Extraction of genomic DNA from solid tissues of teleostei fish Extração de DNA genômico em tecidos sólidos de peixes teleósteos

Semina : Ciências Agrárias 01/2009;
Source: DOAJ

ABSTRACT The object of this work was to extract the genomic DNA of solid tissue from Nile tilapia (Oreochromis niloticus), pacu (Piaractus mesopotamicus), piau (Leporinus sp.) and curimba (Prochilodus lineatus), using the methods Proteinase K (PK) and Cetyltrimethylammiun Bromide (CTAB). The DNA extracted from samples of liver, kidney, tail fin, heart, muscle and gills were quantified in spectrophotometer to determine the concentration and purity through the ratio A260nm/A280nm. The data were statistically analyzed and there were no significant effect of interaction between species and tissues about the purity and concentration of the DNA obtained with CTAB, but for the PK there were interaction about the concentration. Using the CTAB method was verified that the mean quantity of DNA in the curimba kidney was significantly (p?g/mL) than the value observed in pacu, whereas, did not differ from the variables found in piau (497.20 ?g/mL) and tilapia (234.50 ?g/mL). For the PK method, the mean quantity of DNA using the muscle of Nile tilapia presented the lowest value (117.35 ?g/mL) with reference to the other tissues and analyzed species (P O objetivo desse trabalho foi extrair o DNA genômico de tecidos sólidos de tilápia do Nilo (Oreochromis niloticus), pacu (Piaractus mesopotamicus), piau (Leporinus sp.) e curimba (Prochilodus lineatus), utilizando os métodos Proteinase K (PK) e Brometo de Cetiltrimetilamônio (CTAB). O DNA extraído das amostras de fígado, rim, nadadeira caudal, coração, músculo e brânquias foi quantificado em espectrofotômetro para determinação da concentração e da pureza por meio da razão A260nm/A280nm. Os dados foram estatisticamente analisados e não se observou efeito significativo para a interação entre espécies e tecidos em relação à pureza e concentração do DNA obtido a partir do CTAB, porém para PK houve interação em relação à concentração. Utilizando o método CTAB verificou-se que a concentração média de DNA no rim de curimba foi significativamente (p nm/A280nm variou de 1,7 a 2,0 e 1,6 a 2,1 para os métodos PK e CTAB, respectivamente. Conclui-se que a pureza do DNA foi alcançada nos diferentes tecidos estudados, demonstrando que o método PK pode ser utilizado para essas quatro espécies de peixes.

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    ABSTRACT: Random Amplified Polymorphic DNA (RAPD) analysis was applied to three species of the tilapia genus Oreochromis and four subspecies of O. niloticus. Thirteen random 10-mer primers were used to assay polymorphisms within and between populations. Different RAPD fragment patterns were observed for different species, although not always for different subspecies. Evidence is presented that RAPD markers might be useful for systemic investigation at the level of species and subspecies.
    Heredity 09/1994; 73 ( Pt 2):117-23. DOI:10.1038/hdy.1994.110 · 3.80 Impact Factor


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