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Molecular phylogenetics and phylogeography of the white-fronted capuchin (Cebus albifrons; Cebidae, Primates) by means of mtCOII gene sequences

Laboratorio de Genética de Poblaciones Molecular-Biología Evolutiva, Departamento de Biología, Facultad de Ciencias, Pontificia Universidad Javeriana, Cra 7ª No. 43-82, Bogotá DC, Colombia.
Molecular Phylogenetics and Evolution (Impact Factor: 4.02). 12/2010; 57(3):1049-61. DOI: 10.1016/j.ympev.2010.09.002
Source: PubMed

ABSTRACT A total of 696 base pairs (bp) of the mitochondrial COII gene were sequenced from 118 individuals of Cebus albifrons (plus an individual of Cebus olivaceus) sampled from diverse geographical areas of Colombia, Peru, Ecuador and Brazil. These animals represented all of the C. albifrons's taxa described by Hershkovitz (1949) in Colombia and Peru (10 out of 13 subspecies are described by this author). The sequences analyzed demonstrate the existence of three well defined groups in northern Colombia (trans-Andean): malitosus, versicolor-pleei-cesarae and leucocephalus. They arose from at least, three distinct migrations from different Amazonian groups. Five different Amazonian and Eastern Llanos C. albifrons's groups (I, II, III, IV, and V) were also found. In many Amazonian localities, some of these groups live in sympatry probably by secondary expansion after their respective formations. Amazonian group I is closely related to the versicolor-pleei-cesarae group, malitosus is closely related to Amazonian group V, while leucocephalus is closely related to Amazonian group IV. Nevertheless, our genetic analysis could not resolve the genetic relationships among the main C. albifrons groups. The ρ-statistic applied to the median-joining network yielded that the major part of the temporal splits estimated occurred in the Pleistocene, reinforcing the importance of the Pleistocene refugia during the evolution of C. albifrons.

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    ABSTRACT: Los primates son uno de los grupos de mamíferos más decomisados por la autoridades ambientales (SDA) en Bogotá, Colombia. Un total de 133 primates fueron confiscados en Bogotá durante el año 2008 y mantenidos en las instalaciones de la SDA. De ellos, 115 fueron secuenciados para el gen mitocondrial citocromo oxidasa II (mtCOII) y en 112 ejemplares, las secuencias obtenidas fueron de alta calidad. Esas secuencias se compararon con las obtenidas para ejemplares muestreados directamente en campo por nuestro grupo de investigación y con origen geográfico conocido. De ese modo, se pudo determinar las áreas geográficas, en el territorio colombiano, donde pueden liberarse esos ejemplares después del tratamiento de rehabilitación oportuno. Los resultados principales para las cinco especies de primates fueron como siguen: 1- Para Saguinus leucopus, los animales analizados pueden ser liberados en cualquier área geográfica dentro del rango de distribución de la especie, ya que solo se detectó un acervo genético sin estructura espacial. 2- Para los 14 Aotus sp. secuenciados procedentes de la SDA, se determinó que: uno de ellos pertenecía a A. vociferans, propio de la Amazonía; siete ejemplares pertenecieron a A. griseimembra, propio del valle del Magdalena hasta la costa Caribe colombiana; cuatro ejemplares representaron a A. brumbacki, de los Llanos Orientales de Colombia; y dos ejemplares se asociaron con A. azarae azarae del norte de Argentina y Paraguay, con lo cual se muestra que en Colombia se está recibiendo fauna ilegal procedente de otros países. 3- De los 14 Cebus albifrons secuenciados, dos pertenecieron al área geográfica de distribución de C. a. versicolor; uno al de C. a. pleei, 10 al de C. a. leucocephalus, y uno no pudo ser asignado ya que su secuencia mostraba gran divergencia respecto a los otros ejemplares secuenciados de esta especie. 4- Los dos Cebus capucinus secuenciados mostraron estar asociados a un acervo genético encontrado en el norte del Chocó, Sucre y Córdoba. 5- De 11 Cebus apella secuenciados, 10 mostraron pertenecer al acervo genético que se encuentra en los Llanos Orientales de Colombia y altamente relacionado a Cebus apella apella de la Guyana Francesa, aunque podrían representar un acervo propio de Colombia, C. a. fatuellus sensu Groves (2001). Un individuo no pudo ser relacionado con ningún grupo de los otros C. apella estudiados, ni con los taxones relacionados a la especie mencionada, pero, probablemente, con su propio estatus taxonómico (C. a. paraguayanus = C. cay, C. xanthosternos, C. nigritus).
    Revista de biologia tropical 09/2010; 58(3):1049-1067. DOI:10.15517/rbt.v58i2.5262 · 0.61 Impact Factor
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    ABSTRACT: Herein we analyzed samples of four species of the Neotropical fox genus Pseudoalopex, representing Ps. culpaeus (Ps. culpaeus andina, from Peru and Bolivia, and Ps. culpaeus culpaeus, from Chile), Ps. sechurae (Peru and Ecuador), Ps. griseus (Argentina) and Ps. gymnocercus (Bolivia) for 419 base pairs of the mtCyt-b gene. The main results obtained were as follows: 1-The ancestor of Ps. sechurae was the first to diverge for the taxa of Pseudoalopex studied around 1.1-1.2 MYA. Ps. sechurae was the species which presented the highest levels of gene diversity of the Pseudoalopex species, probably because it is the oldest one of those studied; 2-The temporal separation of Ps. griseus and Ps. culpaeus is very recent (0.15-0.21 MYA) and no monophyly reciprocity was found in any of the analyses undertaken; 3-The divergence split between Ps. culpaeus culpaeus and Ps. culpaeus andina was around 0.17-0.22 MYA and these two culpaeus forms could be seen as two different ESUs in terms of biological conservation; 4-The individual of Ps. gymnocercus analyzed did not differentiate from the haplotypes of culpaeus. Two hypotheses were speculated: the taxa gymnocercus is not molecularly differentiated from culpaeus because a very extreme and recent speciation or it is an example of hybridization among two Neotropical fox species, with gene introgression of Ps. culpaeus within Ps. gymnocercus; 5-No geographical structure was found within Ps. culpaeus andina. This means that the populations of this species in Peru and Bolivia must be conserved as unique ESUs. 6-There was evidence of population expansion in Ps. culpaeus and Ps. sechurae, although the demographic evolution of both Neotropical foxes was different.
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May 31, 2014