Marco Schmidt

Marco Schmidt
Palmengarten und Botanischer Garten Frankfurt am Main · Gartenbau und Wissenschaft

Dr.

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Citations
Additional affiliations
July 2017 - July 2020
Senckenberg Biodiversität und Klima - Forschungszentrum
Position
  • Researcher
Description
  • DFG-Projekt zu automatischer Art- und Merkmalserkennung bei Pflanzen mit CNN
March 2017 - present
Palmengarten und Botanischer Garten Frankfurt am Main
Position
  • Researcher
Description
  • Curator of collections and databases
October 2015 - June 2017
Senckenberg Biodiversität und Klima - Forschungszentrum
Position
  • Researcher
Description
  • GFBio
Education
January 2001 - June 2006
April 1994 - February 2000
University of Hamburg
Field of study
  • Biology

Publications

Publications (280)
Book
Full-text available
Based on extensive fieldwork in the last 20 years, we present an updated checklist of the Vascular Plants of Burkina Faso, including relevant synonymy, references and iconography. Additionally informations on life-form, vernacular names, economic value, medicinal and cultural uses, habitat and distribution were added, based on literature and own st...
Article
Full-text available
West Africa is a floristically understudied region that is facing severe environmental changes in the 21st century. Basic distribution data and information on the conservation status for most plant species of the region are scarce, and good information only exists for small areas of interest or for key species. This lack of knowledge seriously hamp...
Article
Full-text available
Background The W National Park and its two hunting zones represent a unique ecosystem in Burkina Faso for biodiversity conservation. This study aims at providing a detailed view of the current state of the floristic diversity as a baseline for future projects aiming at protecting and managing its resources. We combined intensive inventories and di...
Article
Herbaria worldwide are housing a treasure of hundreds of millions of herbarium specimens, which are increasingly being digitized and thereby more accessible to the scientific community. At the same time, deep-learning algorithms are rapidly improving pattern recognition from images and these techniques are more and more being applied to biological...
Article
Grass short cell phytoliths (GSCP) are a valuable tool for the reconstruction of former grass-dominated ecosystems, especially in Africa. GSCP are highly diverse and most of them show affinities with certain taxonomic groups within the Poaceae. Taxonomic affiliation of the GSCP can be exploited for palaeoecology because many subfamilies, tribes and...
Article
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Global patterns of regional (gamma) plant diversity are relatively well known, but whether these patterns hold for local communities, and the dependence on spatial grain, remain controversial. Using data on 170,272 georeferenced local plant assemblages, we created global maps of alpha diversity (local species richness) for vascular plants at three...
Poster
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Der Botanische Garten Frankfurt gehört seit 2012 zum Palmengarten. Begründet im Jahr 1763 von Johann Christian Senckenberg, beherbergt er an seinem dritten Standort in der Siesmayerstraße seit den 1950er Jahren eine sehr artenreiche Gehölzsammlung. Neben den meisten einheimischen Gehölzen sind vor allem zahlreiche in Deutschland nur selten kultivie...
Presentation
Vortrag Schutzgemeinschaft Deutscher Wald, Waldschule Hofheim
Poster
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Der Palmengarten beherbergt in seinem Freiland eine artenreiche Gehölzsammlung, darunter zahlreiche Eichen- und Ahornarten sowie seltene Koniferen. Aufgrund des milden Frankfurter Klimas gedeihen bei uns auch Bäume, die in anderen Gebieten Deutschlands nicht winterhart sind. Manche unserer Gehölze stammen noch aus der Gründerzeit des Palmengartens...
Book
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https://www.verband-botanischer-gaerten.de/userfiles/documents/Mitglieder-Loginbereich/Spezialsammlungen/SammlungenVBG-2020u.pdf
Presentation
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Vorstellung von Citizen-Science-Projekten auf der iNaturalist-Plattform in Frankfurt und Umgebung
Article
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International mass digitization efforts through infrastructures like the European Distributed System of Scientific Collections (DiSSCo), the US resource for Digitization of Biodiversity Collections (iDigBio), the National Specimen Information Infrastructure (NSII) of China, and Australia’s digitization of National Research Collections (NRCA Digital...
Article
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Botanische Gärten sind struktur- und artenreiche städtische Lebensräume. Um eine umfassende Übersicht spontaner Artenvielfalt zu erhalten, wurden Nachweise wildlebender Arten im Palmengarten und im Botanischen Garten Frankfurt aus verschiedenen Quellen zusammengeführt und ausgewertet. Im Palmengarten sind bis jetzt 616, im Botanischen Garten 1897 w...
Article
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Das neu eröffnete Blüten- und Schmetterlingshaus ist eine große Attraktion im Palmengarten. Je nach Saison können hier mehrere Dutzend verschiedene Schmetterlingsarten beobachtet werden. Sie werden in Form von Puppen in Costa Rica aus nachhaltiger Zucht bestellt. Die Falter können je nach Nahrungsvorliebe an echten Nektarpflanzen, künstlichen Futte...
Article
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Edeldisteln (Eryngium) eignen sich gut für einen Naturgarten an sonnig-trockenen Standorten. Sie sind für viele Insekten eine beliebte Nektar- und Pollenpflanze. Einige Arten für den Garten, vor allem Eryngium giganteum, und ihre Bestäuber werden kurz vorgestellt.
Article
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Seidenpflanzen haben Blüten mit sogenannten Klemmfallen. Geraten Insekten in die schmalen Spalten, ziehen sie beim Herausreißen von Rüsseln oder Beinen Pollenpakete (Pollinien) mit aus der Blüte. Beim Besuch einer neuen Blüte bleiben diese Pollinien an den Narben hängen. Die Wirkweise der Klemmfallen von Asclepias syriaca wurde fotografisch dokumen...
Article
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Assessing biodiversity status and trends in plant communities is critical for understanding, quantifying and predicting the effects of global change on ecosystems. Vegetation plots record the occurrence or abundance of all plant species co‐occurring within delimited local areas. This allows species absences to be inferred, information seldom provid...
Article
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Ecological theory is built on trade-offs, where trait differences among species evolved as adaptations to different environments. Trade-offs are often assumed to be bidirectional, where opposite ends of a gradient in trait values confer advantages in different environments. However, unidirectional benefits could be widespread if extreme trait value...
Chapter
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Article
Full-text available
Article
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Die kostenlose App „iNaturalist“ bringt interessierte Laien und Experten zusammen. Die App schafft einen niedrigschwelligen Zugang zur Biodiversitätserfassung und Pflanzenbestimmung, Experten sorgen ehrenamtlich für Qualitätssicherung. Auf verschiedenen räumlichen Ebenen wurden Projekte initiiert, z.B. durch die BVNH e.V., das Forschungsinstitut Se...
Article
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Im Jahr 2018 initiierte der Palmengarten das Bürgerwissenschaftsprojekt „Tiere und Pilze in Frankfurts Botanischen Gärten“. Dieser Beitrag beschreibt die zwölf beobachteten Arten der Edelfalter (Nymphalidae), der Familie mit den farbenprächtigsten Arten unserer heimischen Schmetterlinge.
Article
Land degradation is a threat to biodiversity and has negative impacts on agricultural communities by aggravating food insecurity. The objective of this study was to examine the responses of native woody species and soil variables to different levels of glacis degradation in the Sahelian zone of Burkina Faso. Field investigations were performed acco...
Article
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As herbarium specimens are increasingly becoming digitised and accessible in online repositories, advanced computer vision techniques are being used to extract information from them. The presence of certain plant organs on herbarium sheets is useful information in various scientific contexts and automatic recognition of these organs will help mobil...
Article
Vitellaria paradoxa, the shea tree, an economically important fruit-tree species native to savanna regions is threatened in Burkina Faso due to overexploitation and changing land-use. Furthermore, it remains unclear how climate change will influence its frequency and distribution. We investigated the impact of climate change on the projected spatia...
Article
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en Bowé (hardened ferricrete soils formed by erosion, drought or deforestation) are often associated with termite mounds, but little is known about these mounds and their role in the restoration of soils and plant biodiversity on bowé. This study examined termite mounds on bowé and their effects on soil depth and plant richness. Sixty‐four sampling...
Article
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Die Stationen einer botanischen Sammel- und Fotoexpedition von Zomba im Süden bis zum Nyika-Plateau im Norden Malawis geben einen Einblick in Vegetationstypen und Florenelemente des Landes.
Article
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The Palmengarten Frankfurt and the Botanical Garden Frankfurt hold a variety of habitats. Furthermore, since last year the mowing regime of the Palmengarten flower meadow has been adapted to be more insect-friendly. Several species of butterflies occur in both gardens, including gossamer-winged butterflies (Lycaenidae). Some frequently encountered...
Preprint
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As herbarium specimens are increasingly becoming digitized and accessible in online repositories, advanced computer vision techniques are being used to extract information from them. The presence of certain plant organs on herbarium sheets is useful information in various scientific contexts and automatic recognition of these organs will help mobil...
Article
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Abstract Scientific information about biodiversity distribution is indispensable for nature conservation and sustainable management of natural resources. For several groups of animals and plants, such data are available, but for fungi, especially in tropical regions like West Africa, they are mostly missing. Here, information for West African count...
Data
Complete list of vascular plants known for Burkina Faso from Thiombiano et al. (2012) and Schmidt (2018). tab-separated text format
Data
Liste der untersuchten Individuen mit Messergebnisse der Druchflusszytometrie, Fundorten und Sammlern. – List of examined individuals with measurement results of flow cytometry, collection sites and collectors.
Data
Sequenzvariation aller S.-neesii-, S.-umbrosa- und S.-auriculata-Proben und vier weiterer Taxa im Marker trnQ-rps16. Basen sind kodiert als: A: Adenosin; C: Cytosin; G: Guanin; T: Thymin. Deletionen sind mit „-“ kodiert. Positionen mit mehr als einem Signal sind kodiert mit: K: G oder T; M: A oder C; N: A, C, G oder T; R: A oder G; S: C oder G; Y:...
Data
Sequenzvariation aller S.-neesii-, S.-umbrosa- und S.-auriculata-Proben im Marker ITS. Basen sind kodiert als: A: Adenosin; C: Cytosin; G: Guanin; T: Thymin. Deletionen sind mit „-“ kodiert. Positionen mit mehr als einem Signal sind kodiert mit: K: G oder T; M: A oder C; N: A, C, G oder T; R: A oder G; S: C oder G; Y: C oder T. Alignment-Positionen...
Article
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Zusammenfassung: Scrophularia neesii und S. umbrosa ließen sich durch relative Messung des DNA-Gewichtes mit Durchflusszytometrie sicher unterscheiden. Hybriden wurden nicht gefunden. S. neesii ist die weiter verbreitete Sip-pe mit einem Vorkommensschwerpunkt in Süd-deutschland sowie in Teilen Westdeutschlands, S. umbrosa ist dagegen in Norddeutsch...
Article
Biodiversity research studies the variability and diversity of organisms, including variability within and between species with particular focus on the functional diversity of traits and their relationship to environment. Managing biodiversity data implies dealing with its heterogeneous nature using semantics and tailored ontologies. These are them...
Presentation
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A presentation of the insect fauna of Palmengarten and Botanical Garden Frankfurt/M with photo observations from a citizen science project on the iNaturalist platform
Article
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Plants, fungi and algae are important components of global biodiversity and are fundamental to all ecosystems. They are the basis for human well-being, providing food, materials and medicines. Specimens of all three groups of organisms are accommodated in herbaria, where they are commonly referred to as botanical specimens. The large number of spec...
Article
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Aim: Alien plant species can cause severe ecological and economic problems, and therefore attract a lot of research interest in biogeography and related fields. To identify potential future invasive species, we need to better understand the mechanisms underlying the abundances of invasive tree species in their new ranges, and whether these mechanis...
Article
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Plant traits—the morphological, anatomical, physiological, biochemical and phenological characteristics of plants—determine how plants respond to environmental factors, affect other trophic levels, and influence ecosystem properties and their benefits and detriments to people. Plant trait data thus represent the basis for a vast area of research sp...
Article
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L’environnement naturel est en plein changement sous l’influence du climat et des pressions anthropiques en témoignent la dégradation accélérée des terres et des écosystèmes. L’objectif de cette étude est d’examiner l’évolution des unités de végétation ainsi que l’impact des modifications du couvert végétal sur la diversité et la structure des espè...
Article
Um die Vielfalt der Tiere und Pilze in den drei Frankfurter Botanischen Gärten zu dokumentieren, wurde ein Bürgerwissenschaftsprojekt auf der iNaturalist-Plattform eingerichtet. Diese wird hier vorgestellt und ein Überblick zu den bereits vorhandenen Beobachtungen gegeben.
Article
Full-text available
Smartphone-Apps ermöglichen seit einigen Jahren die automatische Bestimmung von Pflanzen mit Methoden Künstlicher Intelligenz. Wir haben drei werbe-und kostenfrei verfügbare Apps zur Bestimmung 30 heimischer Pflanzenarten getestet.
Article
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To document the diversity of animals and mushrooms in the three Frankfurt Botanic Gardens, a citizen science project has been set up on the iNaturalist platform. This is presented here with an overview of the already existing observations.
Article
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Based on own work on species and trait recognition and complementary studies from other working groups, we present a workflow for data extraction from digitized herbarium specimens using convolutional neural networks. Digitized herbarium sheets contain: preserved plant material as well as additional objects: the label containing information on the...
Article
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Mass biodiversity data from scientific collections will be provided by world-wide digitization efforts like iDigBio in the U.S and DiSSCo in Europe. This opens up an increasing amount of data on wild type organisms, which enables the building of large biodiversity knowledge graphs comprising, inter alia , sequence, trait and occurrence data. Knowle...