Content uploaded by Alexey Seregin
Author content
All content in this area was uploaded by Alexey Seregin on Sep 13, 2019
Content may be subject to copyright.
Москва против
мегаполисов мира:
чемпионат мира по
документации городского
биоразнообразия
LICENSED UNDER CC0!
Алексей Серёгин
МГУ им. М.В. Ломоносова
Фестиваль РГО в Зарядье (Москва), 13 сентября 2019 г.
Об авторе
Алексей Петрович Серёгин
доктор биологических наук
ведущий научный сотрудник Гербария МГУ
место работы: Биологический факультет, МГУ им. М.В. Ломоносова
научный руководитель Цифрового гербария МГУ
администратор портала «Флора России» на платформе iNaturalist
Победитель Премии РГО 2018 г. в номинации «Лучший научный проект»
О чём эта лекция?
О предстоящем событии! Вы еще не опоздали
Что такое «гражданская наука» и как любой человек превращается в
учёного?
Что получается, если биологию, географию и информатику соединить
в одну научную дисциплину?
Откуда берутся «большие данные» о птицах, растениях и грибах?
Что будет, если разрешить в социальной сети постить только
фотографии живых организмов?
Почему скоро каждый школьник будет знать слово iNaturalist?
Какие правила у City Nature Challenge 2020 и почему Москва может
победить, участвуя в первый раз?
3
4
Гражданская ботаника
Как любители действительно любят науку
5
Математик В.Я. Цингер и его «Сборник
сведений о флоре…» (1885)
6
Гербарий В.Я. Цингера в МГУ:
более 12 тыс. образцов
7
Любитель (!) Д.П. Сырейщиков
и его гербарий
8
Любители Экхарт и Рита Виллинги
на 4.06.2018 собрали 293 333 образца
9
Гербарная папка vs. Цифровая камера
10
Информатика биоразнообразия
= биология + география + информатика
11
Журнал «Science» (2000)
12
GBIF:
Global Biodiversity Information Facility
13
GBIF-карта: более 1 миллиарда точек
14
Все данные в GBIF по годам
15
Все данные: max. 125,640,610 (за 2018 год)
Гербарные образцы: max. 814,272 (за 1985 год)
Почему столь быстро растёт число
данных о биоразнообразии?
Есть догадки?
16
Может, дело в новых технологиях?
17
GPS-трекеры на крупных
перелетных птицах GPS-трекеры на откармливающихся
по полгода пингвинах
Нет, дело в людях!
Статистика GBIF за 2018 год:
Human observation 125 140 744
Preserved specimen 278 742
Machine observation 154 175
Living specimen 35 603
Material sample 19 514
Fossil specimen 5 541
18
За 2018 год e-данных
о биоразнообразии
собрано больше,
чем за всю историю
естествознания от
Линнея до 1981 года
Наблюдения, сделанные людьми за 20 лет (1999–2018)
Большие базы данных наблюдений:
все организмы
19
Только за один год (2018)
Большие базы данных наблюдений:
растения
20
Только за один год (2018)
Большие базы данных наблюдений:
млекопитающие
21
Только за один год (2018)
Большие базы данных наблюдений:
рептилии
22
Только за один год (2018)
Большие базы данных наблюдений:
насекомые
23
Только за один год (2018)
Большие базы данных наблюдений:
грибы и лишайники
24
Только за один год (2018)
Почему столь быстро растут
данные о биоразнообразии?
Потому что есть iNaturalist!
А в iNaturalist есть натуралисты!
25
Что такое iNaturalist?
26
Что такое iNaturalist?
27
История iNaturalist: Беркли у истоков
iNaturalist.org появился в 2008 г. как диплом студентов Беркли (Нейт Эгрин,
Джессика Клайн, Кеничи Уеда)
Позднее Нейт Эгрин и Кеничи Уеда продолжили работу над сайтом с
веб-разработчиком Сином Макгрегором.
В 2011, Кеничи Уеда начал сотрудничество со Скотом Лоури, научным
сотрудником Стэнфордского университета, который в Беркли читал
лекции. Сейчас Уеда и Лоури на равных являются директорами iNaturalist.
Уже как организация iNaturalist вошел в состав Академии наук
Калифорнии 24 апреля 2014.
В2014, на iNaturalist пользователи загрузили 1,000,000-е наблюдение.
В2017, iNaturalist получил статус «совместной инициативы» Академии наук
Калифорнии и Национального географического общества (США).
В 2019, iNaturalist отпраздновал 25,000,000-е наблюдение!
28
Глобальная статистика iNaturalist: точки
29
iNaturalist за один день (5.09.2019)
30
Глобальная статистика iNaturalist: виды
31
Семья iNaturalist: топ-21 стран
32
Рост iNaturalist за последний год
33
Рост iNaturalist в России по месяцам
34
Что такое iNaturalist?
На самом деле
35
iNaturalist как социальная сеть
36
iNaturalist как личный архив
37
iNaturalist как технологический лидер:
нейронная сеть для определения фото
38
iNaturalist как инструмент для работы
39
iNaturalist как источник научных данных
40
iNaturalist как поставщик в GBIF
41
iNaturalist как место встреч с учёными
42
iNaturalist как конструктор своего
сайта (проекты в iNaturalist)
43
44 iNaturalist как конструктор своего
сайта (проекты в iNaturalist)
City Nature Challenge
[город] [природа] [вызов]
Самый большой биоблиц мира
45
Биоблицы
46
Зарождение City Nature Challenge 2016
47
Alison Young (California
Academy of Sciences)
Lila Higgins (Natural
History Museum of Los
Angeles County)
2 города
1 страна
City Nature Challenge 2017
48
16 городов
1 страна
49 City Nature Challenge 2018
68 городов
5 континентов
50 City Nature Challenge 2019
159 городов
5 континентов
City Nature Challenge и данные в
iNaturalist по неделям
51
Россия ни разу не участвовала в
City Nature Challenge: почему?
52
Непопулярность платформы до самого последнего времени
В апреле на большей части страны едва начинается вегетация
Не находилось желающих организовать CNC
В 2020 году впервые в CNC примут участие три города-героя
Москва
Севастополь
Курск
City Nature Challenge 2020
Правила челленджа
53
Только четыре апрельских дня
24–27 апреля 2020 г.: фотографируем и грузим на портал
28 апреля – 4 мая 2020 г.: грузим остатки и определяем
В ночь на 5 мая 2020 г. узнаем победителей!
54
Только на платформе iNaturalist
City Nature Challenge перерос iNaturalist – города-участники могут выбрать
любую имеющуюся платформу. Россия будет играть на iNaturalist!
55
Только дикие организмы
56
Нет домашним
животным
Нет комнатным
растениям
Нет наблюдениям
Homo sapiens Нет регулярному
городскому озеленению
В зоопарки и ботанические сады лучше в эти дни не заглядывать!
Кошечек и собачек не фотографировать!
Берёзки и ёлочки, посаженные рядами, считать культурными!
Только в пределах города
Москва в границах
субъекта Федерации
Около 2000 видов
сосудистых растений
Свыше 50% -леса
и лесопарки
57
Как принять участие в
City Nature Challenge 2020?
Краткая инструкция с картинками
58
Участие бесплатное и добровольное
59
Особенности регистрации
60
Зарегистрироваться в iNaturalist с почтой mail.ru и yandex.ru нельзя.
Приложение или сайт
61
Количество данных:
чем выше плотность, тем лучше
62
Точки встреч канарской финиковой пальмы в г. Олбери
(Нов. Южный Уэльс, Австралия)
Качество данных:
плохие фото никто не определит!
63
Укажите свободную лицензию
Свободные лицензии (CC0, CC-
BY, CC-BY-NC) открывают
возможности импорта данных
на другие ресурсы (например,
GBIF или Википедия).
Несвободные лицензии
ограничивают использование
Вашего контента (прежде всего,
научное).
Отсутствие лицензии («все права
защищены») запрещает
использование контента.
64
Обязательные требования для
загрузки фотографий на CNC 2020
Регистрация на платформе iNaturalist (единая для приложения и сайта)
Объединение нескольких фотографий одного вида из одного места, снятых
в один день, в одно «наблюдение» (особенно «запчасти» одного экземпляра
или случай группового и одиночного фото из одной популяции)
Пометка, что животное содержится в неволе, а растение в культуре, если
снят объект, который не являются частью дикой природы
Указание места съемки (автоматическое у современных гаджетов) – точка
должна оказаться в границах Москвы
Хотя бы предварительное определение («Гриб», «Растение», «Животное» и
т.п.)
При выполнении этих условий наблюдение автоматически попадает в проект
«City Nature Challenge 2020: Moscow, Russia».
65
Смартфон или фотоаппарат?
Преимущества смартфона
Есть почти у всех
Компактность
Координаты у фотографий
Возможность моментальной
загрузки через приложение
Всепогодность
Недостатки фотоаппарата
Преимущества фотоаппарата
Качество снимков в среднем
выше
Дальность съемки (птицы,
объекты за оградой)
Преимущество в макросъемке
Недостатки смартфона
66
Каждый участник – часть городской
команды
67
Число участников CNC 2019 среди самых активных городов
Подписаться, чтобы получать новости
68
Всем спортсменам нужны
тренировки
Будущим участникам City Nature Challenge тоже!
69
Нужно приобрести личный опыт
70
Это личный опыт лектора: почти 12 тыс. наблюдений за 2019 год
Осень и зима – не время отдыхать
71
Это личный опыт лектора:
январские и февральские наблюдения
Россия среди лидеров iNaturalist, а
Москва – флагман в стране
72
Первое место в проекте «Флора России»
Второе место в проекте «Грибы России»
Наши задумки
Мы задумались над тем, чтобы внутри City Nature Challenge Moscow
проводить групповой зачет для желающих объединиться в небольшие
команды.
Мы попробуем провести пробный старт за неделю до соревнований,
чтобы получить бесценный опыт.
Мы надеемся организовать сопутствующие мероприятия: экскурсии,
мини-челленджи, конкурсы.
73
Россыпь сопутствующих событий:
пример г. Лестер (Великобритания)
74
Может ли Москва победить,
участвуя в первый раз?
Как и в Олимпийских играх, здесь разыгрывается несколько
«комплектов наград»
75
Зачёты City Nature Challenge
Этот биоблиц проводится в нескольких номинациях:
по числу наблюдений,
по числу обнаруженных видов,
по числу участников.
В этих же категориях проводится раздельный зачёт по климатическим
категориям "бореальных", "умеренных", "аридных" и "экваториальных"
городов.
Ещё подсчитывают долю наблюдений, которые определены в итоге до
вида (наблюдения «исследовательского уровня»).
Данные нормируются также на площадь города и на число жителей,
чтобы поддержать малые города.
В каждом городе есть личный зачёт по наблюдения и видам, а также
глобальный личный зачёт.
76
Сколько нужно наблюдений, чтобы
победить?
Сан-Франциско (2018)
Кейптаун (2019)
77
Сколько нужно наблюдений, чтобы
победить?
Наш прогноз на 2020 год:
67 500 наблюдений
+25% к результату города-победителя 2019 года
78
Знакомьтесь: Крис Финбош (ЮАР)
Чемпион 2019 г. в личном зачёте: 4 040
79
Знакомьтесь: Кай Рен Тан (Малайзия)
Чемпион 2018 г. в личном зачёте: 4 904
80
Сколько нужно человек, чтобы
победить?
Наш прогноз на 2020 год:
17 человек таких как Крис
или
14 человек таких как Кай
81
Активные пользователи в Москве
82
Всего:
1067 наблюдателей
В 2019 г. активны
760 наблюдателей
Москва в iNaturalist: 2018 vs. 2019
83
31.12.2018:
5,5 тыс. точек
11.09.2019:
31,5 тыс. точек
«Спящие» аккаунты в iNaturalist
Мировой опыт:
1 844 530 пользователей зарегистрировано (с 2008 г.)
1 108 258 пользователей не сделали ни одного наблюдения (60%)
Опыт «Флоры Москвы»:
638 наблюдателей в проекте «Флора Москвы» (существует с декабря 2018 г.)
283 человека сделали только одно наблюдение (44%)
84
Победители City Nature
Challenge 2019: общий зачёт
85
Победители City Nature Challenge
2019: относительные показатели
86
Победители City Nature Challenge
2019: по климатическим поясам
87
Почему City Nature Challenge так
важен для учёных?
Людей со смартфонами, больше чем биологов, экологов и
географов
88
Как растут данные во время CNC?
Пример GBIF
89
Все сведения из
GBIF: пик в мае
Сведения из GBIF
за 2019 год: пик в апреле
Учёные определяют наблюдения в
iNaturalist
90
С.Р. Майоров (МГУ)
Д.А. Бочков (МГУ)
Ю.В. Шнер (МГУ)
А.П. Серегин (МГУ)
Как растут данные во время CNC?
Пример города Тена (Эквадор)
91
До CNC 2019:
1,5 тыс. точек
После CNC 2019:
41 тыс. точек
Документация «краснокнижников»
92
КК КК
КК
Из 10 наиболее
снимаемых в апреле
видов растений три
включены в Красную
книгу Москвы
Динамика населения птиц
93
Неделя с 7апреля 2019 г.
Неделя с 14 апреля 2019 г.
Неделя с 21 апреля 2019 г.
Неделя с 28 апреля 2019 г.
11
11
Документация борщевика Сосновского
94
https://www.inaturalist.org/observations/22986781
Находки очень редких видов:
случайны, но возможны!
95
Это личный опыт лектора:
находка цианобактерии Nostoc caeruleum
(6-я точка в GBIF)
Документация фенофаз
96
Неделя с 7апреля 2019 г.
Неделя с 14 апреля 2019 г.
Неделя с 21 апреля 2019 г.
Неделя с 28 апреля 2019 г.
11
11
City Nature Challenge Moscow 2020:
нам нужны участники
До челленджа:
Те, кто будет нести слово (лекторы, педагоги, медийщики)
Те, кто будет делать красиво (дизайнеры)
Те, кто будет бесплатно размещать рекламу (медийные партнёры)
Те, кто будет переводить методички (переводчики)
97
City Nature Challenge Moscow 2020:
нам нужны участники
Во время челленджа:
Те, кто будет фотографировать много (наблюдатели-любители)
Те, кто будет фотографировать интересно (профессионалы-полевики)
Те, кто будет развлекать народ 4 дня челленджа (организаторы сопутствующих
мероприятий)
98
City Nature Challenge Moscow 2020:
нам нужны участники
После челленджа:
Те, кто будет определять фотографии (учёные-биологи)
Те, кто будет в итоге надувать щёки (организации-партнёры)
99
О чём была эта лекция?
О предстоящем событии! Вы еще не опоздали
Что такое «гражданская наука» и как любой человек превращается в
учёного?
Что получается, если биологию, географию и информатику соединить
в одну научную дисциплину?
Откуда берутся «большие данные» о птицах, растениях и грибах?
Что будет, если разрешить в социальной сети постить только
фотографии живых организмов?
Почему скоро каждый школьник будет знать слово iNaturalist?
Какие правила у City Nature Challenge 2020 и почему Москва может
победить, участвуя в первый раз?
100
Сфотографируйте этот слайд!
http://www.citynaturechallenge.org/ (глобальный сайт челленджа)
https://www.inaturalist.org/ (платформа iNaturalist)
https://www.inaturalist.org/projects/city-nature-challenge-2020-
moscow-russia (табло соревнований)
https://vk.com/mw_herbarium/ (паблик Цифрового гербария МГУ)
https://plant.depo.msu.ru/ (Цифровой гербарий МГУ)
101
102
Спасибо за
внимание!