nivel nacional (prod_estados_pesquerias) la búsqueda de
información puede realizarse a través del campo de entidad federativa. Criterios secundarios son año
y origen del producto pesquero.
Por otra parte, para la búsqueda de datos a nivel estatal y oficina (producción_pesquera_anual), la    
búsqueda de información puede realizarse a través de tres vías. 1) nombre común   
(prod_pesc_nombre_com); 2) oficina (prod_pesc_oficinas); y 3) entidad federativa
(prod_pesc_ent_fed). Un cuarto criterio será espacial, al concluir la georreferenciación de las oficinas.
Criterios secundarios son año y origen.
46
Figura. 1 Relaciones de las tablas de la base CONAPESCA.
Tabla 3. Tabla prod_estados_pesquerias
47
Posición
ordinal
nombre de la
columna
Tipo
de
campo
Tamaño
de la
columna
Notas
Autoincrement
o
valores
nulos
1
id_tabla
bigseri
al
19
Identificador de la
tabla
SI
NO
2
endidad_federativa_i
d
int4
10
llave foránea de la
entidad federativa
NO
NO
3
peso_vivo_ton
float8
17
peso capturado o
producido vivo
NO
SI
4
peso_desembarcado
_ton
float8
17
peso capturado o
producido al
desembarcar
NO
NO
5
precio_peso_por_kg
float8
17
Precio en peso sobre
kilogramo
NO
SI
6
valor_produccion_mil
espesos
float8
17
valor de la producción
o pesca en miles de
pesos
NO
NO
7
anio
int4
10
Año de corte
NO
NO
Tabla 4. Tabla prod_pesc_ent_fed
Tabla 5. Tabla prod_pesc_nombre_com
Tabla 6. Tabla prod_pesc_nombre_principal
48
8
origen
int4
10
origen de la
producción
NO
SI
9
documento_orginal
text
2147483
647
documento de origen
de los datos
NO
SI
10
observaciones
text
2147483
647
observaciones
NO
SI
Posición
ordinal
nombre de la
columna
Tipo
de
campo
Tamañ
o de la
column
a
Notas
Autoincrement
o
valores
nulos
1
id_tabla
serial
10
identificador serial de la
tabla
SI
NO
2
entidad_federativa
varcha
r
30
Nombre de la entidad
federativa de México
NO
NO
3
escritura_alternativa
varcha
r
30
Escritura alternativa de
la entidad federativa
NO
SI
4
observaciones
varcha
r
255
Observaciones o
comentarios
NO
SI
5
clave_de_entidad
int4
10
Clave única de la
entidad federativa
NO
NO
Posició
n
ordinal
nombre de la
columna
Tipo de
campo
Tamaño
de la
columna
Notas
Autoincr
emento
valores
nulos
IS_NULLA
BLE
1
id_tabla_nombre
_com
serial
10
Identificador de la
tabla nombre
común
10
SI
NO
2
nombre_comun
varchar
35
nombre común del
organismo
capturado o
cultivado
35
NO
NO
3
comentarios
text
21474836
47
comentarios
asociados al
nombre común
214748
3647
NO
SI
Posición
ordinal
nombre de
la columna
Tipo de campo
Notas
Autoincre
mento
valores
nulos
id_tabla_nombr
e_principal
serial
10
Identificador de la tabla
SI
NO
nombre_princip
al
varchar
35
nombre principal del
recurso pesquero
NO
NO
observaciones
text
2147483647
observaciones al nombre
principal
NO
SI
Tabla 7. Tabla prod_pesc_oficinas
Tabla 8. Tabla prod_pesc_origen
Tabla 9. Tabla prod_pesca_mes
Tabla 10. Tabla produccion_pesquera_anual
49
Posició
n
ordinal
nombre de la
columna
Tipo de
campo
Tamaño de la
columna
Notas
Autoincr
emento
valores
nulos
1
nombre_oficin
a
varchar
35
nombre de la oficina de
registro
NO
NO
2
clave_oficina
int4
10
clave única de la oficina
NO
NO
3
otros_nombre
s_oficina
varchar
50
Nombres alternativos de la
oficina que poseen el
mismo número de clave
NO
SI
Posición
ordinal
nombre de la
columna
Tipo de
campo
Tamaño de
la columna
Notas
Autoincrement
o
valores
nulos
1
id_tabla_orige
n
int2
5
Identificador de la
tabla origen
SI
NO
2
origen
varchar
15
Origen del producto
pesquero
NO
NO
3
observacione
s
text
2147483647
observaciones
NO
SI
Posición
ordinal
nombre de la
columna
Tipo de
campo
Tamaño de
la columna
Notas
Autoincremento
valores
nulos
1
id_tabla_mes
int2
5
Identificador de la
tabla
SI
NO
2
mes
varchar
12
mes de corte
NO
NO
3
observacione
s
text
2147483647
observaciones
NO
SI
Posición
ordinal
nombre de la
columna
Tipo de
campo
tamaño de
la columna
Notas
Autoincremento
Valores
nulos
1
id_tabla_produc
cion_pesquera
bigserial
19
Identificador de la
tabla
SI
NO
2
anio_ejercicio_fi
scal
int4
10
Año del ejercicio
fiscal
NO
NO
3
mes_corte_id
int4
10
Llave foránea al mes
de corte
NO
NO
4
origen_id
int4
10
llave foránea al origen
del recurso
NO
NO
5
nombre_comun_
id
int4
10
llave foránea al
nombre común
NO
NO
6
peseo_desemba
rcado_kilogramo
s
float8
17
peso del recurso
desembarcado
cuantificado en
kilogramos
NO
NO
7
peso_vivo_kilogr
amos
float8
17
peso vivo del recurso
estimado en
kilogramos
NO
NO
50
8
valor_pesos
float8
17
valor en pesos del
recurso pesquero
obtenido
NO
NO
9
nombre_principa
l_id
int4
10
llave foránea del
nombre principal
NO
NO
10
clave_entidad
int4
10
llave foránea de la
entidad federativa de
dónde se obtuvo el
recurso pesquero
NO
NO
11
clave_oficina
int4
10
llave foránea de la
oficina en donde se
realizó el registro
NO
NO
12
observaciones
text
2147483647
observaciones y
comentarios
NO
SI
13
documento_origi
nal
varchar
40
documento de origen
de los registros
NO
SI
ANEXO 1.1.6.
Manual de consulta de bases de datos en SIMAR
Endpoints de base de datos
URL de OBIS:
51
Base de
datos
Descripción de
consulta
Tipo
Inputs
Outputs
OBIS
Consulta de
catálogos de
países
GET
OBIS
Consulta de
especies por
países, de tal
forma que
regresa
agrupado por
especie
disponible en
cada pais.
GET
/<cadena>/<nombre_especie>
/obis/paisespecie/<pais>/<especie
>/<int:numregs>/<int:segretorna>
ej:
/obis/paisespecie/USA/Aptos/5/1
País(cadena),
Nombre de especie (cadena),
Número de registros a devolver
(entero),
Segmento a devolver (“página”
entero )
{
"success": true,
"results": [
{
"scientific_name":
String,
"taxon_id": Int,
},
{
....
},
],
"total": 7500
}
OBIS
Consulta de una
especie por
país, esta
consulta debe
arrojar todos
los registros de
una especie en
un país
determinado
GET
/obis/paistaxon/<pais>/<taxon>/<in
t:numregs>/<int:segretorna>

País(cadena),
Taxon (cadena)
{
"success": true,
"results": [
{
"id": Int,
"locality": String,
"phylum": String,
"scientific_name":
String,
"species": String,
"taxon_id": String,
"latitude": Float,
"longitude": Float,
},
{
....
},
],
"total": 123
}
SNIB
Consulta de
catálogos de
GET
/snib/paises
{
"results": [
 
52
países
{
"id": "string",
"pais": "string"
},
],
"total": 123
}
SNIB
Consulta de
especies por
países, de tal
forma que
regresa
agrupado por
especie
disponible en
cada país.
GET
/snib/paisespecie/<pais>/<especie
>/<int:tam>/<int:pag>/
País(cadena),
Nombre de especie (cadena),
Número de registros a devolver
(entero),
Segmento a devolver (“página”
entero )
{
"results": [
{
 "scientificname":
"string",
"taxonID": "string"
},
{
 ...
},
... 
],
"total": 123
}
SNIB
Consulta de una
especie por
país, esta
consulta debe
arrojar todos
los registros de
una especie en
un país
determinado
GET
/snib/paistaxon/<pais>/<taxon>/
País(cadena),
Taxon (cadena)
{
"results": [
{
"id": int,
"latitude": "string",
"locality": "string",
"longitude": "string",
"phylum": "string",
 "scientificname":
"string",
"species": "",
"taxon_id": "string"
},
{
 ...
}
...
],
"total": 2
}
ANEXO 1.1.7.
Zonas de alta distribución de especies de importancia conservacionista y comercial en la
ecorregión Golfo de California - 2017. Se enumeran las áreas de distribución de las
especies; las cuales se incluirán como parte del servicio de información geoespacial
(GEOdat) dentro de SIMAR.
1. Distribución de los polígonos de mayores   
concentraciones de tortugas
2. Distribución de los polígonos de mayores   
concentraciones de cetáceos
3. Distribución de los polígonos de mayores   
concentraciones de aves marinas
4. Distribución de las áreas de importancia
biológica (AIB) de invertebrados
5. Distribución de los registros de murciélago
pescador (Myotis vivesi)
6. Distribución de la especie abudef trosch
7. Distribución de la especie acanth planci
8. Distribución de la especie alphes immacu
9. Distribución de la especie amphia insign
10. Distribución de la especie anisot davids
11. Distribución de la especie anisot interr
12. Distribución de la especie anthop dowii
13. Distribución de la especie antipat galap
14. Distribución de la especie apogon retros
15. Distribución de la especie arbaci stella
16. Distribución de la especie arca mutabili
17. Distribución de la especie arca pacifica
18. Distribución de la especie argope ventri
19. Distribución de la especie astero carini
20. Distribución de la especie astran cortez
21. Distribución de la especie astran costat
22. Distribución de la especie astran haimei
23. Distribución de la especie astrod panam
24. Distribución de la especie atract nobili
25. Distribución de la especie atrina maura
26. Distribución de la especie atrina tuberc
27. Distribución de la especie balano cedros
28. Distribución de la especie balist polyle
29. Distribución de la especie bodian diplot
30. Distribución de la especie calamu brachy
31. Distribución de la especie calline arcua
32. Distribución de la especie calline belli
33. Distribución de la especie caranx melamp
34. Distribución de la especie carcha leucas
35. Distribución de la especie carcha limbat
36. Distribución de la especie carcha obscur
37. Distribución de la especie caryop diome
38. Distribución de la especie caulol affini
39. Distribución de la especie caulol prince
40. Distribución de la especie centros coron
41. Distribución de la especie cephal paname
42. Distribución de la especie cerato franci
43. Distribución de la especie chaeto humera
44. Distribución de la especie chaeto zonatu
45. Distribución de la especie chama buddi
46. Distribución de la especie chama frondo
47. Distribución de la especie chama sordid
48. Distribución de la especie chromi atrilo
49. Distribución de la especie chromi limbau
50. Distribución de la especie cirrhi oxycep
51. Distribución de la especie cirrhi rivula
52. Distribución de la especie coenoc bower
53. Distribución de la especie coryph hippur
54. Distribución de la especie cyclos curva
55. Distribución de la especie cynosc othono
56. Distribución de la especie cynosc parvip
57. Distribución de la especie cynosc reticu
58. Distribución de la especie dasyat dipter
59. Distribución de la especie dendro califo
60. Distribución de la especie dendro oldroy
61. Distribución de la especie desmop crista
62. Distribución de la especie diadem mexica
63. Distribución de la especie diodon holoca
64. Distribución de la especie diplob ommata
65. Distribución de la especie dosini ponder
66. Distribución de la especie echina tenuis
67. Distribución de la especie echino vanbru
68. Distribución de la especie elysia diomed
69. Distribución de la especie endopa grayi
70. Distribución de la especie epinep analog
71. Distribución de la especie epinep labrif
72. Distribución de la especie euapta godeff
73. Distribución de la especie eucida thouar
74. Distribución de la especie euthyn lineat
75. Distribución de la especie euvola vogdes
76. Distribución de la especie farfan califo
77. Distribución de la especie felima ghisel
78. Distribución de la especie girell simpli
79. Distribución de la especie gymnot castan
80. Distribución de la especie gymnot dovii
81. Distribución de la especie haemul flavig
82. Distribución de la especie haemul maculi
83. Distribución de la especie haemul scudde
84. Distribución de la especie haemul sexfas
85. Distribución de la especie haemul steind
86. Distribución de la especie halich chierc
87. Distribución de la especie halich dispil
53
88. Distribución de la especie halich nichol
89. Distribución de la especie halich semici
90. Distribución de la especie helias kubini
91. Distribución de la especie hermos azurea
92. Distribución de la especie hetero aequic
93. Distribución de la especie hetero mexica
94. Distribución de la especie hexapl ambigu
95. Distribución de la especie hexapl erythr
96. Distribución de la especie hexapl nigrit
97. Distribución de la especie hexapl prince
98. Distribución de la especie holaca passer
99. Distribución de la especie holoth impati
100. Distribución de la especie holoth lubric
101. Distribución de la especie hoplop
guenth
102. Distribución de la especie hyotis hyotis
103. Distribución de la especie hyport
acanth
104. Distribución de la especie hyport
niphob
105. Distribución de la especie isosti fuscus
106. Distribución de la especie janari mirabi
107. Distribución de la especie johnra nigrir
108. Distribución de la especie kyphos
analog
109. Distribución de la especie kyphos
elegan
110. Distribución de la especie laevic elatum
111. Distribución de la especie leiast teres
112. Distribución de la especie lincki columb
113. Distribución de la especie litope stylir
114. Distribución de la especie lutjan argent
115. Distribución de la especie lutjan guttat
116. Distribución de la especie lutjan novemf
117. Distribución de la especie lutjan peru
118. Distribución de la especie megapi
squali
119. Distribución de la especie microl inorna
120. Distribución de la especie mithro bradle
121. Distribución de la especie mugil cephal
122. Distribución de la especie mugil
curema
123. Distribución de la especie muraen
lentig
124. Distribución de la especie mycter
jordan
125. Distribución de la especie mycter
prionu
126. Distribución de la especie mycter
rosace
127. Distribución de la especie mycter
xenarc
128. Distribución de la especie myliob califo
129. Distribución de la especie myliob longir
130. Distribución de la especie mytell
guyane
131. Distribución de la especie nemati
pector
132. Distribución de la especie nichol dentic
133. Distribución de la especie nidore
armata
134. Distribución de la especie nodipe
subnod
135. Distribución de la especie octopu
alecto
136. Distribución de la especie octopu
bimacu
137. Distribución de la especie octopu fitchi
138. Distribución de la especie octopu
hubbso
139. Distribución de la especie ophiob steind
140. Distribución de la especie opisto
rosenb
141. Distribución de la especie oulang bradle
142. Distribución de la especie panuli inflat
143. Distribución de la especie panuli interr
144. Distribución de la especie paracy stearn
145. Distribución de la especie parala
aurogu
146. Distribución de la especie parala loro
147. Distribución de la especie parala
macula
148. Distribución de la especie parant
colonu
149. Distribución de la especie parequ
fuscov
150. Distribución de la especie parequ viola
151. Distribución de la especie pentac
cuming
152. Distribución de la especie pharia pyrami
153. Distribución de la especie phatar unifas
154. Distribución de la especie pincta mazatl
155. Distribución de la especie pinna rugosa
156. Distribución de la especie pomaca
zonipe
157. Distribución de la especie porite
paname
158. Distribución de la especie porite sverdr
159. Distribución de la especie prionu
puncta
160. Distribución de la especie pteria sterna
161. Distribución de la especie rhizop longur
162. Distribución de la especie ryptic bicolo
163. Distribución de la especie scarus
compre
164. Distribución de la especie scarus
ghobba
165. Distribución de la especie scarus perric
166. Distribución de la especie scombe
concol
167. Distribución de la especie scombe
sierra
54
168. Distribución de la especie scorpa
plumie
169. Distribución de la especie scylla astori
170. Distribución de la especie semico
pulche
171. Distribución de la especie seriol laland
172. Distribución de la especie serran psitta
173. Distribución de la especie sicyio penici
174. Distribución de la especie sphoer
annula
175. Distribución de la especie sphoer
lobatu
176. Distribución de la especie sphyra
argent
177. Distribución de la especie sphyra ensis
178. Distribución de la especie sphyrn lewini
179. Distribución de la especie spondy
crassi
180. Distribución de la especie spondy
limbat
181. Distribución de la especie stegas rectif
182. Distribución de la especie stenor debili
183. Distribución de la especie stereo gigas
184. Distribución de la especie stromb
galeat
185. Distribución de la especie tambja
abdere
186. Distribución de la especie test
187. Distribución de la especie thalas lucasa
188. Distribución de la especie totoab
macdon
189. Distribución de la especie toxopn
roseus
190. Distribución de la especie trachi paiten
191. Distribución de la especie trachi rhodop
192. Distribución de la especie tripne depres
193. Distribución de la especie turbo fluctu
194. Distribución de la especie urobat
concen
195. Distribución de la especie vokesi elenen
 
55
ANEXO 2.1.1.
Algoritmo del Índice Alternativo de Algas Flotantes (AFAI) para MODIS y VIIRS
Se describe el algoritmo para implementar el producto “Índice Alternativo de Algas Flotantes (AFAI)”
para 4 satélites a 1-km, como parte del sistema satelital de alerta temprana de Sargazo (SATsum)
asociado al Sistema de información y análisis marino costero (SIMAR), de la CONABIO.
El Índice Alternativo de Algas Flotantes (AFAI) es el índice para detectar sargazo pelágico
(sargassum), macroalgas verdes y cianobacterias. Se calcula utilizando las reflectancias de Rayleigh
de tres bandas espectrales para cada pase diurno del satélite (Wang, M., and C. Hu, 2016) (Tabla 1).
De manera operacional en SIMAR ya se visualizan los productos diarios AFAI para dos sensores sobre
4 satélites: (1) MODIS / Aqua; (2) MODIS / Terra; (3) VIIRS / SNPP; y (4) VIIRS / JPSS-1.
Tabla 1. Fuente de imágenes satelitales, bandas espectrales para los productos, resolución temporal
(Reflectancias de Rayleigh), período analizado por sensor, período analizado, resolución espacial de los
productos, y resolución temporal de los sensores para el área SIMAR.
56
Sens
or
Satélit
e
Opera
dor
Bandas espectrales
para los productos:
Banda espectral
@resolución temporal
(Reflectancias de
Rayleigh)
Período
analizado
por sensor
Período
analizado
@resolución
espacial de los
productos (FAI,
AFAI, DSC,
RSA).
Resolución
temporal de los
sensores para el
área SIMAR
MODI
S
Aqua
NASA
AFAI
13-Red: 667 nm @1 km;
15-NIR: 748 nm @1 km;
16-SWIR: 869 nm @1
km
Jul. 4, 2002
- hoy en día
Sept. 4, 1997 -
Hoy en día
@1-km
2 a 3 pasos diarios
en la tarde
MODI
S
Terra
NASA
AFAI
13-Red: 667 nm @1 km;
15-NIR: 748 nm @1 km;
16-SWIR: 869 nm @1
km
Feb. 24,
2000 - hoy
en día
Sept. 4, 1997 -
Hoy en día
@1-km
2 a 3 pasos diarios
en la mañana
VIIRS
S-NPP
NASA-
NOAA
AFAI
M5-Roja: 672 nm @750
m;
M6-NIR: 746 nm @750
m;
M7-SWIR: 865 nm @750
m
Ene. 2, 2012
- hoy en día
Sept. 4, 1997 -
Hoy en día
@1-km
2 a 3 pasos diarios
en la tarde. Suomi
NPP opera unos 50
minutos por detrás
de NOAA-20.
VIIRS
JPPS-
1
NASA-
NOAA
AFAI
M5-Roja: 672 nm @750
m;
M6-NIR: 746 nm @750
m;
M7-SWIR: 865 nm @750
m
Dic. 13,
2017 - hoy
en día
Sept. 4, 1997 -
Hoy en día
@1-km
2 a 3 pasos diarios
en la tarde.
NOAA-20 opera
unos 50 minutos
por delante de
Suomi NPP.
El índice Alternativo de Algas Flotantes (AFAI) (en unidades de reflectancia, [mW cm−2 𝜇m−1 sr−1])
permite tanto la detección de Sargazo pelágico en la superficie del mar, como de macroalgas verdes y      
florecimientos de cianobacterias.
El AFAI se calcula utilizando las reflectancias de Rayleigh (Rrc) de tres bandas espectrales para cada
pase diurno de satélites (Wang and Hu, 2016) [Fórmula 1].
[Fórmula 1]
Las bandas utilizadas en el AFAI son:
RED: Banda visible roja (Visible, RED)
NIR: Banda infrarroja cercana (Near Infra-Red, NIR)
SWIR: Banda banda infrarroja de onda corta (Short Wave Infra-Red, SWIR)
El AFAI se deriva como la reflectancia de la banda NIR (después de la corrección atmosférica), con
referencia a una línea de base lineal entre la banda RED y la banda SWIR (Fig. 1).
Figura 1. Espectro de ejemplo donde se representa gráficamente cómo se calcula el AFAI a partir de
las reflectancias de las bandas RED, NIR y SWIR
57
El AFAI es un producto sensible para detectar características sutiles de la superficie del océano, sin
embargo, se satura bajo el brillo del sol, las nubes o los aerosoles gruesos.
Este índice permite la identificación de la presencia de sargazo en la superficie del mar. El AFAI
incluye los siguientes tres aspectos básicos: 
1. Clasificación de píxeles que contienen Sargassum a través de una corrección de gradiente a
gran escala que incluye el enmascaramiento de nubes y sombras de nubes, y la eliminación de      
píxeles ambiguos
2. Mezcla lineal de píxeles que contienen Sargassum
3. Estadísticas de la cobertura del área de Sargassum en cuadrículas predefinidas a intervalos     
mensuales, estacionales y anuales
El uso de estas bandas tiene la ventaja de que se maximiza la relación señal-ruido. Una aparente
desventaja del AFAI es su saturación sobre blancos brillantes tales como nubes y sunglint fuerte (por
lo tanto conduciendo a una reducción en la cobertura de los datos). Sin embargo, esto permite un
enmascaramiento relativamente fácil de las nubes, haciendo las imágenes resultantes más simples
de interpretar. Estas características son particularmente importantes para aplicaciones de detección
en tiempo casi real.
El proceso para cartografiar y cuantificar la distribución y cobertura de Sargazo se compone de tres
pasos principales:
1. Clasificación de los píxeles de imagen individuales en tres clases:
a. No Observación (esta clase incluye la falta de cobertura del satélite, el sunglint, las
nubes, las sombras de nubes, y todos los otros artefactos de la imagen);
b. Pixel libre de Sargazo;
c. Pixel que contiene Sargazo.
2. Separación de la clase que contiene Sargazo usando los umbrales locales para una cobertura
de subpíxeles mínima (0%) y máxima (100%) para estimar la cobertura fraccional de Sargazo
dentro de cada píxel.
3. Recopilación de datos de los píxeles individuales de la imagen en cuadrículas predefinidas a       
intervalos de tiempo determinados (mes, estación, año) para todo el período de estudio, lo que
lleva a la creación de series temporales de cobertura de área y mapas de distribución.
Nótese que una señal de AFAI elevada puede ser indicador de cualquier vegetación flotante, no sólo      
de Sargazo.
 
58
ANEXO 2.1.2.
Algoritmo para estimar la Cobertura de sargazo en superficie para el sensor MODIS/AQUA
El proceso para estimar la cobertura de sargazo en superficie para el sensor MODIS/AQUA sobre la
base del AFAI (AFAI-Aqua) se realiza mediante el siguiente algoritmo:
1. Se determina el fondo libre de sargazo en el océano. Esto consiste en crear una imagen que
partiendo del AFAI-Aqua quedan excluidos los pixeles con valor superior a Ts=0.000255.
2. Se determina la imagen de referencia de AFAI (RefAFAI). En la cual el valor de cada píxel se
calcula como la mediana centrada en dicho píxel, de todos sus vecinos en una ventana de        
hasta 51 x 51 píxeles a su alrededor, sobre la imagen del fondo libre de sargazo creada en el         
punto 1. La ventana de 51x51 implica buscar información en 25 filas y/o columnas en las 4
direcciones de la matriz, que rodea al pixel de cálculo.
La cobertura diaria de sargazo pelágico en la superficie marina (DSC-Aqua) se determina a partir del
cumplimiento de la siguiente condición para cada pixel: la diferencia del producto satelital Índice    
Alternativo de Algas Flotantes diario - Aqua/MODIS (AFAI-Aqua) con la imagen AFAI de referencia
(RefAFAI) supere el valor recomendado para el umbral de presencia de sargazo (T0) para las
imágenes MODIS/Aqua

[AFAI-Aqua - RefAFAI] > T0 , (1)

dónde: el valor T0 = 0.000179 (para imágenes MODIS/Aqua, según Wang, M., & Hu, C., 2016),
asignándole a DSC-Aqua el valor 1, que corresponde a aquellos píxeles con presencia de Sargazo.
Los pixeles con datos válidos que no cumplen con la condición (1), no se identifican la presencia de
Sargazo y se clasifican con valor 2. El resto de los pixeles sin datos debido a la falta de cobertura del
satélite, con sunglint, nubes, sombras de nubes y otros artefactos en la imagen, se clasificarán con
valor 0.
En resumen, para la imagen DSC-Aqua los píxeles se clasificarán en las siguientes tres clases:
Valor 1: Con observación y con sargazo
Valor 2: Con observación pero sin Sargazo
Valor 0: Sin observación, incluyendo la falta de cobertura del satélite, el sunglint, las nubes, las
sombras de nubes, y todos los otros artefactos de la imagen
Conviene mencionar que el procedimiento refleja la cobertura de sargazo detectada, lo cual no quiere
decir que sean las únicas regiones con presencia de sargazo.
 
59
ANEXO 2.1.3.
Algoritmo del Máximo del Índice Alternativo de Algas Flotantes semanal - MODIS/Aqua
(Max-W-AFAI)
El Máximo del Índice Alternativo de Algas Flotantes semanal - MODIS/Aqua (Max-W-AFAI) se  
determina mediante la combinación de las imágenes de AFAI-Aqua diarias. La designación del AFAI
semanal combinando múltiples productos diarios se realizará sobre la base de la asignación de
valores a los píxeles individuales siguiendo el siguiente orden jerárquico:
1- En caso que el producto AFAI-Aqua para ninguno de los 7 días tenga datos observados se asigna
sin observación, si no se cumple esta condición se pasa al punto 2)
2- En caso que el producto AFAI-Aqua solo tenga datos observados para uno de los días de la semana
se asigna el valor correspondiente a ese dato, si más de uno tiene datos observados se pasa al punto
3)
3- En caso de que para el producto diario AFAI-Aqua , dos o más de ellos tengan datos observados se  
asigna el mayor valor entre todos los datos observados.
ANEXO 2.1.4.
Algoritmo para determinar la cobertura potencial estimada de sargazo flotante semanal
basado en AFAI - Aqua/MODIS (DSC-W-Aqua)
La cobertura potencial estimada de sargazo flotante semanal basado en AFAI - Aqua/MODIS  
(DSC-W-Aqua) se determina a partir del Máximo del Índice Alternativo de Algas Flotantes semanal -
MODIS/Aqua (Max-W-AFAI). La designación de la cobertura potencial estimada de sargazo flotante      
semanal se realizará sobre la base de la asignación de valores a los píxeles individuales siguiendo el
siguiente orden jerárquico:
1- En caso que el producto Max-W-AFAI no tenga datos observados se asigna sin observación (Valor
0), si no se cumple esta condición se pasa al punto 2)
2- En caso que el valor observado del producto Max-W-AFAI esté por debajo del umbral de sargazo
(-0.00021 mW cm−2 𝜇m−1 sr−1) se asigna con observación pero sin sargazo (Valor 2), en caso
contrario se pasa al punto 3)
3- En caso de que para el producto Max-W-AFAI , el valor observado sea igual o mayor que el umbral    
de sargazo (-0.00021 mW cm−2 𝜇m−1 sr−1), se asigna observación de sargazo (Valor 1).
El valor umbral de presencia de sargazo -0.00021 mW cm−2 𝜇m−1 sr−1 en el producto Máximo del
Índice Alternativo de Algas Flotantes semanal - MODIS/Aqua, se determinó a partir del análisis  
estadístico de los histogramas de dicho producto durante el año 2020.
 
60
ANEXO 2.1.5.
Algoritmo para determinar el Índice Normalizado de Algas Flotantes diario - Aqua / MODIS
(NFAI-Aqua)
El Índice de algas flotantes normalizado NFAI se calcula mediante la siguiente expresión:
NFAI=(Rnir - Rint) / (Rnir + Rint)
donde: Rint=Rnir - FAI
El NFAI expresado en términos del FAI quedaría de la siguiente forma:
NFAI= (FAI) / ((2*Rnir) - FAI)
El FAI se calcula mediante la siguiente expresión (Hu, 2009)):
Para el cálculo del FAI: RED se refiere a la banda roja 645 nm
NIR se refiere a la banda infrarroja cercana 859 nm
SWIR se refiere a la banda infrarroja de onda corta 1240 nm
61
ANEXO 2.1.6.
Reporte sobre los resultados de la medición de las firmas espectrales del Sargazo
1. Conceptos generales de espectrorradiometría
i. Radiación electromagnética
De acuerdo a la teoría ondulatoria la radiación electromagnética es una forma dinámica de
energía que se propaga mediante ondas que se desplazan por el espacio a la velocidad de la luz (
). Las ondas son resultado de oscilaciones en los campos eléctrico y magnético.998x10 m sc = 2 8−1  
en las inmediaciones de los objetos, los cuales generan ondas que contienen dos campos de
fuerzas ortogonales entre sí: eléctrico y magnético, y transmiten la energía. Los parámetros que
caracterizan cada onda son: longitud de onda y frecuencia (figura 1). La primera hace (λ) (ν )  
referencia a la distancia entre dos crestas sucesivas de una onda, expresada en micrómetros
, mientras que la frecuencia designa el número de ciclos que pasan por un punto
1 μm m
(= 10−6 )    
fijo en una unidad de tiempo, se mide en Hertz . La relación entre estos (1 Hz ciclo por segundo)= 1  
elementos es dada por:
λc= ν  
Figura 1. Esquema de una onda electromagnética, formada por un campo eléctrico y un campo
magnético perpendiculares entre sí y perpendiculares a la dirección de propagación.
ii. Espectro electromagnético (EEM)
Es posible definir cualquier tipo de energía radiante en función de su longitud de onda. El conjunto de         
las longitudes de onda que puede adoptar la radiación electromagnética se denomina espectro
electromagnético (figura 2). Por razones prácticas se suele dividir en una serie de regiones debido a
que las longitudes de onda dentro de esas regiones presentan cierta homogeneidad en determinados      
aspectos.
62
Figura 2. EEM en función de su longitud de onda
iii. Magnitudes radiométricas fundamentales
La energía asociada con la radiación electromagnética se denomina energía radiante . Indica el Q  
total de energía radiada en todas direcciones y es medida en joules . La cantidad de energía (J)   
radiante que incide o es emitida por una superficie de área dada en un periodo de tiempo es llamada
flujo radiante, . Se mide en joules por segundo o watts . ϕ(Js )
−1 (W)
ϕ=dt
dQ  
Cuando la energía electromagnética, proveniente del sol principalmente, incide sobre la superficie
terrestre, el flujo incidente puede descomponerse en tres términos: flujo reflejado , absorbido (ϕ)
i   (ϕ)
r 
y/o transmitido . (ϕ)
a (ϕ)
t 
La proporción del flujo incidente que es reflejado, absorbido y transmitido depende de las
características de la superficie que se observa y de la longitud de onda a la que es observado (figura       
3).
Figura 3. Interacción de la EEM con la superficie de la Tierra. Modificado de Lillesand T. M. and Kiefer
R., (1999)
63
Las observaciones empleando técnicas de Percepción Remota requieren que un sensor detecta la
radiación electromagnética que es reflejada o emitida por los objetos sobre la superficie terrestre.
El flujo incidente así como el flujo reflejado pueden explicarse y definirse a partir de los (ϕ)
i   (ϕ)
r  
conceptos de irradiancia y radiancia.
La densidad de flujo radiante que incide sobre un punto en una superficie especificada se conoce  
como irradiancia, . Es una medida que describe la energía total radiada que incide sobre una E      
superficie plana desde todos los ángulos de un hemisferio en una unidad de tiempo. Se mide en watts
por metro cuadrado (W ) (figura 4).m−2
E=ds
dϕ 
Donde es el elemento de área.sd 
Figura 4. Geometría asociada a la definición de irradiancia. (Gómez, 2006)
La irradiancia puede dividirse en dos componentes: ascendente y descendente . E (E)
u (E)
dEu
considera la irradiancia en la cara superior del elemento de superficie (el flujo retrodispersado y
reflejado), mientras considera la irradiancia en la cara inferior del elemento de superficie (flujo Ed    
incidente) (figura 5).
Figura 5. Geometría asociada a la definición de irradiancia descendente y ascendente , donde(a) (b)
es el flujo radiante que llega a la superficie . (Dogliotti, 2007)ϕd sd
El flujo radiante y la irradiancia no consideran el carácter direccional del flujo emitido desde la ϕ E    
fuente y, por tanto, en tales magnitudes se considera la energía total en todas direcciones. Los
sensores remotos tienen un campo limitado de observación y no reciben toda la irradiancia emitida
por una superficie debido a que la forma del detector y su geometría de observación limitan la señal a
una pequeña fracción del flujo. Por lo tanto es necesario tener una descripción de la variación del flujo
en función de la dirección, para lo cual es necesario definir el concepto de ángulo sólido. Existe una
estrecha analogía entre el ángulo sólido y el ángulo plano. El ángulo sólido es el ángulo comprendido
entre dos radios de circunferencia que interceptan sobre esta un arco de longitud . Tiene unidad de       l  
(figura 6).adianesr
64
θ = radio
longitud de arco =l
r 
El ángulo plano de circunferencia completa es .π rad2
El ángulo sólido es el espacio comprendido dentro de una superficie cónica. Se obtiene trazando (Ω)  
una superficie esférica con radio arbitrario y centro en el vértice y aplicando la relación:(r) (O)
Ω = S
r2
Donde es el área del casquete esférico interceptado por el ángulo sólido. Tiene unidad deS  
estereoradianes .rs
Como la superficie de una esfera de radio es , el ángulo sólido encerrado por la esfera total     (r) r2 
es por tanto .π4
Figura 6. Geometría asociada a la definición ángulo plano a) y ángulo sólido b). Modificado deMobley,
(1994).
Cuando el ángulo sólido es pequeño, el área se vuelve y no es necesariamente un casquete (S) (ds) 
esférico, sino que puede ser una superficie plana perpendicular a (Figura 7), de modo que:PO 
d=r2
ds  
Si no es perpendicular a (Figura 7b),sd PO
d=r2
ds =r2
ds cosθ 
Figura 7. Geometría asociada a la definición ángulo plano y ángulo sólido. (Beléndez et al. 1988)
Cuando se pretende caracterizar la emisión de fuentes puntuales es frecuente introducir el concepto     
de intensidad radiante.
65
La intensidad radiante es la densidad de flujo radiante por unidad de ángulo sólido incidente en un I  
punto del espacio propagándose en una dirección específica. Se mide en .srW −1
I=dϕ
d 
Sin embargo, esta no es una magnitud usada habitualmente y, cuando se habla de superficies
extensas, se utiliza la radiancia , que mide el flujo radiante por unidad de área y de ángulo sólido L    
incidente en un elemento de superficie propagándose en una dirección específica. Se mide en
.W s m r−1 −2 
L(θ, )=dϕ
2
dds =dϕ
2
ddscosθ 
Donde es una magnitud denominada “área proyectada” que es el área de la proyección sdscosθd=d    
de la superficie elemental (la que contiene al punto) sobre un plano perpendicular a la dirección de sd  
propagación.
La radiancia cobra especial interés en la percepción remota ya que es la magnitud detectada por los
sensores.
Así como la irradiancia, la radiancia también puede dividirse en una componente ascendente y     (L)
u 
una descendente (figura 8).(L)
d
Figura 8 Geometría asociada a la definición de y donde es el área de un elemento de laLu, Ld sd
superficie, es la radiancia que sale de con un ángulo cenital (relativo a la normal de laL(θ, )sd θ
superficie) y un ángulo acimutal (formado por el plano vertical que contiene al haz de luz y algún otro
plano vertical especificado, tal como el plano vertical del sol). Su valor es definido por el flujo radiante
que sale de dentro del ángulo sólido dΩ, centrado en la línea definida por y . Modificado de Kirksd θ
(2011).
iv. Relaciones entre las magnitudes radiométricas fundamentales
La radiancia es la variable óptica fundamental medida por los sensores, un gran número de L  
cantidades radiométricas pueden ser derivadas a partir de ella (van der Mer & Jong, 2001). Es posible
calcular la irradiancia descendente partiendo de la radiancia en una dirección definida (figura 9). La
irradiancia total descendente en un punto, se obtiene integrando respecto al ángulo sólido en todo Ed  
el hemisferio superior. De forma similar se obtiene integrando toda la radiancia del hemisferio Eu  
66
inferior. Este es un aspecto muy importante, ya que no siempre es posible hacer mediciones directas
de la irradiancia.
osθdω Ed=
L(θ, )c 
Figura 9. Geometría asociada a la definición de irradiancia y su relación con la radiancia. La irradiancia
total descendente en un punto se obtiene integrando respecto al ángulo sólido en todo el(E)
d
hemisferio superior (Dogliotti, 2007).
Un caso de especial interés es la irradiancia sobre una superficie plana que emite o refleja energía con
la misma intensidad en todas las direcciones independientemente del ángulo con el que incide la
radiación. En este caso la irradiancia es igual a:
LE = π
A este tipo de superficies se las llama lambertianas ya que reflejan la radiación en forma isotrópica, o  
sea que la radiancia es reflejada uniformemente en todas las direcciones
v. Propiedades Ópticas del agua
El entendimiento de las características bio-ópticas de la columna de agua es fundamental en la
estimación de los constituyentes del océano (clorofila a, materia orgánica disuelta (CDOM), sólidos
suspendidos totales (TSS)). La concentración de estos constituyentes determina las propiedades
ópticas inherentes (IOPs) del agua (D´Sa & Miller, 2005).
Las propiedades ópticas inherentes (IOP), según la definición de Preisendorfer (1961), no dependen
de la distribución angular del campo de luz incidente sino sólo del tipo y concentración de sustancias
presentes en el medio. Las IOP´s son determinadas por dos procesos principales, la absorción y la
dispersión. Estos procesos influyen y modifican la reflectancia espectral de los cuerpos de agua    
naturales (i.e. su color), son cuantificadas por medio del coeficiente de absorción, el coeficiente de    
dispersión y la función de volumen de esparcimiento (dispersión).
Las IOP´s tienen a su vez una influencia en las propiedades ópticas aparentes del agua (AOP´s). Las
AOP´s dependen de la geometría de iluminación así como de la naturaleza y cantidad de las
sustancias presentes en el medio (figura 13). Las más representativas son:
el coeficiente de atenuación difusa , el factor de reflectancia bi-direccional (BRF) y la kd(λ)  
reflectancia teledetectada , utilizada por los sensores satelitales para estimar  
concentraciones de los constituyentes del agua (D´Sa & Miller, 2005). 
67
Figura 13. Relación entre las IOP´s y AOP´s
vi. Propiedades ópticas aparentes (AOP´s)
De acuerdo con (Goodman, 2004) las definiciones explícitas de reflectancia están en función de las      
características angulares de la fuente de energía y del detector de esta energía. En este sentido se        
presentan dos de las más empleadas para el propósito de la presente guía.
vii. Reflectancia teledetectada (Rrs)
La describe cuánta luz proveniente de todas direcciones es reflejada hacia una dirección
específica (ángulo sólido), se define como la proporción del flujo radiante incidente y reflejado en una
longitud de onda específica. En aplicaciones oceanográficas se utiliza para mediciones sobre la
superficie del agua (Goodman, 2004:42). Esta es la medición base para aspectos del color del océano
en la presente guía.
Se expresa como:
 
Donde es la radiancia total del agua (water leaving radiance) y es la irradiancia    
descendente, proveniente de todas direcciones.
 
68
la radiancia del agua ( ) está compuesta por, la radiancia medida desde la superficie del agua (
) menos la radiancia del cielo ( ), medida en el mismo ángulo que y el número de
Fresnel ( ), el cual es determinado por la reflectancia de la superficie del mar a un ángulo
determinado. Por lo tanto la obtención de la radiancia del agua requiere medir las otras
magnitudes para poder restarlas de la señal recibida por el sensor.
viii. Reflectancia bidireccional.
La reflectancia bidireccional describe cuánta luz proveniente de una dirección específica (ángulo
sólido) es reflejada en otra dirección específica (ángulo sólido) La intensidad de la radiancia está en
función de la cantidad de radiación solar incidente (Goodman, 2004:39). Para una medición espectral   
dada, la medición angular de la radiancia es convertida a un factor bidireccional de reflectancia, que
se define como la radiancia espectral medida a un ángulo específico en proporción con la irradiancia
en el mismo ángulo de incidencia de iluminación (Peddle et al. 2000).
: Radiancia reflejada medida por un instrumento con ángulo sólido finito.
: Irradiancia proveniente de un ángulo sólido finito.
La es considerada a menudo como la cantidad fundamental que describe la reflectancia de la      
superficie. Sin embargo, en la práctica se dificulta obtenerla de manera directa empleando la ecuación
21, ya que es difícil medir directamente la irradiancia incidente.
Al ser difícil medir directamente la irradiancia, se puede utilizar lcomo un indicador de la
irradiancia, donde es la radiancia reflejada por un panel de referencia, usualmente se utiliza una  
placa de Espectralón, en la misma dirección que la medición de la radiancia de la superficie de
interés. Esto nos lleva a una medición del factor de reflectancia bidireccional . La placa de RFB    
espectralón se considera una superficie quasi-lambertiana, por lo tanto el es igual a la radiancia RFB  
del objetivo entre la radiancia del panel multiplicada por 0.99 qué es el factor de corrección. El factor    
de corrección se aplica para igualar la respuesta del panel a la de una superficie perfectamente difusa    
(Arce, 2005:33).
Entonces la función de reflectancia bidireccional se expresa:
RF .99B=Lu
Lpanel *0 
(Goodman, 2004).
2. Metodología de medición en campo con el espectrorradiómetro GER-1500
i. Mediciones radiométricas in situ
Un radiómetro es un instrumento cuya finalidad es medir la intensidad de la radiación absorbida o
reflejada en diferentes regiones espectrales. Es una herramienta básica para el desarrollo,
69
perfeccionamiento y comprobación de modelos de reflectividad, que buscan establecer relaciones    
entre atributos biofísicos con datos espectrales. Uno de los propósitos de la radiometría de campo es        
obtener valores de reflectancia relacionales con el valor obtenido a partir de las imágenes de satélite.
Existen varios tipos de radiómetros, para los propósitos del presente mencionaremos dos tipos
fundamentales:
Radiómetros remotos (Incorporados a satélites o aerotransportados).
Radiómetros de campo.
La radiometría de campo se puede definir como la medida de la reflectividad espectral de cualquier
superficie en su entorno natural. De manera tradicional la radiometría en campo ha sido utilizada para
ser relacionada con la Percepción Remota (PR). Aunque por sí sola ha demostrado ser una
herramienta muy útil debido a la relación de esta información espectral con algunas características
biofísicas de las superficies. En este campo el uso del espectroradiómetro (ER) es cada vez más
común. Se han desarrollado aplicaciones en muy distintos campos dentro de la ciencia. Algunos de
estos son: estudios relacionados con la humedad de la vegetación (Shibayama et al. 1993, Vaughan    
2001), concentración de clorofila en dosel (Jago et al. 1999), determinación del albedo de la nieve
(Domine et al. 2006) y en aplicaciones oceanográficas (color del océano y clasificación de hábitat
bentónico).
ii. Aplicaciones de espectrorradiometría en color del océano 
Las mediciones del color del océano a partir de imágenes de satélite son una herramienta poderosa
en aplicaciones oceanográficas, resulta muy útil para conocer la variabilidad espacio-temporal de la
superficie del océano. Las aplicaciones de estos estudios son muy vastas, productividad primaria
oceánica, flujos de carbono y pesquerías entre otros (Callejas-Jiménez et al. 2011). Las mediciones in  
situ son fundamentales para calibrar y validar estos modelos. Doxaran et al. (2004) empleó ER para  
comparar datos satelitales de los sensores SPOT y Landsat con mediciones radiométricas y    
concentraciones de sólidos suspendidos (SS). O,Reilly et al. (1998) evaluaron algoritmos para
estimación de clorofila a partir de imágenes de satélite con mediciones in situ de espectroradiómetro.      
Rodríguez-Guzmán (2009) correlacionó datos del ER para calibrar un modelo de estimación de sólidos
suspendidos totales (TSS). Lee et al (2007), emplearon mediciones de ER para conocer las
implicaciones del color del océano en la profundidad de la zona eufótica. Las aplicaciones del    
espectroradiómetro en estudios oceanográficos de color del agua son sustanciales como un
instrumento de calibración y validación.
iii. Descripción y especificaciones del GER 1500
El GER 1500 es un espectrorradiómetro de campo con un intervalo de longitud de onda que va desde
el Ultravioleta, el visible hasta el infrarrojo cercano, de los 350 a los 1050 nm. Tiene la capacidad de    
leer 512 bandas espectrales. Puede guardar información de manera interna o trabajar de manera    
conjunta con una PC por conexión RS- 232 o adaptable a un puerto USB (SVC ADP000015 USB Serial
port adapter). El software incluido permite visualizar en tiempo real las lecturas de radiancia y
reflectancia. Existe también alternativamente la opción de utilizar un puerto bluetooth con conexión a
la Pc o a una PDA. El instrumento está diseñado también para ser conectado con un GPS a través del
puerto COM 1, en esta modalidad el GER 1500 graba la latitud y la longitud de manera conjunta con      
las lecturas espectrales.
70
Figura 14. Ger 1500
iv. Procedimientos para Color del océano 
A continuación se describe detalladamente con se realizan las mediciones con el GER 1500 para la
obtención de la (Rrs) en la superficie del agua, de acuerdo con los trabajos de Shifrin (1988), Mobley       
(1999), Arce (2005) & Muller et al. (2003).
Condiciones de la luz solar
La definición de la hora a la que se toman las mediciones es fundamental, debido a que el ángulo con      
el cual incide la luz sobre la atmósfera y la columna de agua, tendrá implicaciones sobre la intensidad
de la misma (figura 15). La hora adecuada para hacer las mediciones está en función del ángulo solar.    
Los ángulos bajos cercanos al amanecer y al atardecer deben ser evitados debido a la oblicuidad de      
la radiación (figura 16). Las lecturas confiables se logran en un intervalo de 45° sobre el cenit (altura
solar máxima).
Figura 15–Influencia de la atmósfera en función del ángulo de incidencia de los rayos solares.
71
Figura 16. Altura y azimuth solar.
La posición solar puede determinarse si se cuenta con las coordenadas del área de estudio en la
página http://www.golden-hour.com. Seleccionando el área de estudio desde el mapa o introduciendo
las coordenadas.
Alternativamente http://www.srrb.noaa.gov/highlights/sunrise/azel.html, en la página de la NOAA se    
calcula la posición del sol, indicando la fecha y la hora.
Ubicación del operador sobre la embarcación
En la ubicación de la posición del operador se debe tomar en cuenta evitar la sombra del bote y evitar     
cualquier reflejo de alguna super-estructura que pueda interferir con la respuesta sobre la superficie
del agua. Con respecto al sol, se debe tomar en cuenta el ángulo acimutal relativo al acimut solar,      
debido a la naturaleza direccional de la reflexión de la luz solar y la naturaleza bidireccional de la        
reflectancia teledetectada. Las mediciones deben realizarse en posición opuesta al sol, este aspecto
se detallará más adelante.
Mediciones in situ de radiancia e irradiancia (cálculo de Rrs)
Mediciones de radiancia ascendente e irradiancia descendente. Método indirecto (espectralón).
Se plantea la medición de la Rrs por un método que se basa en el uso de una placa de referencia
(espectralón) para estimar la irradiancia descendente Ed de manera indirecta (Mobley, 1999). Las  
mediciones requeridas para la obtención de Rrs se describen a continuación:
Radiancia del agua Lw (θ,φ)
no puede ser medida de manera directa, ya que la radiancia que se obtiene de la superficie del    
agua ( ) incluye la radiancia del agua más la fracción de la radiancia incidente del cielo ( ) que
es reflejada por la superficie del agua. Por lo que la obtención de en campo requiere de la       Rrs  
medición de la radiancia ascendente ( ), la radiancia descendente obtenida a partir del sensor    
apuntando hacia el panel de referencia ( ), la radiancia del cielo ( ), la radiancia del agua (    
) y la constante de Fresnel ( ) (figura 17) (Mobley, 1999).
72
Figura 17. Tres pasos para obtener la (Rrs) a partir del GER 1500 y el uso del espectralón (Hu, 2002).
De acuerdo con Hartmann y Vega Rodríguez (conversación personal, 2012) los mejores resultados
para las mediciones de radiancia del agua se obtienen con un ángulo de entre 30 y 45 ° (Figura 18).
Arce (2005) indica un ángulo de 45° para minimizar el efecto de sunglint. Muller et al. (2003) sugieren
que para las mediciones de Lu, el efecto de reflejo del cielo (sun glint) se minimiza a 40° en cenit y
135° en acimut relativo al sol.
Figura 18. Mediciones de radiancia del agua (Lw) a un ángulo determinado (45°)
Radiancia del cielo (Lsky)
La radiancia del cielo (Lsky) se mide empleando los mismos ángulos cenital y acimutal que para las
mediciones de Lu (figura 19).Si las mediciones se hacen en cielo nublado, los ángulos de vista se  
deben seleccionar tratando de buscar espacios despejados, en este caso la corrección es
problemática (poco útil) si la fracción de nubes no es muy pequeña en el hemisferio en el que se
encuentra el acimut seleccionado (Muller et al. 2003). 
73
Figura 19. Mediciones de radiancia del cielo (Lsky) a un ángulo determinado (45°)
Nota: Si el cielo está nublado y no existe paso directo de los rayos solares las mediciones
espectroradiométricas son de poca utilidad para ser asociadas con la respuesta satelital.
La w, es la constante de Fresnel (sky radiance reflectance), la cual es utilizada para conocer la      
proporción de la radiancia solar que se refleja sobre la superficie del agua (sun glint). La constante de
fresnel es el % de reflectancia del cielo sobre la superficie del agua (Austin, 1974), la cual depende de
muchos factores (velocidad del viento, estado del mar, distribución de la radiancia del cielo) (Muller et      
al. 2003). Se calcula de manera práctica con base en el ángulo sobre el cual se toman las mediciones    
de radiancia. En este caso con un ángulo de45° la constante de Fresnel sería de 0.028. Aunque en las
simulaciones de Mobley, (1999) la constante de fresnel (sky radiance reflectance) ( w) puede
aumentar drásticamente en función de la velocidad del viento. Un aspecto importante a considerar es
que el límite superior de w disminuye conforme aumenta el ángulo solar cenital, de ahí la    
importancia de tomar mediciones con ángulos cenitales solares lo más alto posibles.
Irradiancia descendente (Ed)
La Irradiancia descendente puede ser obtenida a partir de un colector coseno, mediante una
placa de referencia (asumiendo un comportamiento lambertiano) (Mobley, 1999), o bien empleando
una esfera integradora. El uso de los colectores coseno es perfectamente válido para la
determinación de la irradiancia, pero no es una medida precisa de la reflectancia de la superficie
(Goodman, 2004). Las mediciones realizadas empleando el colector coseno y la esfera integradora se
realizan de manera directa, mientras con la placa de referencia se obtiene de manera indirecta.
En este caso los valores de irradiancia serán obtenidos de manera indirecta empleando una placa de      
referencia. Para efectos de medición, si consideramos que la placa tiene un comportamiento
lambertiano ( ), la irradiancia puede calcularse como:Lplaca
Ed=Rp
πLplaca  
es el factor de reflectancia del espectralón (se obtiene del proveedor). Es una correcciónRp  
considerando que el comportamiento del panel no es 100% difuso.
74
La radiancia de la placa puede medirse directamente con el GER-1500 apuntando a la placa de Lplaca  
referencia usando el mismo ángulo que para la radiancia de la superficie del agua . Una de las (L)
u  
ventajas de calcular la con este método es que se utiliza el mismo instrumento, por lo que no se Rrs    
requiere una calibración radiométrica absoluta (Mobley et al. 1999:7445).
A partir de las mediciones de radiancia e irradiancia puede obtenerse un valor de .Rrs
Haciendo referencia a la ecuación 18, sustituyendo:
Rrs =πL/R
placa g
L−ρ L
uw sky  
v. Corrección del sunglint.
El sunglint es la reflexión especular de la luz en la superficie del agua (Kay et al. 2009). Este fenómeno      
genera un error de medición, ya que lo que nos interesa es únicamente la respuesta espectral del agua
(figura 19). Una manera de corregir los efectos del sunglint, es determinar la reflectancia a 750 nm,
debido a la alta absorbancia del agua en esta longitud, la respuesta debe ser muy baja, cercana a
cero. Una incorporación a esta ecuación es sustraer la a esta longitud de onda (750 nm) al resto Rrs  
de las longitudes de onda, asumiendo que a esta longitud es cero, este valor puede considerarse Lw 
radiancia residual del cielo (Mobley, 1999).
Entonces:
750 nm Rrs =(Ed
Lw)*Rrs  
Un aspecto pendiente de analizar es que en aguas costeras donde las concentraciones de sólidos        
suspendidos totales (TSS) son altas, debido a la retro-dispersión de las partículas, la respuesta
espectral a 750 nm puede no ser 0. Se han propuesto diferentes longitudes de onda para este
propósito pero sin llegar a un consenso, 670, 765, 865, 1012 (Toole et al. 2000).
Figura 20. Sensor CASI en Plymouth Sound (UK) Sun glint a la izquierda de la imagen (KAy et al.
2009).
75
vi. Instrucciones técnicas sobre la operación del GER 1500
Presionar el interruptor de poder, encendiéndose el LED.
Es importante asegurarse de que se cuente con la suficiente energía.
El modo óptico debe ser ajustado antes de usar el GER-1500, el modo deseado para este caso    
es Optics 1, esto apretando la tecla Menú hasta encontrar la opción Optic option, ahí presionar      
el botón edit, esto invoca el archivo de calibración para el estándar FOV 4°.
El espectroradiómetro debe calentarse primero. Para esto se deben tomar 10 lecturas en
modo de referencia (REF). Las flechas up and down permiten manipular de REF a TARGET.
Para cada medición del objetivo se debe hacer un escaneo de referencia.
Es importante ver el número de medición en la memoria, esto en el Menú. El número que se  
indica es el de la siguiente medición (se debe tener cuidado, ya que los datos que están    
almacenados en el GER 1500 se sobre escribirán, si coinciden con el número de una medición
anterior).
En modo REF se hace el escaneo sobre el espectralón, sobre el mismo ángulo que el de la          
medición objetivo (Mobley, 1999), a 45° y evitando cualquier sombra. Para garantizar que el
ángulo es el adecuado se recomienda el uso de un transportador (figura 11).
A continuación con las flechas up y down se selecciona el modo TARGET.
Se deben hacer 5 mediciones para la radiancia del agua, (Lw) con un ángulo de 45°.
Se deben hacer 5 mediciones para la Radiancia del cielo (Ls), el espectroradiómetro apuntando
al cielo con un ángulo de 45°.
Para cada serie de datos se calcula la media y la desviación estándar (Lw, Ls y Ed) y se aplica
el cálculo descrito en el inciso C del apartado superior.
Nota: Es importante cerciorarse de escuchar el click después de cada escaneo
Estas mediciones se basan en la reflectancia hemisférica-direccional y considerando un ángulo de 45°
para la obtención de la constante de fresnel (0.028) (Goodman, 2004).
Las mediciones sub-superficiales eliminan el efecto del sun glint. Se recomienda explorar la toma de
mediciones sub-superficiales
vii. Consideraciones generales
Tamaño y área de iluminación. Cuando se utiliza la luz del sol se requiere que el área de vista del     
espectroradiómetro corresponda exactamente con la superficie de interés, para evitar interferencia de    
otras superficies (Goodman, 2004). Esto puede determinarse en función del campo de vista.
76
Campo de vista (Field of view) (FOV). Es una medida angular del campo que percibe el GER 1500. Este
confina el área circular de la superficie medida por el instrumento a una distancia dada (Holden &
LeDrew, 2001).
r = d * tan (FOV/2)
r = radio del campo de vista.
d = distancia o altura sobre el fondo.
FOV es el campo de vista del sensor en unidades de °.
El tiempo de integración dependerá de las condiciones de iluminación. En el caso del GER 1500 se
puede hacer de manera automática. El instrumento compensará en función de la exposición de luz.
Muller, et al. (2003) recomiendan un tiempo de integración más prolongado para la superficie del
océano (1 segundo), el cual permita integrar los posibles errores instantáneos por el movimiento de la
superficie del mar.
Es importante anotar en la bitácora el conteo de escaneos por estación, por ejemplo:
Llevar un registro de track 1 al 5 Estación 1, 6 al 10 Estación 2 y así sucesivamente.
Hacer anotaciones sobre las condiciones del agua y el cielo. El acervo fotográfico puede ser muy útil.
La superficie del agua debe estar en calma y con cielo despejado.
El procedimiento no debe tardar más de 20 minutos, debe tratar de hacerse rápido sin comprometer la
calidad de las mediciones. La velocidad entre las mediciones en una misma estación es muy
importante ya que se debe procurar que las condiciones de iluminación sean constantes.
3. Resultados de la medición de espectros en campo
Entre el 28 de junio-4 julio de 2019 se capturaron, en estaciones in situ, con el espectrorradiómetro         
GER-1500, un total de 1638 espectros de diferentes ambientes superficiales. Estaba previsto regresar     
durante el año 2020 para hacer más registros de firmas espectrales pero fue imposible debido a las
complejas condiciones epidemiológicas durante dicho año. A los efectos de este proyecto se
presentan firmas correspondientes a las siguientes condiciones:
Sargazo en la superficie del mar
Aguas limpias someras
Aguas limpias profundas
Arena limpia
Arena cubierta de sargazo en la playa con diferentes estados de degradación
Siguiendo la metodología explicada anteriormente fueron capturados más de 50 registros en cada
estación (en 3 filamentos de sargazo se tomaron más de 400 registros) para obtener un número      
suficiente de espectros de cada objeto, de forma tal que podamos hacer un análisis estadístico         
representativo de cada uno.
A continuación, se presenta la tabla con toda la información referente a las estaciones donde se
realizaron las mediciones con el espectrorradiómetro y posteriormente un esquema con la ubicación
de dichas estaciones. Finalmente, a modo de ejemplo se presentan los espectros medidos sobre 5
77
objetos: sargazo en aguas oceánicas, sargazo en aguas costeras, sargazo sobre la arena, aguas
oceánicas limpias y aguas someras limpias. Los espectros se acompañan de una fotografía
panorámica del lugar donde fueron medidos, así como de una gráfica adicional con el espectro medio
y la desviación estándar. La base de datos con la totalidad de las firmas espectrales medidas se
denomina EcoEspectra y podrá consultarse en línea desde la plataforma SIMAR en el módulo creado
para tal fin.
Datos de las estaciones donde se realizaron las mediciones de los espectros
78
Ubicación de las estaciones donde se realizaron las mediciones de los espectros
79
80
81
 
82
83
84
4. Perspectivas y oportunidades de la espectrometría
Las mediciones obtenidas a partir del espectrorradiómetro de campo son esenciales en aplicaciones
oceanográficas. Estas mediciones entre otras aplicaciones son muy útiles para:
La calibración y validación de modelos de estimación de componentes ópticos del agua a      
través de técnicas de percepción remota, identificando longitudes de onda susceptibles de análisis       
para discriminación de componentes en la columna de agua.
La caracterización y clasificación de ecosistemas bentónicos someros. Si consideramos que
cada tipo de superficie béntica tiene un comportamiento espectral específico, la espectrorradiometría
in situ nos permite conocer las respuestas espectrales de los diferentes tipos de sustrato. A partir del
reconocimiento de estas propiedades espectrales, es que se puede asociar con la respuesta de los
sensores satelitales y así mapear grandes extensiones a partir de información de campo sobre
algunos puntos. Algunos métodos de clasificación como Spectral angle mapper o Spectral
information divergence (SID) se basan en la comparación del espectro de los pixeles en la imagen con
un espectro conocido (biblioteca espectral), generalmente obtenido bajo condiciones ideales en el
campo o en el laboratorio.
La calibración de correcciones atmosféricas. El problema de asociar mediciones satelitales
con mediciones en campo no es trivial, sin embargo, para fines de normalización de las imágenes,         
generalmente se hacen mediciones de superficies planas, pseudo-invariantes y cuasi-lambertianas
(como el asfalto o algunos techos extensos), y entonces se construye una línea de regresión entre las
mediciones de campo y las mediciones del satélite para luego aplicarle los coeficientes a los DNs de
las imágenes (Silván, 2012, comunicación personal).
La validación de correcciones por columna de agua. Los datos espectroradiométricos
generados in situ pueden ayudar a conocer el comportamiento de la columna de agua, si se hacen
mediciones superficiales y mediciones en fondo.
La espectrometría constituye una potente herramienta de apoyo a las técnicas de percepción remota,
la cual actualmente se encuentra en constante desarrollo.
5. Referencias
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Remote Sensing.
 
87
ANEXO 2.2.1.
Plantilla ejemplo de reporte semanal como parte del Sistema Satelital de Alerta Temprana
de Sargazo (SATsum - SIMAR)
Sistema Satelital de Alerta Temprana de Sargazo (SATsum)
Satellite-based early warning of Sargassum system
Boletín semanal de Alerta Regional de Sargazo flotante por Satélite (R-FSA)
Weekly Regional Alert Bulletin for floating Sargassum by Satellite (R-FSA)
Región: Mar Caribe |Region: Caribbean Sea
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Semana reportada | Reported week: SS / AAAA (DD/MM – DD/MM)
Máximo del Índice Alternativo de Algas Flotantes semanal – Aqua/MODIS/Aqua (Max-W-AFAI-Aqua)
Maximum Weekly Alternate Floating Algae Index – Aqua/MODIS (Max-W-AFAI-Aqua)
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Calculado a partir del valor máximo del Índice Alternativo de Algas Flotantes diarios (AFAI-Aqua)
acumulado para los últimos siete días de la semana, asociados a la presencia de sargazo pelágico
flotante y estimados a partir de los pasos diarios del sensor satelital MODIS Aqua a 1 km.
Calculated from the maximum value of the daily Alternative Floating Algae Index (AFAI-Aqua)
accumulated for the last seven days of the week, associated with the presence of floating pelagic
sargassum and estimated from the daily steps of the MODIS Aqua satellite sensor at 1 km.
Cobertura potencial estimada de sargazo flotante semanal basado en AFAI - Aqua/MODIS
(DSC-W-Aqua)
Weekly Floating Sargassum Estimated Potential Coverage based on AFAI - Aqua/MODIS (DSC-W-Aqua)
Se genera a partir de los valores significativos del Máximo del Índice Alternativo de Algas Flotantes
semanal – MODIS/Aqua (Max-W-AFAI-Aqua).
89
Área estimada con cobertura de sargazo para la región del Mar Caribe | Estimated area with coverage
of sargassum for the Caribbean Sea region: XXX km2
Condiciones oceánicas y atmosféricas que influyen en el desplazamiento del sargazo flotante para
el día de la generación del reporte: Viento superficial para el Mar Caribe
Oceanic and atmospheric conditions that influence the movement of floating sargassum for the day of
the report generation: Surface wind for the Caribbean Sea
asado en un modelo de viento superficial GFS de la NOAA a 22 km | Based on a NOAA GFS surface
wind model at 22 km
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Reporte elaborado por la Subcoordinación de Monitoreo Marino de la Conabio,
México
Report prepared by the Marine Monitoring Subcoordination of the Conabio, Mexico
https://simar.conabio.gob.mx/
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Chapter
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The application of ocean color remote sensing in coastal waters includes the ability to retrieve various seawater constituents such as chlorophyll, colored dissolved organic matter and suspended sediment concentrations. However, many of the bio-optical and empirical models have been developed mainly for oceanic or the relatively simple Case 1 waters and their application to the optically complex Case 2 waters present many challenges. In this study, we described some of these bio-optical models and assessed their use in coastal waters. A review of bio-optical studies conducted in some coastal waters indicated close linkages between physical and bio-optical properties. As expected, absorption and scattering properties of seawater constituents in coastal waters were observed to be more complex than oceanic Case 1 waters. Scattering and backscattering of particles have been the least studied and new optical instruments provide the potential to obtain a greater understanding of this optical variable and its role in determining ocean color in coastal waters. The spectral composition and intensity of the light field is strongly influenced by the seawater constituents and are reflected in the derived AOPs of diffuse attenuation coefficients and remote sensing reflectance. With increasing number of operational ocean color satellites and improvements in atmospheric correction algorithms, better satellite estimates of water-leaving radiance or remote sensing reflectance are now being obtained. The ability to invert these signals to obtain reliable estimates of the IOPs and seawater constituents is still a major challenge for optically complex coastal waters. While standard empirical ocean color algorithms are being used to obtain estimates of chlorophyll concentrations, a few studies have demonstrated the need for regional empirical algorithms to locally optimize such estimates. Increasing such bio-optical studies is the key to better utilization of ocean color satellite data for coastal waters.
Article
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A large data set containing coincident in situ chlorophyll and remote sensing reflectance measurements was used to evaluate the accuracy, precision, and suitability of a wide variety of ocean color chlorophyll algorithms for use by SeaWiFS (Sea-viewing Wide Field-of-view Sensor). The radiance-chlorophyll data were assembled from various sources during the SeaWiFS Bio-optical Algorithm Mini-Workshop (SeaBAM) and is composed of 919 stations encompassing chlorophyll concentrations between 0.019 and 32.79 μg L-1. Most of the observations are from Case I nonpolar waters, and ~20 observations are from more turbid coastal waters. A variety of statistical and graphical criteria were used to evaluate the performances of 2 semianalytic and 15 empirical chlorophyll/pigment algorithms subjected to the SeaBAM data. The empirical algorithms generally performed better than the semianalytic. Cubic polynomial formulations were generally superior to other kinds of equations. Empirical algorithms with increasing complexity (number of coefficients and wavebands), were calibrated to the SeaBAM data, and evaluated to illustrate the relative merits of different formulations. The ocean chlorophyll 2 algorithm (OC2), a modified cubic polynomial (MCP) function which uses Rrs490/Rrs555, well simulates the sigmoidal pattern evident between log-transformed radiance ratios and chlorophyll, and has been chosen as the at-launch SeaWiFS operational chlorophyll a algorithm. Improved performance was obtained using the ocean chlorophyll 4 algorithm (OC4), a four-band (443, 490, 510, 555 nm), maximum band ratio formulation. This maximum band ratio (MBR) is a new approach in empirical ocean color algorithms and has the potential advantage of maintaining the highest possible satellite sensor signal: noise ratio over a 3-orders-of-magnitude range in chlorophyll concentration.
Data
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A major problem for mapping shallow water zones by the analysis of remotely sensed data is that contrast effects due to water depth obscure and distort the special nature of the substrate. This paper outlines a new method which unmixes the exponential influence of depth in each pixel by employing a mathematical constraint. This leaves a multispectral residual which represents relative substrate reflectance. Input to the process are the raw multispectral data and water attenuation coefficients derived by the co-analysis of known bathymetry and remotely sensed data. Outputs are substrate-reflectance images corresponding to the input bonds and a greyscale depth image. The method has been applied in the analysis of Landsat TM data at Hamelin Pool in Shark Bay, Western Australia. Algorithm derived substrate reflectance images for Landsat TM bands 1,2, and 3 combined in color represent the optimum enhancement for mapping or classifying substrate types. As a result, this color image successfully delineated features, which were obscured in the raw data, such as the distributions of sea-grasses, microbial mats, and sandy area.
Article
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Remote sensing technology has many attributes that would be beneficial to monitoring submerged coral reef ecosystems, such as the ability to revisit a large study area repetitively and consistently without the necessity of large teams of field researchers. One limiting factor, however, is the difficulty in accounting for the variable effects of the water column on the optical reflectance characteristics of submerged features. These variable water column effects have been observed as depth, bottom-type, and wavelength dependent; such complex modifications limit the accuracy of remote identification of submerged coral reef features. In a preliminary attempt to examine the extent of the problem in a complex coral reef ecosystem, in situ hyperspectral reflectance measurements were collected in the U.S. Virgin Islands at various depths over different substrate types in water of consistent optical quality. A comparison is made between hyperspectral reflectance measured at the top and bottom of the water column in different water depths over different substrate types in an effort to alert users of remotely sensed data of the potential problems of identifying submerged features without appropriate corrections. While most coral reef remote sensing projects assume vertical and horizontal homogeneity of water optical properties and consider variation in optical reflectance representative of change in bottom type, this preliminary study reveals that the case is more complex and appreciable effort must be made to correct for the effects of the water column for accurate identification of submerged features.
Article
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The Space Information Laboratory (SIL) of the Tropical Center for Earth and Space Studies of the University of Puerto Rico at Mayagüez (UPRM) has been collecting and processing satellite data since December of 1996. Satellite imagery from the Advanced Very High Resolution Radiometer (AVHRR) and the Sea viewing Wide Field of view Sensor (SeaWiFS) provides us with a new understanding of phytoplankton dynamics in the Caribbean region. SeaWiFS shows the intrusion of waters into the eastern Caribbean Sea from the Orinoco River during fall and from the Amazon River during spring–summer. Strong coastal upwelling in Venezuela produced by the trade winds during winter–spring is detected with the AVHRR. The satellite data suggest that these seasonal events may play an important role in phytoplankton fertilization of the eastern Caribbean Sea. SeaWiFS and hydrological data are also combined to evaluate the impact of hurricanes on phytoplankton distribution. The development of models for estimation of ocean primary productivity using SeaWiFS and AVHRR data is now in progress.
Article
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Sun glint, the specular reflection of light from water surfaces, is a serious confounding factor for remote sensing of water column properties and benthos. This paper reviews current techniques to estimate and remove the glint radiance component from imagery. Methods for processing of ocean color images use statistical sea surface models to predict the glint from the sun and sensor positions and wind data. Methods for higher resolution imaging, used in coastal and shallow water mapping, estimate the glint radiance from the near-infrared signal. The effects of some current methods are demonstrated and possibilities for future techniques are briefly addressed.
Article
The occurrence of an episodic chlorophyll plume detected on the West Florida Shelf between 1979 and 1986 was confirmed in March 1995 with shipboard data and in March 1998 with new ocean color data from the SeaWiFS sensor. New evidence is presented to support the hypothesis that diatom blooms off Apalachicola Bay are the precursor of the seasonal West Florida Shelf plume, and that the nutrient requirements for such blooms, especially silicate, can be supported by river discharge. The observations indicate that the impact of rivers is maximal over the middle shelf and decreases over the outer shelf. Salinity and discharge measurements support the concept that the Apalachicola River had a major impact at distances exceeding 100km from the coast and that it plays an important role in the formation of offshore blooms. Preliminary analyses suggest that successional processes lead to cryptophytes dominating in the offshore blooms.
Article
Effective identification and mapping of coral reef benthic communities using high-spatial and -spectral resolution digital imaging spectrometry requires that the different communities are distinguishable by their spectral reflectance characteristics. In Kaneohe Bay, Oahu, Hawaii, USA, we collected in situ a total of 247 spectral reflectances of three coral species (Montipora capitata, Porites compressa, Porites lobata), five algal species (Dictyosphaeria cavernosa, Gracilaria salicornia, Halimeda sp., Porolithon sp., Sargassum echinocarpum) and three sand benthic communities (fine-grained carbonate sand, sand mixed with coral rubble, coral rubble). Major reflectance features were identified by peaks in fourth derivative reflectance spectra of coral (at 573, 604, 652, 675 nm), algae (at 556, 601, 649 nm) and sand (at 416, 448, 585, 652, 696 nm). Stepwise wavelength selection and linear discriminant function analysis revealed that spectral separation of the communities is possible with as few as four non-contiguous wavebands. These linear discriminant functions were applied to an airborne hyperspectral image of a patch reef in Kaneohe Bay. The results demonstrate the ability of spectral reflectance characteristics, determined in situ, to discriminate the three basic benthic community types: coral, algae and sand.
Article
An assessment of the bi-directional reflectance distribution function (BRDF) of corals with different morphologies was undertaken using hyperspectral reflectance measurements. The highest variance in reflectance obtained at different viewing angles was found for the open branching Acropora colony, possibly attributed to branch orientation and internal shadow distribution. Spectral separation within and between features at the nominated sensor-viewing angles was greatest in the near infrared portion of the spectrum. The analysis of coral reef bi-directional reflectance properties and degree of internal shadowing holds potential for future assessment and information extraction relating to coral structural characteristics.