Designing and parameterizing a workflow for optimization: A case study in biomedical imaging.
-
Citations (0)
-
Cited In (0)
Page 1
?????????????????????????????????? ?????????????????????
????? ?? ?????????? ???????
????? ???????
?
? ????????
?
?????????
?
?? ?????????
?
?
??????????
?
???????????
?
??????????????
?
? ?????????
?
?
?????????? ?????????? ??????????
?
?????????? ???????????????????????
??????????????????? ????????????????????? ????????? ?
???? ??????????????????????? ??????
????????????????????????????????????
????????????????????????????????????????
????????????????????????????????????
????????
????????????????????????????????????? ???????
???????????????? ??????????????????????????????
?? ??????????????????????? ???????????????????????
????? ???? ??? ?????????? ???????????????? ??????????
???? ???? ?????? ?????????????????????????????
??? ???????????????????????????????????????? ???
? ??????????????????????????????????????????????
???????????????????????????????????????? ?????
????????????????????????? ??????????????????
?????? ??????????????????? ??????? ?? ??????????????
?????????? ????????????? ???????????? ?? ?????? ?????
??? ????????? ??????? ?????
?????????? ??????? ?????
?????? ???????? ???????????????????????????????
???? ???? ??????????????? ??????????????????????????
??????? ???????????????????? ?????????????????????
???????????????????
???????????????? ????????
????????????? ?????????????????????? ??????????
???????????????? ????????????????????????????
??????????????????????????????????? ????????????
??????????????????????????????????????????????
?????????????? ???????????? ???????????? ???????????
??? ????????????????????????????????????? ?????
???????????????????????????????????????????
????????????????????????????????????????????
?????????????????
?Æ???????????????????????????????????????? ??
??????????????????????????????????????? ??????
????????????????????? ????????????????????? ????
??? ??????????????????????????????????? ????????????
??????????????????????????????????????????????
??????????????????????????????????????????????????
????????????????????? ?????????????????????????
???????????????????????????????????????????????????
?? ?????????????????? ??????????????????????????
? ????????????????? ?? ????????????? ??????????
????????????????????????????Æ???? ??? ?? ???
?????? ???????????????? ???????????????????????????
???????????????????????????????????????????????
?????????????????????????????????????????????
?????????????????? ?????????? ???????????????????
??????????????????????????????????????????????
????????????????????????????????????????????
????? ????????? ???????????????????????????????
???????????????????????????????????????????
????????
??????????????????????????????????????????
???????????????????????????????? ?????????
????????????????????????????? ?????????????????
??????????????????? ????????????????????????
???????????????????????????????????????????????
??????????????????????????????????????????????
????????????????????????? ???????? ???????? ????
????? ???????????????????????????????????? ???????
???????????????????????????????????????????????
??????????????????????????????????????????????
??????????????????????????????????????????????
????????????????????????????
????? ?????????????? ?????????????? ???? ????
??????? ???? ?????????????? ?????????????????????
???????? ???????? ?????????????????????? ???????
????????????????? ???????? ???????? ?? ??????????
??????????????????? ???? ??????????????? ?????? ???
Page 2
????? ??????????? ???????????????????????????????
??????????? ??????????????????? ????? ?????? ??
??????????? ?????????
?????????????????
? ????????????????????????
?????????????
???????????? ???????? ?????????? ??????? ???????????
?????????????????????????????????????????????????
?????????? ???????????? ?????????? ??????????
????????? ???????????????????? ???????? ???????
???????????????? ????????????? ??????? ???? ?? ???
????????????????? ??? ??????????? ????? ??????????
??? ???????????????? ???????????????? ????? ?????????
??????????????? ??????????????????????????? ??
???????????? ?????????? ??????????????? ????????
??????????????????????????????????????????????
??????????
???????????????????????????????????
??????
??? ? ????????????? ?????????
???????
??????????????????????????????????????????
????????????????????????????????????????
???????????????????????????????????????????
????? ????????????????????????????? ???????
??? ??????? ??????????????????????????????
????????????????????????????????????????????
??????????????????????????????????????????????
???????????????????????????????????? ??????
????? ???? ???? ??????????????? ?? ???? ??????
???????????????????????? ?????????????????? ????
??????? ??????? ????????? ?????????????????
???????????? ?????????????
???????????
?????????????????? ?????????? ????????? ????????
??????????????????????? ?????????????????? ?????
?????????? ????????????????????? ???? ????????
??????????????? ??????????????????????? ?????? ??
??????????????????? ?? ??
???????????????????????
????????
??????
???????????????????????????????
????????????????????????????????????????????????
?????????????????????????????????????????????
??????????????????????????????????????????????
??????????????????????????????????????????????
????????????????????????????????????? ???????????
???????????????????????????????? ????????????????
????????????????????????????????? ??????
??????????????????????? ????????????????????
???????????? ?????????? ??????????????????? ????
??????????????????
???????????? ??????????????????
????
???? ???????????? ???????????????????????
???????????????????? ?? ?????????????????????
???????????? ?????????????? ?????????????????
????????????????????????????????????????????? ??
Figure 1. Overview of Larger Pipeline
??????????? ????????????????? ????????????????
????????????????????????????????? ????????????????
?????????????????????????????? ??????? ???????????
??????????????????????????????????????? ??? ????
????????????? ???? ???????????????? ??? ?? ??????
??????????????????????????????????? ????????????
????????????? ??????????????????????????????????
?????????? ??????????? ?????????????????????? ???
? ????????
? ???? ???????????????? ???????
??? ??????????? ?????????
?????????? ??? ??????????????? ???????????????
????? ????????????????????????? ??????? ???????????
??????????????????????????????????????????? ????
????????????? ?????? ????????????????????????????
????????????????? ????? ?????????????????????????
?? ??????? ?????? ???????? ???? ?? ???????? ??? ???????
???? ????????????????????
?????? ???? ??? ???????????
?????????????? ????????????? ????????????
???????????????????????????????????????? ????
??? ????????????????? ?????? ?????????????????
???????????????????????? ????????????????????????
?????????????? ????? ??????????? ???
????
?????
?????? ?????? ???????? ??????? ???????????????? ????
??????????????? ????????????????????????????????
????????????????????????????????????? ??????????
??????????????????????????? ????????????????????
???????????????????????????????????????????????
???????????????????????????????????????????????
??????????????????
?????????????????????????????
????????????
?????
??????????????????????????????????????????
??????????????????????????????????????????
????? ?????????? ???????? ???????????? ??????
????????????
????????? ?????? ????????????? ????
???? ???????? ??????????????????????????
??????????????????????????????????????????????
???????????????????????????????????????????????
Page 3
???????????????????????????????????????????????
????????????? ????????? ???????????? ?????????? ????
???????? ????????????????? ????????????????????
???????????????????????????????????????????? ??
????????????????
????? ???????????????????
?????????????????
?????????????????????????? ??? ?????? ?? ????????? ??
?????? ???????????????????????????????????
????????????????????? ?????????? ?????? ????????
????? ?? ?????????????????? ?????????????????????
????????????????????????????????????????????
????
????????????? ????????????????? ?? ?????
????????????? ????????????????????????? ???
???? ?????????????? ???????????????? ??????????
?????????????? ?????? ??????????????????????????
???? ???????????????????? ??????????? ????????????
? ????????????????????????????? ?????? ??? ?? ???
? ?? ?? ????????? ?????????????????? ???? ????
????????? ???????????? ?????????????? ???? ??
??????? ???????? ???????????
?????
???? ????????
????? ????????????? ???????? ?????? ???? ?????
?????
?????????
????????????????????????????????????????????
???????????
????????????? ????????????????????
???????????????????????????????????????????
???????????????????????
???
???????????? ????????
???
?????????????
???????????????????????????????
????????????????????????????????????? ??? ??????
????????????????????????????????????????????
???????????????????????????????????????????????
???????????????? ???????????????????????????
????????????????????????????????????? ? ????????
????????????????????????
?????????
??????????????
??????????????????????
?????????????????????????????????????????
??????
???????????????????? ?? ????? ????????? ??? ????
? ???????? ???????????????????????? ??????????????
???????????? ?????????????????? ??? ?? ??? ??????
? ?????? ?? ????????? ?? ??? ???????? ??????? ???????
????????????????? ??????????????? ?????????????
?? ???????????????????? ?????? ????????? ?????????
??????????????????????????????????????????????
??? ?????????? ?????? ?????????? ????????? ????????
?????? ????????? ???????????? ??????????? ??
???????
?????????? ?????????????????? ????????????????? ??
?????????????? ???????? ???????? ?????????
????????????????????????????????????????
??????????????????????????????????????? ??????????
????????
? ??????????? ??????????
????? ??????????????
???? ??? ??????????????????????????????? ??????????
????????????? ????? ???????????????? ?????????
????? ?????? ?????????????
?? ????? ?????? ?????
? ?????????????? ??????????????????????? ??????
???????? ?????????????????????????? ????????
?????????? ?????? ?????? ??? ??? ?? ?????????????
?????????????? ?????? ?? ????????? ???? ?????????
????????????? ???? ???? ??????????? ????????????????
????????? ??????? ?????????? ??? ?? ??????????????
???????????????????????? ???????????????????????
?????????????????????????? ????? ?? ?? ????????????
????????????????????????????????????????????
???? ?????????? ??????????????????????????????
????????????????????????????????????????????
???????????????????????????????????????????
???????????????????????? ??????
?????????????????
???????????? ???????????????????????????????
????????????????????????????????????????????????
????????????????????????????????????????????
???????????????????????????????????????????
??????????????? ?????????????????????? ??
?????????????????????????????
????????????????????????? ???????????? ??????
??????????????? ???????? ?????? ??????????? ?????
?????? ?????????????????? ???????? ??????????????
????????? ?? ?? ??? ?????? ??????? ?? ?????????
????????????????????? ???????? ???????? ????????
?????????????????????????????????????????????
????????????
???????????????????????????????????? ??????? ??
???????????????????????????????????????????????
?????????????????????????????????????????????
?????????? ???????????????? ?????????? ??
???????? ?????????????? ??? ????????? ????? ????
????????? ?? ???? ?????? ????????? ??
???????????????
???????????? ??????????? ??????
????????????????????????????????????? ??? ????? ???
??????? ?????????????????? ??? ???????????? ??????
?? ?? ?????????????
??? ???????????????????????
?????????????????????????? ?????? ?? ?????????????
???????????????? ???????? ??? ?????????? ?????
???????? ?????????
?????????
??????
????? ??????????? ?????? ???????
??????????
? ????????????????????????????????????????????? ??
?????????? ???? ???? ???? ?????????? ???????????
?? ???????? ???? ????????????????? ?? ???? ?????
??????????? ?? ???? ??????????????? ??????????????
? ????????????????????????????? ??? ???????? ??
?????? ??????? ????????????
???????? ????????????? ??????????????????
???????? ???????????????????? ?? ??????????????
??????????????????????????????????????????????
?????????????????????????????????????????????
Page 4
? ?????????????? ?????????????????? ??????????????
???????? ?????????? ????????? ????? ??????????
???????? ???????
?? ??????? ??????? ????????
????????????????? ??????????????????????????
?????????????????????????????? ??????????
??? ????????????????????????????????????
?? ??????????????????? ?????????????????? ????
?????????????????? ???????
? ???????????????
???
??????????????????? ???????????? ??????? ??????????
???? ??????????????????????? ???????????????
??????????????????? ?????? ???????????? ??? ?????
???? ?? ????????? ????????? ?????????????????????????
??????????????????????????????????????????? ??
???????????????????? ???????????????? ??????????
???????????????????????????? ????????????? ??????
??????????????????? ??????? ??????????? ????????
???????? ????????????? ???????????? ???
? ??? ??
???????? ???????????????
???????????? ????
? ?????????????? ?????????????????? ?????? ???????
????????? ??????????????????????????????????????
???????????????? ????????????? ????????????????
?? ?????????? ???? ??????? ????????????????
??????????? ????????????????? ???? ??? ???? ????
????????????? ?????????????????????????????????
??????????????????????????????????
???????????????????????????????????????????
???? ???? ???????? ???????? ??????? ???????? ???
??? ??????????????????????????????? ?? ??????????
????????????????? ??? ????????????????????????
????????? ??????????????????????????? ?????????
???????????????????? ???? ????? ???? ?????????
????????????????????????
?
???
??????????????
????????????????????????
?
???? ?? ??????????????
???????????????????????????????????????????
?????????? ??? ???????????????
?
??????????? ?????
?????????????????? ???? ??? ????????? ??????? ???
????? ???? ??????? ????????????????????????????
?? ?????????????????????????? ??????? ???????
?????? ???????????? ???????????? ????????????
???????????? ????????? ???????? ?????????????
?? ??????????????? ???????????????????????????
??????? ????????? ???????????? ?????????????????????
??? ????????????? ?????????????? ??????? ?????????
??? ??????????????????
????????????
???????? ????
??????????? ??????????????????????????????
????
??????
?????????????????????????????????????????
??
????????????????????????????????????????????? ??
??????????? ????????????? ??
?
???? ?? ?????? ????
?????????? ??????????? ??????????????? ????? ?????
?????????
??????????????
???
???????????????????
???????? ??????????????
???????? ???????????????? ?????? ?? ??????? ??
Figure 2. WINGS representation of workflow.
?????? ???????????? ?????????
?????????????????
????????
???
???
??????????????????????? ?????????
?? ??????
??? ??????
??????????
???
?????????
???? ??
??? ?? ?????????????? ????????????
?
????? ????? ??????
???????? ???????????????
?????????????
?????????
???
??????
???????????????????????????????????????????
???????????????????????
????????????? ??????????????? ??????????
??
????????? ???????????????? ??????????????????????
???????? ???????? ????????? ???? ????????? ????
????????? ???? ???????????????
????????? ????????????????????????????????
?????????????? ??????????????? ???????????????????
???????????? ??????????????????????????????
??? ?????????????? ??????????????????
? ???? ?????? ???????????? ?????????? ???????????
????????????????? ???
???? ????????? ??? ?????
???? ?????????????????? ????? ?? ??????????? ????
?? ????????????? ??? ????????????? ???? ???????????
??? ??????? ????? ???????????? ?????? ?? ?????????
???? ??????? ????? ???????????????
???????? ?????????????? ????????
?????????? ???
??????????????????????? ????????
??????
? ??????????????????????????????? ??????? ???
?????? ???????? ?? ??????????????????????????????
?? ?????????? ???????????????? ???????????????
??????????????? ??????????????? ???? ??????????
???????????????? ?????????????????? ????????? ?????
?????????? ???????????? ???? ????????? ??????????
??? ???? ??????
?? ??????? ?? ????????????? ???????? ??????? ???
???????????????? ?? ????? ???????? ??? ??? ?????????
????? ???????????????????????? ?????????????????
Page 5
???????????????????????????????????????????????
???????????????????????????????????????????
???? ?????????????? ????????? ??????????????????
?? ???????????? ??????????????????????????????????
?????????????????????????? ??????? ????????????? ??
???????? ???????????????? ???????????? ???????
????????? ?????????????? ?????????????????? ?? ???
???????
???? ?????????? ?????????? ???????????? ????????
????????? ??????? ???????? ??????????????????????
?????????? ???????????????????????????????? ???
???????????????????????????????????? ???? ??????
????????????????????????????????????????? ?????
???????????????????? ?????? ?????? ????????????
??????????????????????? ??????????? ??????? ????
?? ????????????? ???????????????????? ?????????
????? ??????????????????????? ?? ?????????? ???
??????? ?? ??????????
??? ????????????? ?????????????
???? ????
?????????????????? ????????????? ?????? ???? ???
?????????????? ????? ??????? ????? ???????? ?? ??????
??? ???? ??? ????? ???
?? ????????????????? ??? ??
??????? ??????????? ???????? ????????????????????
????? ?????? ??????????????????? ???????? ???? ????
?????? ???? ??????? ??????? ?????????????????????
?????? ??? ???? ???????????????????? ?? ???????????
??????? ????????????? ???????? ?????????? ?????
????????? ??? ????????????? ?????????????? ?????
???? ??????? ????? ?????????? ?? ??????????????? ????
?? ?? ??????? ??????????? ??? ?? ??????????? ???????
??? ?????????????? ?????? ?????? ??????? ?? ???????
??????? ??????????? ????????? ??????? ????????
?? ????????? ??? ?????????????????????????????
????????????? ??????????? ?????????????????? ??
??????? ?? ????????? ?????????? ????????????????
?????????????????? ????????? ????????? ??? ?????????
????????????? ????? ??????????????????? ?? ??????
????????????????????????????????????????????????
???????????????????????????????????? ???? ???
????? ?????????????? ???????? ?????????? ???????
????????????????? ??????????? ???????????????? ??
?????????????? ??????????????? ?????? ???????????
?????????? ???????????????? ?????????? ??? ????
???? ????? ???????????? ?????? ????????????????
???? ??????? ??????????? ???????????? ?????????
??????????????????? ?????????????????????????
???????????????????????????????????????
?????????????????????????????????????????????????
?????????????????????????????????????????
???????????????????????????????????? ??????????
??? ??????? ????????
???????????????????????????????????????
??
???????????????????????????????????????? ??
????? ?????????????????????????? ????????? ?????
????? ?????????? ??????????????????? ??????? ?? ???
???????? ??? ????? ???? ???? ???????????? ???????
?????? ???????????? ??? ??????????? ??????????
?????? ????????? ???? ????????????????????????? ??????
????????? ??? ????? ?? ????????? ???????????? ? ????
???????? ??? ???????????????????????????????
?????? ?? ???????????????????????????? ?????????
?????????????
?? ???????????????
????
???????? ??????? ????
???????? ?????????????????????????????????
????????????????? ???????????????
??????????
???????????? ????????????? ?? ?????? ??????? ???????
???? ?????? ??????????????? ??????? ??????
????????????? ????????? ???????? ????????????
????????? ??? ??????????????????????? ?????????????
???????????????????????? ???????? ????? ????? ?????
?????????? ??????????????????? ???? ?????????????
???? ????????? ?????????
????? ????????? ??????? ?? ??????????? ????????
?????????? ????? ????????????????? ?????????? ??
? ??? ???????????????????????????? ??? ?? ??????????
???? ??????????????????????????
???????????????????????????????????????????
????????????????????? ???????????????? ???????????
?????? ????????????????????
??? ??????????? ?????
????????????? ???? ??????????? ????????????????
????????????????????
??? ????????? ????? ??????????????????????
??????????????????? ???? ?????????????????
??????????????????????????????????????????
???????????????????????????????????????????????
???????????????????????? ?????????????????????
??? ????????? ?????????????????????????????
????????????????????????????????? ?????????????
???????????????????? ???????????????????????????
?????
??????????? ??????????????????????????????
?? ????
???????????????? ?????????????????????????
???????????????? ????? ?????????????????????????????
??????????? ???????????????? ??????????????? ?????
???????????? ????????????????????????????????????
??? ??????? ??????????? ?????
??? ???????? ?? ??????? ??????? ????????????? ??? ??
????????? ???????????????????????????????
????????????????????????????????????????????
?????????????????????? ???????
View other sources
Hide other sources
-
Available from Vijay S Kumar · 11 Dec 2012
-
Available from isi.edu