Instituto Nacional de Innovacion y Transferencia en Tecnologia Agropecuaria
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Bovine papillomaviruses (BPV) infect the basal layer of the epithelium of bovines, where they persist asymptomatically or produce benign fibroepithelial hyperplasia in the skin or mucosa. The present study aimed to describe the genotypes of bovine papillomas at macroscopic and microscopic level. A descriptive study was carried out, using a non-probabilistic convenience sampling. Ninety-nine papillomas from 63 animals out of 32 farms were collected, as well as information about age, gender, breed, and productive use of the bovines. The location, type and degree of epithelial invasion of the papillomas was recorded. The samples were subjected to molecular and histopathological analysis. The highest number of bovines with papillomas was found in dairy farms (75,0%), in females (95.0%), Holstein breed (45,0%), and animals with ages over 24 months (50,0%). Most of the animals presented from 1 to 15 papillomas (31.6%) and only one type of papilloma (79.4%). Cauliflower-like papillomas were found in 48.5% of the cases, while the atypical papilloma in 11.1% cases. Cauliflower-like papillomas were found mainly in udder (14,4%), head (10,0%) and neck (10,0%) and were associated to five BPV genotypes (BPV1, BPV2, BPV6, BPV7 and BPV10) while BPV2 and BPV6 were found associated with all types of papillomas (cauliflower, flat, pedunculated and atypical). The presence of BPV11 in flat and BPV6 in atypical papillomas is reported for the first time. The morphology and histopathological findings did not allow a differentiation of the BPV genotypes.
Location-specific information is required to support decision making in crop variety management, especially under increasingly challenging climate conditions. Data synthesis can aggregate data from individual trials to produce information that supports decision making in plant breeding programs, extension services, and of farmers. Data from on-farm trials using the novel approach of triadic comparison of technologies (tricot) are increasingly available, from which more insights could be gained using a data synthesis approach. The objective of our study was to present the applicability of a rank-based data synthesis approach to several datasets from tricot trials, to generate location-specific information supporting decision making in crop variety management. Our study focuses on tricot data from 14 trials of common bean (Phaseolus vulgaris L.) performed between 2015 and 2018 across four countries in Central America (Costa Rica, El Salvador, Honduras, and Nicaragua). The combined data of 17 common bean genotypes were rank-aggregated and analyzed with the Plackett-Luce model. Model-based recursive partitioning was used to assess the influence of spatially-explicit environmental covariates on the performance of common bean genotypes. Location-specific performance was predicted for the three main growing seasons in Central America. We demonstrate how the rank-based data synthesis methodology allows integrating tricot trial data from heterogenous sources to provide location-specific information to support decision making in crop variety management. Maps of genotype performance can support decision making in crop variety evaluation, such as variety recommendations to farmers and variety release processes.
(Introducción): Diferentes prácticas agrícolas implementadas durante la fase de producción de la caña de azúcar (Saccharum officinarum) generan gases con efecto invernadero (GEI), existiendo gran interés en cuantificar y en identificar su origen para determinar las prácticas que emiten las mayores cantidades. (Objetivos): Utilizar el análisis de ciclo de vida para identificar las principales fuentes de emisión de GEI en el proceso de producción de la caña de azúcar, proporcionar información base para desarrollar alternativas de mitigación y conocer la eficiencia de emisión del cultivo. (Metodología): Se consideraron todas las labores de campo y el transporte de tallos al ingenio. Se determinó el uso de maquinaria y de agroquímicos, fertilizantes, así como el transporte de la caña al ingenio. Para el cálculo de la emisión de metano y óxido nitroso, se utilizaron factores de emisión nacionales y sugeridos por el IPCC. Cada gas se transformó a CO2eq, forma en que se reportan los resultados. (Resultados): La mayor fuente de emisión (73.6 %) lo constituyó la fertilización nitrogenada, seguida por la quema efectuada previo a la cosecha (13.2 %). La eficiencia de emisión varía con la región productora, siendo el promedio nacional de 26.9 kg CO2eq t⁻¹ de caña y, de 247.5 kg CO2eq t⁻¹ de azúcar. Se presentan y discuten algunas opciones de mitigación. (Conclusiones): Se demuestra que la actividad cañera costarricense tiene una eficiencia mejor que otros países productores de caña y que, de implementarse opciones de mitigación, se podría reducir la emisión GEI y ello podría contribuir a diferenciar la producción nacional en los mercados.
Transgenic papaya is widely publicized for controlling papaya ringspot virus. However, the impact of particle bombardment on the genome remains unknown. The transgenic SunUp and its progenitor Sunset genomes were assembled into 351.5 and 350.3 Mb in nine chromosomes, respectively. We identified a 1.64 Mb insertion containing three transgenic insertions in SunUp chromosome 5, consisting of 52 nuclear-plastid, 21 nuclear-mitochondrial and 1 nuclear genomic fragments. A 591.9 kb fragment in chromosome 5 was translocated into the 1.64 Mb insertion. We assembled a gapless 9.8 Mb hermaphrodite-specific region of the Yh chromosome and its 6.0 Mb X counterpart. Resequencing 86 genomes revealed three distinct groups, validating their geographic origin and breeding history. We identified 147 selective sweeps and defined the essential role of zeta-carotene desaturase in carotenoid accumulation during domestication. Our findings elucidated the impact of particle bombardment and improved our understanding of sex chromosomes and domestication to expedite papaya improvement.
Sugarcane ( Saccharum sp .), a world-wide known feedstock for producing sugar, bioethanol, and energy, has an extremely complex genome due to its highly polyploid and aneuploid nature. A double digestion restriction site-associated DNA sequencing protocol (ddRADseq) was tested in four commercial sugarcane hybrids and one high-fibre biotype for the detection and potential application of single nucleotide polymorphisms (SNPs) in genetic breeding. This genotyping approach compared two Illumina sequencing platforms and different filtering schemes, with and without a reference genome. A greater number of reads were obtained with Illumina platform Novaseq6000 than with Nextseq500, being this consistent with a greater number of SNPs determined with high accuracy. Additionally, more SNPs were found using a denovo pipeline compared to de refmap pipeline of the Stacks software. Longer read size, paired-end reads and 4M reads per individual represent the most efficient combination in recovering SNPs. The optimal combination of filter parameters varied depending on the different matrices created based on the different platforms. In both matrices, the highest number of SNPs localized in the longest chromosome 1, whereas the fewest landed in the shortest chromosomes 5 and 8. Multivariate comparisons of the SNPs matrices showed closer relationships among commercial hybrids than with the high-fibre biotype. Functional analysis of the obtained SNPs, performed with the Variant Effect Predictor, demonstrated the appearance of variants throughout the sugarcane genome. The pipeline applied in this study can be exploited to identify useful molecular markers that can be used in sugarcane breeding programs to reduce selection cycles.
Bovine papillomaviruses are related to cause fibroepithelial proliferations in the skin and mucosae and are associated with economic loss mainly related to poor body condition and reduced milk production. This study aimed to investigate the presence and types of bovine papillomaviruses (BPVs) in cattle sampled in different areas of Costa Rica using molecular techniques. A descriptive study with a non-probability convenience sampling was carried out. A total of 99 papillomatous lesions were collected from 63 animals in 32 farms, and analyzed by polymerase chain reaction, rolling circle amplification (RCA), sequencing, and restriction enzymes digestion. Seven bovine papillomavirus types (BPV1, BPV2, BPV4, BPV6, BPV7, BPV10, BPV11) and two putative novel viral variants (BPV-CR1 and BPV-CR2) were identified for the first time in Costa Rica. BPV6 was the most frequently detected virus in lesions (31.2%), followed by BPV2 (25%) and BPV1 (25%). BPV1 and BPV2 were the most widely distributed in the Country. Coinfections were recorded in two animals (BPV1 / BPV2 and BPV4 / BPV6). Restriction analyses allowed differentiating BPV1 from BPV2, BPV4, and BPV7, but failed to identify BPV6, BPV10, and BPV11. Results suggest that a great PVs diversity is harbored by bovines in Costa Rica and indicate the need for further investigations aimed to uncover PV diversity at the full genomic level.
The objective of this study was to evaluate the population of Brahman cattle from Costa Rica. Pedigree analysis of 98,749 animals was used to estimate the following parameters: pedigree integrity, as a proportion of known ancestors; the number of complete generations, maximum generations traced, and equivalent complete generations; inbreeding coefficient (F); generation interval (GI) across four selection paths; additive genetic relationship (AGR); effective number of founders (fe) and ancestors (fa); and effective population size (Ne). The analysis was carried out using the ENDOG software. The maximum proportions of unknown parents, grandparents, and great-grandparents were 14.1%, 38.9%, and 61.2%, respectively. Average F for the whole population was 0.86, while 27.4% of the population was inbred, with an average F of 3.1%. The inbred population increased through the time, while F decreased. The average AGR was 0.64, with maximum values of 4.1 and positive trends. The fe and fa were 617.8 and 172.0, respectively. The Ne indicated increases of F, with values lower than 1%. The GI fluctuated from 6.4 to 7.4, with an average of 6.85 years. These results summarize previous breeding practices and represent useful information for designing breeding programs by anticipating the relationship between the selection response and increases of inbreeding.
Introducción. El frijol de grano rojo es el segundo más consumido en Costa Rica. El mercado penaliza el precio del grano rojo oscuro y exige variedades de tono claro y brillante, aunque, las personas productoras requieren cultivares resistentes a patógenos y de alto potencial de rendimiento. Objetivo. Describir el proceso de desarrollo y las principales características agronómicas de la variedad Tayní. Materiales y métodos. Esta variedad se derivó del cruzamiento triple Tío Canela 75 // SRC1-1-18 / SRC 1-12-1 realizado en 1999 en la Escuela Agrícola Panamericana (Honduras). Fue evaluada en Costa Rica entre el 2002 y el 2008, por el Instituto Nacional de Innovación y Transferencia en Tecnología Agropecuaria y la Universidad de Costa Rica. El comportamiento y características agronómicas de Tayní se determinaron con base en la información obtenida de la evaluación de 4 viveros de adaptación, 28 ensayos de rendimiento y 32 parcelas de validación, llevados a cabo bajo manejo del productor en 12 localidades de Costa Rica. La variedad se liberó el 23 de febrero del 2012 en Pueblo Nuevo, Upala, Alajuela. Resultados. Tayní es una variedad de grano rojo claro brillante, que obtuvo un rendimiento de 1450 kg.ha-1 bajo manejo de la empresa productora y de 2063 kg.ha-1 en condiciones experimentales. Posee un hábito de crecimiento tipo II, resistencia intermedia a Pseudocercospora griseola (mancha angular) y a Thanatheporus cucumeris (mustia hilachosa), y resistencia a los virus del mosaico común (gen I) y del mosaico dorado amarillo (gen bgm-I y QTL mayor SW12). La tonalidad del rojo de su grano (grado 5) es de mayor valor comercial que la de Cabécar (grado 6). Bajo condiciones lluviosas, el grano de Tayní se decolora menos que el de Cabécar (1,1 y 2,8%, respectivamente). Conclusiones. La tonalidad del color rojo del grano y menor porcentaje de decoloración, le dan a Tayní ventaja comercial con respecto a Cabécar, la variedad de grano rojo más sembrada en Costa Rica
Las pudriciones radicales limitan el rendimiento del frijol ( Phaseolus vulgaris ), y aunque en Costa Rica son frecuentes, la identidad de los hongos asociados a ellas es incierta. El objetivo de esta investigación fue identificar molecularmente los hongos asociados a las pudriciones radicales y marchitez del frijol en las dos principales zonas productoras del país. Entre 2017 y 2020, se recolectaron 120 plantas en 20 fincas de las regiones Huetar Norte y Brunca. Se muestrearon líneas experimentales (IBC 302-29 y ALS 0536-6) y variedades comerciales (Brunca, Cabécar, Chánguena, Guaymí, Nambí y Tayní). Se describieron los síntomas observados en campo y se efectuaron aislamientos en agar agua rosa de bengala cloranfenicol, luego cultivos puros de punta de hifa en agar agua, que se trasfirieron a papa dextrosa agar para determinar morfotipos con el uso de claves taxonómicas. Los hongos aislados también se identificaron mediante secuenciación de la región ITS del ADN nuclear ribosomal. Se calculó el porcentaje de frecuencia relativa de morfotipos. Los más frecuentes fueron Macrophomina phaseolina (26.7%), Fusarium oxysporum (13.6%) y Athelia rolfsii (5.6%). A partir de los síntomas de marchitez observados en campo se aislaron los hongos comúnmente descritos en frijol para esas patologías. Es necesario realizar pruebas de patogenicidad para confirmar que son los agentes causales.
[Introducción]: Los sistemas de producción agrícola emiten gases con efecto invernadero, por la aplicación de nitrógeno, para incrementar la producción. [Objetivo]: Se cuantificó y comparó la emisión de N2O resultante de aplicar diferentes fuentes de nitrógeno (nitrato de amonio (NH4NO3), nitrato de calcio (CaNO3), urea convencional (CO(NH2)2), y recubierta con polímeros, RP). [Metodología]: Se aplicaron 250 kg de nitrógeno ha-1 año-1 de cada fuente a plantaciones de café ubicadas en dos zonas productoras de Costa Rica. La recolección de muestras gaseosas se realizó durante todo un año agrícola, utilizándose la técnica de la cámara estática. Se implementó un diseño de bloques completamente al azar con arreglo en parcelas divididas. [Resultados]: El patrón de emisión mostró que, en Naranjo, los mayores eventos se determinaron luego de fertilizar en junio, razón por la cual la emisión fue mayor (P<0.0005) que la determinada en San Marcos de Tarrazú. La emisión anual en Naranjo fue mayor con nitrato de amonio y la menor (P<0.05) con la urea convencional, mientras que en San Marcos de Tarrazú no hubo diferencias importantes. La humedad del suelo, expresada como espacio poroso lleno de agua, no tuvo efectos importantes en la emisión, debido a que en términos promedio fueron inferiores a 60 %. [Conclusiones]: Los factores de emisión determinados fueron menores al sugerido por el IPCC, y estuvieron en el rango de 0.25 % a 0.40 % del nitrógeno aplicado. Se demuestra la importancia de realizar este tipo de investigación, para determinar la emisión de GEI de acuerdo con las condiciones propias, donde se desarrollan las actividades agrícolas del trópico.
An analysis of the main remotly sensed oceanographic variables was conducted to characterize the dominant drivers that modulate the spatial-temporal variability of coastal phytoplankton biomass in the northern limit of the Eastern Tropical Pacific. The phytoplankton biomass was analyzed using monthly average satellite chlorophyll (Chlo) concentration data from MODIS sensors for the period 2003-2017. Oceanographic conditions were analyzed by considering (i) Sea Surface Temperature (SST) high-resolution data from the GHRSST project, (ii) wind stress calculated with data from the zonal and meridional components of the CCMP product, (iii) climatological precipitation, and (iv) climatological river flow. Chlo time series and spatial variability were analyzed using Hovmöller diagrams and Empirical Orthogonal Functions (EOF), respectively. A strong semi-annual signal in Chlo concentration along the coast was observed: the first peak occurs in winter-spring (5.0 mg·m⁻³) and a second one in summer-autumn (6.5 mg·m⁻³). A high year-round average of Chlo concentration (3.0 to 15.0 mg·m⁻³) was maintained by a 10 km wide along-shore coast, with maximum values spatially associated with river mouths, of which Santiago river registered the highest Chlo values (20.0 mg·m⁻³). Surface oceanographic conditions showed a marked annual cycle with warmer conditions (30–31 °C) from July to October and colder ones (23–24 °C) from December to April; during the cold period, seasonal wind stress stimulated coastal upwelling. The EOF showed that 70% of Chlo concentration variability was controlled by the semi-annual pattern, which responded to coastal upwelling conditions during cold period, while rivers outflows influenced high Chlo concentration during the warm period. These results highlighted the importance for land-ocean interface to sustain coastal ecosystems' biological production and the major role of watersheds as sources of nutrients to maintain high biological production during warm periods in transitional tropical-subtropical zones.
Esta investigación cuantifica, mediante la técnica del SF6, el metano entérico en vacas altamente productoras en una finca comercial. El objetivo fue determinar la emisión de metano entérico en vacas Holstein en diferentes estados fisiológicos en un sistema de producción de leche intensivo bajo pastoreo. Para ello, se seleccionaron 9 vacas Holstein que representaron la conformación típica del hato en edad (5,7±0,6 años), número de lactancias (3,6±0,4 partos), producción promedio de leche por lactancia (7924±280 kg leche) y peso (672±36 kg) en diferentes estados fisiológicos: secas (VS), preparto (VPP), primer tercio de lactancia (VPTL) y en medio/final (VM/F) estado de lactación. Los forrajes y suplementeos proporcionados, previo al ordeño, fueron pesados y muestreados para determinar consumo y digestibilidad de la materia seca. En cada período de medición de metano, se realizaron muestreos de las pasturas y se determinó proteína cruda (15,9±0,3%), fibra neutro detergente (63,0±0,9%) y digestibilidad in vitro de la materia seca (67,8±1,9%) del forraje en oferta. La emisión diaria de metano por vaca fue similar (p>0,05) en VS, VPP y en VM/F, y mayores (p<0,05) en VPTL, con rangos (g.v-1.d-1) entre 240 y 443 en VS, de 238 a 483 en VPP, de 277 a 506 en VPTL, y de 281 a 470 en VM/F. Se determinó la relación lineal entre el consumo total de materia seca y la emisión de metano (r2 varió entre 0,42 y 0,78 según el estado fisiológico), así como también entre el metano producido y la producción de leche por día (r2=0,71). Las vacas más productoras emiten más metano, pero son menos emisoras de metano por litro de leche producida. El Pm varió conforme al estado fisiológico y el valor anual fue similar al sugerido por el IPCC.
Most commercial papaya varieties segregate hermaphrodite and female plants. Growers normally select hermaphrodite plants in the field, due to market preferences. This requires planting multiple plants per site and later thinning of the females, distinguished by flower bud inspection. Micropropagation or the use of molecular markers are two possibilities to grow only hermaphrodite plants. Under the tropical conditions of this study, the field performance of hermaphrodite papaya plants developed by both of these methods was described. Moreover, a multiplex qPCR reaction was optimized. Hermaphrodite seedlings selected by molecular markers and plants obtained by micropropagation, had a lower slenderness ratio and initiated fruit production at a lower height than those selected by the conventional practice of the orchard. An analysis of flower types between the sex determination methods indicated that growing one hermaphrodite papaya plant per hole reduces the percentage of female-sterile flowers, resulting in fruit set at a lower trunk height and higher yields.
Introducción. La producción lechera en zonas tropicales se caracteriza por una alta dependencia del recurso forrajero, lo que la hace sensible a las variables climáticas, de las cuales existe información limitada sobre su efecto en el rendimiento de razas lecheras especializadas. Objetivo. El objetivo del presente estudio fue evaluar la asociación entre el índice de temperatura y humedad (ITH) y la producción diaria de leche (kgl) de vacas de razas Holstein, Jersey y sus cruces. Materiales y métodos. El estudio se efectuó en las regiones Norte y Central de Costa Rica, con datos recolectados entre 1990 y 2015. Los valores de ITH se obtuvieron mediante modelos predictivos lineales y modelos espaciales de autocorrelación, ajustados sobre 3547 registros mensuales de temperatura máxima y humedad relativa de diecisiete estaciones meteorológicas. Se analizaron 6 478 582 registros de kgl provenientes de 418 hatos lecheros, mediante un modelo lineal mixto generalizado (GLMM), que consideró los efectos fijos de la raza, el año y el mes calendario, número de parto, etapa de lactancia, raza×etapa de lactancia, ENOS (Efecto “El Niño”), ITH y raza×ITH, además del efecto aleatorio de la vaca. Resultados. Todos los factores presentaron efecto altamente significativo (p<0,0001) sobre la kgl. Para el rango de ITH entre 72-88 se estimaron reducciones lineales de 0,41 (r2=0,94), 0,36 (r2=0,95) y 0,29 (r2=0,82) kg día-1 para Holstein, Holstein×Jersey y Jersey, respectivamente. No se observaron tendencias significativas en los kgl para ITH <72. Las pérdidas económicas atribuibles a la mayor exposición al estrés en la región norte comparada con la región central se estimaron en $680, $587 y $477 por lactancia por vaca para Holstein, Holstein×Jersey y Jersey, respectivamente. Conclusión. Hubo relación inversa entre el índice de temperatura y humedad, y la producción de leche en vacas Holstein, Jersey y sus cruces, en esta región tropical.
El sector cebollero costarricense es dinámico y cuenta con una institucionalidad que respalda las acciones de investigación y extensión, como el Programa Nacional de Cebolla del Ministerio de Agricultura y Ganadería-MAG, las Agencias de Extensión Agropecuaria locales, y el Programa de Investigación y Transferencia de Tecnología Agropecuaria-PITTA Cebolla. Sin embargo, la comercialización en fresco de la cebolla enfrenta dificultades, por lo que este proyecto tuvo por objetivo “Evaluar el proceso de agregación de valor a variedades de cebolla (Allium cepa) cultivadas en zona Norte de la Región Central Oriental (al norte de Cartago). Se consideraron los materiales E515, Predator y Alvara, valorando dos variables principales para el análisis comparativo a partir de pruebas de valor agregado, considerando: tiempo de ejecución del proceso agroindustrial y rendimiento de producción. Las variedades Predator y E515 usualmente mostraron los rendimientos más altos y los menores tiempos de elaboración según el producto de valor agregado del que se tratara. Los resultados fueron transferidos a los beneficiarios en un taller teórico y tres sesiones prácticas en la Planta Piloto Agroindustrial del Instituto Tecnológico de Costa Rica (TEC). Se recomienda ahondar en investigaciones para validar los resultados hallados y se sugieren estudios de factibilidad específicos en el caso de desear incursionar en emprendimientos de este tipo.
El óxido nitroso es un potente gas con efecto invernadero que se genera tanto por procesos naturales como por prácticas agrícolas, entre ellas, la fertilización nitrogenada. Por esta razón, se cuantificó la emisión del N2O por la aplicación de nitrógeno ureico (0, 100, 225 y 350 kg ha-1 a-1) al cultivo de café en dos zonas cafetaleras de Costa Rica (Valle Occidental y Los Santos). La cuantificación de la emisión se realizó durante todo un año agrícola. Los resultados mostraron efecto de la lluvia en la emisión del N2O; independientemente de la dosis, la mayor se presentó en los primeros días posteriores a la aplicación del fertilizante. En el Valle Occidental, la mayor emisión de N2O se detectó con 350 kg de N ha-1 a-1, niveles intermedios con 100 y 225 kg de N ha-1 a-1. La menor se presentó sin fertilización. Estos resultados ajustaron el modelo polinomial (Y=8E-08x3-4E-05x2+0.0064x+0.6266, r2=0.87). Para Los Santos, la emisión fue menor sin fertilizante; los mayores niveles se presentaron con 350 kg de N ha-1 a-1. La emisión con 100 y 225 kg de N ha-1 a-1 fue similar, aunque diferentes de los restantes tratamientos; estos resultados ajustaron un modelo polinomial (Y=-3E-06x2+0.0023x+0.6347, r2=0.87). Con los datos de ambas localidades se ajustó un modelo polinómico Y=6E-08x3–3E-05x2+0.0052x+0.6247 (r2=0.83). El uso de esta información se recomienda para estimar el N2O generado por la aplicación de urea como fuente de nitrógeno a plantaciones de café.
Anecdotal evidence of pyrethroid insecticide product failure for the control of stable fly [Stomoxys calcitrans (L.)] populations in the United States and worldwide prompted us to evaluate the frequency of knockdown resistance (kdr)-type polymorphisms within the voltage-sensitive sodium channel (Vssc) gene of field collected specimens from the United States, France, Costa Rica, and Thailand. The kdr-his allele (L1014H), associated with permethrin resistance, was detected in stable flies from the 10 states sampled in the United States, as well as from Costa Rica and France (Toulouse). Field collections of stable flies from California (Modesto) and New York (Cliffton Springs) exhibited reduced susceptibility upon exposure to a diagnostic permethrin concentration of 10× LC99, but survival did not appear to strictly associate with frequency of the kdr-his allele. This suggests that there are additional resistance mechanisms contributing to the phenotype in these states. The kdr allele (L1014F) was detected for the first time in stable flies originating in France and Thailand, and an improved, DNA-based diagnostic assay was developed and validated for use in future screens for kdr and kdr-his allele frequencies from field collections. The absence of kdr in United States and Costa Rica populations suggests that the allele is currently restricted to Europe and Asia.
Western hemisphere goats have European, African and Central Asian origins, and some local or rare breeds are reported to be adapted to their environments and economically important. By-in-large these genetic resources have not been quantified. Using 50 K SNP genotypes of 244 animals from 12 goat populations in United States, Costa Rica, Brazil and Argentina, we evaluated the genetic diversity, population structure and selective sweeps documenting goat migration to the “New World”. Our findings suggest the concept of breed, particularly among “locally adapted” breeds, is not a meaningful way to characterize goat populations. The USA Spanish goats were found to be an important genetic reservoir, sharing genomic composition with the wild ancestor and with specialized breeds (e.g. Angora, Lamancha and Saanen). Results suggest goats in the Americas have substantial genetic diversity to use in selection and promote environmental adaptation or product driven specialization. These findings highlight the importance of maintaining goat conservation programs and suggest an awaiting reservoir of genetic diversity for breeding and research while simultaneously discarding concerns about breed designations.
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