Nikita Khromov-Borisov

Nikita Khromov-Borisov
First Pavlov State Medical University Of St Petersburg | SPbGMU · Physics, Mathematics and Informatics

PhD

About

103
Publications
29,331
Reads
How we measure 'reads'
A 'read' is counted each time someone views a publication summary (such as the title, abstract, and list of authors), clicks on a figure, or views or downloads the full-text. Learn more
291
Citations
Citations since 2016
43 Research Items
103 Citations
201620172018201920202021202205101520
201620172018201920202021202205101520
201620172018201920202021202205101520
201620172018201920202021202205101520
Additional affiliations
June 2010 - present
R.R. Vreden Russian Research Institute of Traumatology and Orthopaedics
Position
  • Scientific Editor
May 1996 - December 2000
Universidade Federal do Rio Grande do Sul
Position
  • Visiting REsearcher
June 1967 - December 2000
Leningrad State University
Position
  • Senior Researcher

Publications

Publications (103)
Article
A convenient tabular format for the description of statistical methods and software in scientific publications is proposed. It is recommended to include the name of the software, its version or update date, the name of the procedures used and their intent, obligatory references, and URL.
Article
The concepts of release activity, supramolecular matrices, and spatial homeostasis, put forward by RAS Corresponding Member O.I. Epshtein, come into irresolvable contradiction with the fundamental provisions of physics and chemistry on the atomic and molecular structure of substances and their solutions. They are recognized as pseudoscientific, and...
Method
Full-text available
This is HTN-specific patient-reported outcome measure. It was fully validated with high internal\external validity and also a high reliability. Now it is in English. The instructions are pretty easy: The answers to questions are rated by Likert-type from 1 (worst-case scenario) to 5 (best-case scenario). One have to sum up all points in each Fac...
Article
Full-text available
Концепции “релиз-активности”, “супрамолекулярных матриц” и “пространственного гомеостаза”, выдвинутые членом-корреспондентом РАН О.И. Эпштейном, вступают в неразрешимое противоречие с фундаментальными положениями физики и химии об атомно-молекулярной структуре веществ и их растворов. Они признаны лженаучными, и об их несостоятельности говорится во...
Presentation
Full-text available
Неустоявшаяся терминология: трудности перевода и адаптации. Теорема Бейза в действии. Вероятность позитива при наличии болезни, P(T+|D+) не есть вероятность болезни при наличии позитива, P(D+|T+). Два вида диагностических исследований: одновыборочное (когортное) и двухвыборочное (случаи-контроли). Проблема выбора контролей (проблема фенотипа). Ново...
Presentation
Full-text available
Применение адекватных статистических методов давно стало необходимым условием качественной научной работы и обязательным условием для публикации в научных изданиях. Основным результатом научного исследования должны быть статистические оценки размера эффекта с доверительными и предсказательными интервалами (ДИ и ПИ), а не p-значения. Крайне желате...
Article
Introduction Physical exercise (PE) is a necessary part in the treatment of patients with chronic heart failure (CHF), which is stated in the European Society of Cardiology guidelines and the Russian Heart Failure Society guidelines. However, this type of non-drug treatment is still not sufficiently used in HF patients in Russia. Aim To study the c...
Chapter
Full-text available
ноМенКлатура вариантов поСледовательноСтеЙ днК, рнК и белКов МЕЖДУНАРОДНЫЕ РЕКОМЕНДАЦИИ ПО ИХ ОПИСАНИЮ
Chapter
Full-text available
СтатиСтиКо-МетодолоГиЧеСКие аСпеКтЫ ГеноМиКи
Article
Full-text available
Aim. Health-related quality of life in patients with arterial hypertension (HTN) is still determined by only generic patient-reported outcome measures (PROMs), although disease-specific ones are more reliable and highly valid. Previously, we reported the results of development and item-selection process of the new Russian HTN-specific PROM. The pur...
Preprint
Full-text available
Aim . Health-related quality of life in patients with arterial hypertension (HTN) is still determined by only generic patient-reported outcome measures (PROMs), although disease-specific ones are more reliable and highly valid. Previously, we reported the results of development and item-selection process of the new Russian HTN-specific PROM. The pu...
Article
Full-text available
Aim. Improvement of the health-related quality of life (HRQoL) is one of the basic principles of value-based medicine. HRQoL could be assessed by the patient-reported outcome measures (PROMs) also in case of arterial hypertension (HTN). However for HTN patients only generic PROMs are still used. Previously the group of experts had created the prima...
Article
Full-text available
Plasma cells are often considered to be among important criteria in histological diagnosis of chronic endometritis (CE). Low plasma cell numbers in endometrial stroma, uneven distribution and similarity to the cells of cytogenic endometrial stroma represent difficulties with their identification by routine histological methods of study, and their a...
Method
Full-text available
Статистический контроль качества диагностичексих тестов с бинарными исходами
Method
Full-text available
DiagStat - statistical quality control of diagnostic tests with the binary outcomes
Article
Full-text available
От редакции. Согласно мировому соглашению по делу № А40−148 616/18−110−1115, утвержденному 05.04.2019 Арбитражным судом г. Москвы (http://kad.arbitr.ru/PdfDocument/a74a5f06-fff8−4b4a-b5c0−3f97c33d36c1/8794a7c3−31ae-4f44-b5f5−5cd814a4d19d/A40−148 616−2018_20 190 405_Opredelenie.pdf), публикуем вариант статьи с внесенными редакционными изменениями. С...
Technical Report
Full-text available
Based on our findings we recommend either a retraction of this article or a correction stating that Subetta did not exert an antidiabetic effect in diabetic Goto-Kakizaki rats in this study
Article
During the last fifteen years, numerous peer-reviewed journals published articles about the incredible properties of so-called release-active “drugs” (RADs).1–24 It is claimed that these “drugs” are effective against tick-borne encephalitis, influenza, hemorrhagic fever with renal syndrome, meningococcal meningitis, herpes, HIV, and other viral and...
Conference Paper
Full-text available
Теория и практика медицины не должны противоречить естественнонаучным принципам и законам. Если в лекарственных препаратах отсутствуют молекулы действующего вещества, то в РКИ заведомо не должны проявляться какие-либо их лечебные свойства. Такими препаратами являются, например, так называемые «релиз-активные» препараты (Анаферон, Эргоферон и другие...
Conference Paper
Full-text available
Одной из причин кризиса воспроизводимыми результатов биомедицинских исследований является использование излишне снисходительного уровня статистической значимости нулевой гипотезы: α = 0,05 и пренебрежение интервальными оценками р-значений. Показано, что p > 0,005 обладают низкой предсказательностью и их следует избегать.
Article
Full-text available
На сегодня «генные ассоциаторщики» не несут ни моральной, ни юридической ответственности за свои предсказания. получается как с ГМО, только с противоположным знаком: ГМО мы бездумно запрещаем, а DCT (Direct-To-Consumer Test) столь же бездумно разрешаем. и нам еще предстоит серьезно продумать и осознать, какими могут быть последствия для здоровья че...
Article
Full-text available
6 февраля 2018 года Минобрнауки присудило Антипремию «за самый вредный лженаучный проект» научнопроизводственной фирме «Материя Медика Холдинг». Это не столько неприятный эпизод в карьере ее основного владельца, генерального директора и идейного вдохновителя — членкора РАН Олега Ильича Эпштейна, — сколько повод для серьезного разговора о неблагопол...
Article
Full-text available
Research objective was studying the failure of macrophage cytokine regulation in endometriosis pathogenesis. The contents of 28 macrophage cytokines (EGF, FGF-2, Flt-3 ligand, G-CSF, GM-CSF, IFNα2, IFNγ, IL-10, IL-12 (p40), IL-12 (p70), IL-13, IL-15, IL-1Ra, IL-1β, IL-3, IL-4, IL-6, IL-8, MCP-1, MCP-3, MIP-1α, MIP-1β, PDGF-AA, PDGF-AB/BB, RANTES, T...
Article
Full-text available
Удивительные метаморфозы происходят на наших глазах с некоторыми учеными. Так, подвизающийся на ниве околонаучной публицистики генетик Лев Анатольевич Животовский внезапно «мутировал» и, кажется, не способен «ревертировать». Он выпустил (уже двумя изданиями) возмутительно и непростительно скандальную брошюру «Неизвестный Лысенко» (Животовский, 2014...
Conference Paper
Вопреки заявлениям В.Х. Хавинсона и др. и рекламе в СМИ нет убедительных экспериментальных доказательств геропротекторной активности пептидов Хавинсона. Contrary to V.K. Khavinson et al. and advertising in the media there is no convincing experimental evidence of the geroprotective activity of the Khavinson peptides.
Article
Full-text available
Objectives: The choice of an optimal administration route for intraperitoneal (IP) chemotherapy and a suitable chemotherapeutic regime in the treatment of ovarian cancer remains a controversy. We investigated survival outcomes according to catheter intraperitoneal chemotherapy (CIPC), normothermic and hyperthermic chemoperfusion (NIPEC and HIPEC)...
Conference Paper
Full-text available
Бейзовский и частотнический (ортодоксальный, классический, традиционный) подходы носят взаимодополнительный (комплементарный) характер и совместно обеспечивают значительно лучшее понимание статистических проблем, чем каждый из них в отдельности (Lindley). Правильная оценка положения дел в статистической науке может быть получена только в результате...
Article
Full-text available
To study the possibility of using thrombin generation tests in platelet-rich and platelet-poor plasma for evaluation of dual antiplatelet therapy efficacy in patients with coronary artery disease (CAD), following percutaneous coronary intervention. Venous blood was analyzed from CAD patients aged 53-75 years who had undergone percutaneous coronary...
Article
Full-text available
A comparative statistical study of the results of eight independent experiments on the efficacy of intraperitoneal chemotherapy has been performed. The regiments of cathether intraperitoneal chemotherapy (CIPC), normothermic and hyperthermic chemoperfusion (NIPEC and HIPEC) with antitumor drug dioxadet were investigated in 288 female Wistar rats wi...
Article
Full-text available
В нашей российской медицине происходят чудеса. Авторитетный рецензируемый журнал «Успехи физиологических наук» публикует научную статью, где утверждается, например, что алкоголизм и наркоманию можно лечить гомеопатическими разведениями этанола и морфинов соответственно. Эти чудеса в последнее время все больше и больше привлекают к себе внимание спе...
Book
Full-text available
Бюллетень – продолжающееся издание Комиссии по борьбе с лженаукой и фальсификацией научных исследований при Президиуме РАН, которую возглавляет акад. Е.Б. Александров. Публикующиеся в нем статьи направлены на разоблачение псевдонауки, пропагандируемой безответственными средствами массовой информации. Наши авторы продолжают борьбу против лженаучных...
Article
Full-text available
Objectives: The purpose of this study was to develop a fast, comfortable, and safe method of ureteral stent removal in women. Methods: From February 2014 to July 2015, a retrospective multicenter controlled study including 82 female outpatients was conducted. The control group was composed of 46 patients who underwent stent removal using a 22F c...
Article
Full-text available
Корректный статистический анализ данных, опубликованных в журнале «Успехи геронтологии» И. В. Поляковой и соавт. (2014), убедительно свидетельствует, что, вопреки мнению авторов, распределения генотипов у жителей блокадного Ленинграда и у жителей Северо-Западного региона России статистически неразличимы по всем пяти изученным генам. Основными причи...
Article
Full-text available
When assessing the combined action of genes on the quantitative or qualitative phenotype we encounter a phenomenon that could be named the “paradox of the risk score summation.” It arises when the search of risk allele and assessment of their combined action are performed with the same single dataset. Too often such methodological error occurs when...
Presentation
Full-text available
Практическая нейтральность подавляющего большинства природных аллелей делают их абсолютно непригодными для диагностики и прогноза предрасположенности к болезням, профессиональных пригодностей, склонностей к занятиям спортом и прочим видам человеческой деятельности. Обсуждаемое явление можно назвать биологическим «принципом неопределенности», сдержи...
Article
Full-text available
Correct harmonized statistical re-analysis of the data published in this Journal by I.V.Polyakova et al. (2014) clearly shows that, contrary to the authors' opinion, the distribution of genotypes among residents of besieged Leningrad and the residents of the North-West region of Russia appeared to be statistically indistinguishable in all five gene...
Conference Paper
Full-text available
Poor reproducibility of the experimental results becomes a systemic problem in biomedicine. One of the main reasons for this is the inadequate statistical analysis. Current international recommendations (http://www.icmje. org/) call: «Avoid relying solely on statistical hypothesis testing, such as P values, which fail to convey important informatio...
Research
Full-text available
У больных раком СОПР при уровне экспрессии caspase 3 в первичном биоптате ниже 4 о. е. вероятность возникновения рецидива опухоли высокая; при уровне экспрессии caspase 3, равном или выше 4 о. е., вероятность рецидива рака СОПР низкая. 2. С использованием ROC-анализа установлено пороговое значение экспрессии для фермента ERCC1, участвующего в репар...
Research
Full-text available
Работа посвящена выявлению наиболее значимых биоло�гических маркеров клеточного цикла, характеризующих по�ведение опухоли, с целью прогноза клинического течения опухолевого процесса и индивидуализации схем лечения.
Research
Full-text available
Показатели теста генерации тромбина в богатой тромбоцитами плазме могут быть использованы для оценки действия двойной антиагрегантной терапии. Наиболее информативным показателем является скорость образования тромбина.
Presentation
Full-text available
Научно слабо обоснованные попытки практического использования плохо воспроизводимых результатов плохо спланированных исследований генетических «ассоциаций» для выявления и отбора (евгенической селекции) потенциальных элитных атлетов, как минимум, преждевременны. Пока что нельзя исключить, что такие действия принесут больше вреда, чем пользы. • Дай...
Presentation
Full-text available
Наука не всесильна, и ее прогресс обусловлен осознанием и признанием ее принципиальных запретов, иллюзий, скрытых ловушек и парадоксов. В геномике таковы: Парадокс генетической уникальности. Парадокс генетического разнобразия. Парадокс размытости фенотипов. Парадокс контрольной группы. Парадокс суммирования баллов генетичепского риска. Прадокс стат...
Article
Full-text available
This report provides information and brief description of current freely available computer programs for statistical analysis of the results in biomedical research.
Article
Full-text available
The analysis of the IFN-status of healthy full-term neonatal infants and their healthy mothers with modern statistical methods was conducted. It was established that the IFN status of healthy full-term neonatal infants differs from the same of their mothers with higher occurrence of IFNs and strengthened induced production of IFNα/β and IFNγ. The s...
Article
Full-text available
The aim of our study was to identify the most significant biological markers characterizing the behavior of the tumor and to forecast its clinical course and to specify an individual therapy regimen for each patient.
Article
Full-text available
A set of formulas for the indices of the performance and predictive ability of the binary genetic tests is presented. Their dependence on disease prevalence and the population frequency of a genetic marker is characterized. It is shown that a marker with the odds ratio OR < 2.2 has an initially low prognostic efficiency in every sense and at any fr...
Article
Full-text available
Poor reproducibility and low predictive values of the results in the genetics of predispositions become a systemic problem. Results of the statistical quality control of genetic tests in the study should be supported with not only integral indices such as odds ratios (OR), but with the post-test (posterior) predictive probabilities (PPV and NPV)...
Article
Full-text available
«Nothing in biomedicine makes sense except in the light of evolution». From this point of view, genetics of predispositions has to answer two basic questions: 1. Is the natural genetic polymorphism identified with modern genomics proved to be the result of neutral evolution or whether it is an aggravated genetic (mutation) load determining the su...
Article
Full-text available
Терминология и процедуры статистического контроля качества диагностических тестов нуждаются в уточнениях и переосмыслении. Результаты теста удобно называть кратко «позитивы» и «негативы». Набор показателей распознавательной и предсказательной способностей теста следует дополнить их противоположностями: контр-чувствительность, контр-специфичность, к...
Article
Full-text available
Современная прикладная статистика эволю ционирует в сторону бейзовской статистики. В этой связи приведены в систему соответствую щ ие формулы и алгоритмы, пригодны е для корректного бейзовского статистического контроля качества диагностических тестов с бинарными исходами.
Article
Full-text available
The expression of surface molecules in cord blood monocytes and placental macrophages was studied using flow cytometry. When compared with monocytes, macrophages presented a decrease in HLA-DR and LAP/TGF-β1 levels and increased expression of alternative activation markers, especially CD206. No difference in the production of the apoptotic factors...
Book
Full-text available
Пособие предназначено для студентов 1 и 2 курса лечебного, стоматологического, педиатрического факультетов, факультетов спортивной медицины, адаптивной физической культуры и психологии, изучающих медицинскую информатику в объеме учебной программы. Пособие может быть полезно студентам медицинских ВУЗов, которых интересуют современные способы автомат...
Article
Full-text available
A set of formulas for the indices of performance and predictive ability of the binary genetic tests is presented. Their dependence on disease prevalence and population frequency of a genetic marker is characterized. it is shown that a marker with the odds ratio OR < 2.2 has an initially low prognostic efficiency in every sense and at any frequencie...
Conference Paper
Full-text available
Найдено явное непрерывное выражение для распределения эпидемиологических оценок отношения рисков в четырехпольных методах, которое можно считать точным при довольно общих априорных предположениях. При сопоставлении однородных групп распределение работоспособно в широких условиях при изучении как редких, так и частых событий. Рекомендуемые интерваль...
Article
Full-text available
Research objective was studying the failure of macrophage cytokine regulation in endometriosis pathogenesis. The contents of 28 macrophage cytokines (EGF, FGF-2, Flt-3 ligand, G-CSF, GM-CSF, IFNα2, IFNγ, IL-10, IL-12 (p40), IL-12 (p70), IL-13, IL-15, IL-1Ra, IL-1β, IL-3, IL-4, IL-6, IL-8, MCP-1, MCP-3, MIP-1α, MIP-1β, PDGF-AA, PDGF-AB/BB, RANTES, T...
Article
Antigens of enteroviruses were detected quantitatively in the modified complement-binding reaction in blood samples from 102 of the 208 (49%) patients with ACS, in coronary artery tissues from 23 of 24 and heart from 51 of 94 (54.3%) patients with MI who died from cardiogenic shock and/or cardiac rupture. The relative level of enterovirus antigen (...
Conference Paper
Full-text available
Central dogma of molecular biology (CDMB) is one of the very few biological statements, which is rather nontrivial, and cannot be deduced from physical laws. Time to time, however, it is still not accepted by some authors up to the verdict that “it appeared to be more detrimental to biology than Lysencoism”. Controversies about CDMB are rather deba...
Article
Full-text available
Summary of allele counts for 10 STR loci: CSF1PO, D7S820, D13S317, F13A01, F13B, FESFPS, LPL, TH01, TPOX and vWA obtained by the seven laboratories in a countrywide Russian Caucasians is proposed as a reference population data set.
Article
Full-text available
Allele frequencies for polymarker, HLA-DQA1, Ig-JH, D17S30, ApoB and D1S80 loci and population genetic parameters were obtained from a sample of 501 unrelated individuals born in the northwestern Federal Region of Russia.
Article
Full-text available
Apomorphine (APO) is considered to be a classical mixed type dopamine D(1) and D(2) receptor agonist. It has been used in the therapy of Parkinson's disease and, more recently, for the treatment of erectile dysfunction. Like other catechols (e.g. dopamine), APO easily autoxidizes, producing quinone and semiquinone derivatives that may lead to the f...
Article
Full-text available
Polymorphism at the locus D1S80 was studied in 283 unrelated habitants of the Northwestern Federal Region of Russia that includes the cities Arkhangel'sk, Kaliningrad, Murmansk, Novgorod, Petrozavodsk, Pskov, Saint Petersburg and surrounding districts. The sample distribution obtained was compared with the published data on 128 worldwide samples fr...
Article
Full-text available
Threshold dose/concentration values, such as the lowest effective dose, minimum effective dose or the lowest effective concentration (LED, MED or LEC, respectively) are in use as an alternative to the mutagen potency measures based on the 'rate' measurements (e.g., the slope of the initial part of the dose-response curve). In this respect, several...
Article
Full-text available
The validity and applicability of the statistical procedure - similarity pattern analysis (SPAN) - to the study of mutational distributions (MDs) was demonstrated with two sets of data. The first was mutational spectra (MS) for 697 GC to AT transitions produced with eight alkylating agents (AAs) in the lacI gene of Escherichia coli. The second was...
Article
Full-text available
1,2:7,8-Diepoxyoctane (DEO), whose deletogenic activity was first demonstrated in ad-3 system of Neurospora crassa and then in different species, has been tested in Salmonella typhimurium tester strain TA102 (hisG428(Ochre)). It was confirmed that it is a direct acting mutagen and was found that its activity is stimulated with the S9 mix. Obtained...
Article
CTG trinucleotide repeat length polymorphism within the 3' region of the myotonin protein kinase I (MP-I) gene was examined with the use of the polymerase chain reaction (PCR) technique. A total of 159 DNA samples from healthy donors from five ethnic groups including Russians (n = 33), Azerbaijanians (n = 29), Uzbeks (n = 31), Moldavians (n = 31),...
Article
CTG trinucleotide repeat length polymorphism within the 3′ region of the myotonin protein kinase I (MP-I) gene was examined with the use of the polymerase chain reaction (PCR) technique. A total of 159 DNA samples from healthy donors from five ethnic groups including Russians (n = 33), Azerbaijanians (n = 29), Uzbeks (n = 31), Moldavians (n = 31),...
Article
Full-text available
The genetic activity of 2-amino-N6-hydroxyadenine or 2-amino-N-hydroxylaminopurine (AHA) and N6-hydroxyadenine or 6-N-hydroxylaminopurine (HAP) was studied in S. typhimurium, E. coli and Saccharomyces cerevisiae strains. AHA was a more potent mutagen for bacteria and a less potent mutagen for yeast than HAP. The mutagenic activity of analogs was no...