The purpose of this study is to determine the level of contamination of lagoons Aghien and Potou by pesticides in aim to their use for drinking water production. The extraction method with cartridge C-18 followed by gas chromatography phase dosage coupled to a mass spectrometer allowed to highlight lagoons Aghien and Potou waters pollution by pesticides. Four families of pesticides constituted by triazines and metabolites, substituted ureas, carbamates and convulsivants were detected in both lagoons in concentrations widely superior to WHO guide values.In the lagoon Aghien, the respective averages of triazines and metabolites, substituted ureas, carbamates and convulsivants are 36.53 µg/L, 121.61µg/L, 1.09µg/L and 15µg/L and in lagoon Potou, they are 95.75µg/L, 283.67µg/L, 11.5µg/L et 172.80µg/L.The average of the total molecules detected is 72.43µg/L and 163.43µg/L respectively in the lagoon Aghien and in the lagoon Potou. Leaching waters of farmland bordering the lagoons, tributaries streams and wind are the main modes of transport of pesticides. The unofficial circuits of pesticides supply and the failure to respect the technical itineraries of products use contribute to aggravate pollution. Lagoons Aghien and Potou are unsuited to drinking water production. In view of their use, good agricultural practices are to be promoted in the region. RESUME L'objectif de cette étude est de déterminer le niveau de contamination des lagunes Aghien et Potou par les pesticides en vue de leur utilisation pour la production d'eau potable. La méthode d'extraction avec cartouche C-18 suivie du dosage par chromatographie en phase gazeuse couplée à un spectromètre de masse a permis de mettre en évidence la pollution des eaux des lagunes Aghien et Potou par des pesticides. Quatre familles de pesticides constituées de triazines etmétabolites, urées substituées, carbamates et convulsivants ont été détectées dans les deux lagunes à des concentrations largement supérieures aux valeurs guides de l'OMS. Dans la lagune Aghien, les moyennes respectives de triazines et métabolites, urées substituées, carbamates et convulsivants sont de 36,53µg/L, 121,61µg/L, 1,09µg/L et 15µg/L et dans la lagune Potou, elles sont de 95,75µg/L, 283,67µg/L, 11,5µg/L et 172,80µg/L. La moyenne du total des molécules détectées est de 72,43 µg/L et de 163,43 µg/L, respectivement dans la lagune Aghien et dans la lagune Potou. Les eaux de lessivage des terres agricoles qui bordent les lagunes, les cours d'eau tributaires et le vent sont les principaux moyens de transport des pesticides. Les circuits parallèles d'approvisionnement en pesticides et le non-respect des itinéraires techniques d'utilisation des produits contribuent à aggraver la pollution. Les eaux lagunaires d'Aghien et de Potou sont inaptes pour la production d'eau potable. Dans l'optique de leur utilisation, de bonnes pratiques agricoles sont à promouvoir dans la région.