Polimorfismo SNP-43 del gen de Calpaína-10 en individuos con enfermedad coronaria y controles

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Revista Chilena de Cardiología - Vol. 29 Número 2, 2010
Polimorfismo SNP-43 del gen de Calpaína-10 en individuos
con enfermedad coronaria y controles
Alejandro Cuevas1,2, Tomás Zambrano1,2, José Luis Márquez1,2, Alfonso Hernández1,2, Nicolás Saavedra1,2,
Priscilla Jaramillo1,2, José Caamaño1,2, Cecilia Lanas3, Fernando Lanas1, 2, 3, Luis Salazar1, 2
Recibido 11 de noviembre de 2009/ Aceptado 2 de Febrero 2010
Correspondencia:
Dr. Luis Antonio Salazar
Departamento de Ciencias Básicas, Facultad de Medicina,
Universidad de La Frontera.
Av. Francisco Salazar 01145,
Casilla 54-D, Temuco Fono: (45) 592 895 - Fax: (45) 592 832.
Email: lsalazar@ufro.cl
Rev Chil Cardiol 2010; 29: 201 - 206
Resumen:
La Diabetes mellitus tipo 2 (DMT2) es un reconocido
factor de riesgo cardiovascular que ha mostrado aso-
ciación con aterosclerosis subclínica; lo cual podría
ser explicado por la presencia de una base genética
común entre ambas patologías. Varios polimorfismos
del gen de calpaína-10 (CAPN10) han sido asociados
con insulino resistencia y DMT2, sin embargo, existe
escasa evidencia de su relación con enfermedad coro-
naria. El objetivo del presente estudio fue evaluar la
posible asociación de la variante SNP-43 de CAPN10
con el desarrollo de enfermedad coronaria en indivi-
duos del sur de Chile.
Métodos: Fueron incluidos en este estudio, 218 pacien-
tes adultos no relacionados con enfermedad arterial coro-
naria (EAC) confirmada mediante angiografía (estenosis
>70%) y 194 individuos controles. La variante genética
UCSNP-43 fue estudiada por PCR-RFLP.
Resultados: No se observaron diferencias significati-
vas entre las frecuencias genotípicas de la variante UC-
SNP-43 en pacientes con EAC (GG: 51.4 %; GA: 42.7
%; AA: 5.9 %) y controles (GG: 59.6%; GA: 35.1%;
AA: 5.2%, p=0.228). Similarmente, no hubo diferencias
significativas entre las frecuencias alélicas entre pacien-
tes con EAC y controles (p=0.200). La Odds Ratio fue
de 1.17 (I.C. 95%: 0.50–2.72), confirmando la ausencia
reasociación.
Conclusión: Nuestros datos sugieren que la variante
UCSNP-43 del gen CAPN10 no está asociada a la pre-
sencia de enfermedad arterial coronaria en la población
investigada.
Background: Diabetes mellitus type 2 (DMT2) is
a well know cardiovascular risk factor and has been
related to subclinic atherosclerosis, which might be
explained by the presence of a common genetic basis
in both diseases. Several polymorphisms of the cal-
pain-10 gene (CAPN10) have been associated with
insulin resistance and DMT; nevertheless, there is
insufficient evidence about their relation with coro-
nary artery disease (CAD). Thus, in the present stu-
dy we investigated the possible association between
the SNP-43 variant of CAPN10 and the presence of
CAD in Chilean subjects.
Methods: A total of 218 unrelated patients with
diagnosis of CAD confirmed by angiography (33-74
years old) and 194 healthy controls (30 - 68 years old)
were included in this study. The SNP43 variant of the
SNP43 polymorphism of Calpain-10 gene in Southern Chilean subjects
with coronary artery disease and controls
1.- Laboratorio de Biología Molecular y Farmacogenética,
Depto. de Ciencias Básicas, Facultad de Medicina,
Universidad de La Frontera, Temuco, Chile.
2.- Núcleo de Desarrollo Científico - Tecnológico en Biorecursos (BIOREN),
Universidad de La Frontera, Temuco, Chile.
3. Departamento de Medicina Interna,
Facultad de Medicina,
Universidad de La Frontera, Temuco.
Trabajo financiado por Fundación Araucaria & Proyecto DIUFRO DI09-1007,
Dirección de Investigación y Desarrollo,
Universidad de La Frontera.

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Revista Chilena de Cardiología - Vol. 29 Número 2, 2010
Introducción:
Diabetes mellitus tipo 2 (DTM2) es uno de los más
potentes factores de riesgo para enfermedad arterial
coronaria (EAC). Se ha reportado que ésta patología
aumenta el riesgo relativo de enfermedad cardiovas-
cular 2 a 4 veces, respecto a población no diabética1.
Además, individuos diabéticos tienen una mayor inci-
dencia de las formas clínicas más severas de eventos
coronarios, como infarto agudo al miocardio y muerte
súbita, así como una mayor tasa de mortalidad poste-
rior a un infarto agudo al miocardio, respecto a indi-
viduos sin ésta patología1. Haffner et al., demostraron
que individuos no diabéticos, de edad media y con en-
fermedad coronaria preexistente, tienen una incidencia
a los 7 años de infarto agudo al miocardio similar a
la de individuos diabéticos sin enfermedad coronaria,
sugiriendo que la diabetes confiere el mismo grado de
riesgo que una enfermedad coronaria preexistente2.
Por otro lado, la historia familiar de diabetes es un pre-
dictor independiente de engrosamiento medio-intimal
de las arterias carótidas3, medida indirecta utilizada
para valorar aterosclerosis subclínica.
Tanto DMT2 como EAC tienen un fuerte componen-
te genético en su etiología y factores genéticos que
predispongan a una mayor susceptibilidad de padecer
DMT2, pudiesen incidir sobre el riesgo de padecer
EAC. Al respecto, CAPN10 fue el primer gen identifi-
cado por clonaje posicional, en el loci de susceptibili-
dad para DMT2, denominado NIDDM1 (Non-insulin
dependent diabetes mellitus 1)4 El gen CAPN10, codi-
fica una proteasa de cisteína no lisosomal, la calpaína
10, cuya función no es completamente conocida. Se ha
demostrado que la calpaína-10 está envuelta en el me-
canismo de secreción de la insulina5, en apoptosis de
las células β pancreáticas6 y en la utilización oxidativa
de la glucosa por el músculo esquelético, entre otros
hallazgos.
Estudios en varias poblaciones han asociado varian-
tes del gen CAPN10 a patologías como el síndrome
de ovario poliquístico7 y DMT28-10, cuya etiología está
asociada a una secreción defectuosa de insulina. En-
tre estas variantes genéticas, principalmente tres han
sido asociadas con un aumento del riesgo de padecer
DMT2 de hasta un 14%: los SNPs -43,-19 y -63, todos
ubicados en regiones no codificantes de CAPN10 (in-
trones 3, 6 y 13, respectivamente).
Recientemente, estas variantes fueron asociadas con
aterosclerosis subclínica y factores que determinan
un fenotipo pre-diabéticos en población México-ame-
ricana no diabética11, sugiriendo que DMT2 y EAC
pueden tener bases genéticas comunes. Sin embargo,
estos hallazgos no han sido replicados en otras pobla-
ciones. Así, el objetivo de este estudio fue evaluar la
posible asociación entre el polimorfismo SNP-43 del
gen CAPN10 y EAC en individuos chilenos del sur de
nuestro país.
Métodos:
Sujetos
Este estudio, de tipo casos y controles, investigó la fre-
cuencia del polimorfismo UCSNP-43 del gen CAPN10
en un total de 412 individuos no relacionados, todos
pertenecientes a la Región de La Araucanía, Chile.
El grupo casos quedó formado por 218 individuos con
diagnóstico de enfermedad arterial coronaria (historia
y ECG de infarto al miocardio o enfermedad corona-
ria comprobada por angiografía con estenosis superior
al 70%), provenientes del Hospital Hernán Henríquez
Aravena de la ciudad de Temuco. El grupo control
correspondió a 194 individuos no relacionados, sin
signos de enfermedad cardiovascular al momento de
participar de este estudio. Para ninguno de los grupos
evaluados existió preselección según los niveles séri-
cos de lípidos. De cada individuo se obtuvieron datos
de presión arterial sistólica y diastólica, además del an-
tecedente de si recibían algún tipo de tratamiento an-
tihipertensivo, índice de masa corporal y presencia de
diabetes mellitus, definida según antecedentes de tra-
tamiento hipoglicemiante o determinaciones sucesivas
de glicemia en ayunas superior a 126 mg/dL.
Polimorfismo SNP43 del gen de Calpaína-10 en individuos con enfermedad coronaria y controles
Cuevas A, et al.
CAPN10 gene was evaluated by PCR-RFLP.
Results: The genotype distribution for SNP43 variant
of CAPN10 gene in CAD patients (GG: 51.4 %; GA:
42.7 %; AA: 5.9 %) and controls (GG: 59.6%; GA:
35.1%; AA: 5.2%) was similar (P=0.228). Similarly,
the allelic frequency was no different (P = 0.200). The
OR for CAD related to AA homozygous genotype was
1.17 (95%C.I. = 0.50 - 2.72), confirming the absence
of association.
Conclusion: These findings suggest that the SNP43
polymorphism of the CAPN10 gene is not associated to
CAD in the studied individuals.
Keywords: Coronary artery disease; Gene polymor-
phism; CAPN10.

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Polimorfismo SNP43 del gen de Calpaína-10 en individuos con enfermedad coronaria y controles
Cuevas A, et al.
El protocolo de este estudio contó con la aprobación
del Comité de Ética Científica del Servicio de Salud
Araucanía Sur. Todos los participantes firmaron volun-
tariamente un consentimiento informado escrito.
Determinaciones bioquímicas
Para las determinaciones de laboratorio se obtuvieron
muestras de sangre venosa sin anticoagulante, previo
ayuno de 12 horas. La concentración de colesterol total
y triglicéridos fue determinada por métodos enzimáti-
co-colorimétricos; el colesterol HDL se midió previa
precipitación selectiva de las LDL y VLDL con ácido
fosfotúngstico e iones magnesio y posterior determi-
nación por el método CHOD-PAP; la concentración de
colesterol de las LDL fue calculada mediante la fór-
mula de Friedewald12. Las concentraciones séricas de
glucosa y ácido úrico fueron determinadas mediante
métodos enzimático colorimétricos.
Genotipificación de la variante SNP-43 del gen
CAPN10
El ADN genómico fue extraído a partir de sangre to-
tal anticoagulada con EDTA mediante la técnica de
precipitación salina descrita por Salazar et al.13. Para
genotipificar la variante SNP-43 del gen CAPN10, se
amplificó un fragmento de 175 pares de bases (bp) me-
diante la reacción en cadena de la polimerasa (PCR)
en un termociclador MyCycler (Bio-Rad, California,
EE.UU.), usando los partidores descritos previamente
por Shima et al.14. El protocolo de PCR utilizado fue el
siguiente: 200 nM de cada primer, dNTPs 0,2 nM, clo-
ruro de magnesio (MgCl2) 2 mM, 1 U de Taq DNA Po-
limerasa (Fermentas, Lituania), 200 ng de ADN y agua
destilada estéril, para un volumen final de 50 μL. La
mezcla de reacción se sometió a una denaturación ini-
cial a 98ºC durante 3 minutos y 30 ciclos compuestos
por denaturación de 1 minuto a 95ºC, hibridación por
1 minuto a 60ºC y una fase de extensión de 1 minuto a
72ºC, seguidos de una extensión final de 10 minutos a
72ºC. El producto amplificado se evaluó en gel de aga-
rosa al 1,5% teñido con bromuro de etidio (0.5mg/L) y
visualizado en transiluminador UV.
Los productos amplificados fueron sometidos a di-
gestión enzimática usando la endonucleasa NdeI (Fer-
mentas, Lituania) mediante el siguiente protocolo: 10
μL de producto de PCR, 2.5 U de NdeI, 2 μL de buffer
de reacción y agua destilada estéril hasta completar
un volumen final de 20 μL. Esta mezcla de reacción
fue incubada por 12 horas en baño termorregulado a
37ºC. Posteriormente, los fragmentos de restricción
fueron evaluados mediante electroforesis en gel de
agarosa al 3%.
Control de calidad de las determinaciones
bioquímicas y moleculares
La exactitud de las determinaciones bioquímicas fue
controlada mediante la utilización de sueros comercia-
les normales y patológicos (Human, Alemania). La po-
sibilidad de contaminación en los análisis moleculares
fue excluida por la utilización de controles de reactivos
en cada serie de amplificación. La correcta genotipifi-
cación del polimorfismo SNP-43 del gen CAPN10 fue
confirmada mediante la repetición al azar del 10% de
los análisis previamente realizados.
Análisis estadístico
El análisis de los datos obtenidos se realizó utilizan-
do el programa Sigmaplot, versión 11.0 (Alemania).
Todas las variables continuas se expresan como me-
dia ± desviación estándar. Todos los parámetros bio-
químicos mostraron distribución normal. La diferen-
cia entre variables continuas se analizó mediante el
test t de Student. Para el análisis de las variables no
continuas, así como distribución genotípica, frecuen-
cia alélica y el equilibrio de Hardy – Weinberg se uti-
lizó el test Chi-cuadrado (χ2). La Odds ratio (OR) y
su respectivo intervalo de confianza de 95%, asociada
al alelo mutado, fue también calculado. El nivel de
significancia estadística considerado en este estudio
fue p < 0,05.

Resultados:
Análisis de las variables clínicas y de laboratorio
Las características clínicas, antropométricas y de la-
boratorio de los sujetos en estudio son mostradas en
la Tabla 1. Los individuos con EAC presentan valo-
res elevados de índice de masa corporal (IMC) y una
mayor prevalencia de factores de riesgo tradicionales
para EAC, incluyendo consumo de tabaco, diabetes,
hipertensión, hipercolesterolemia e historia familiar
de EAC (P<0.001). Las concentraciones séricas de co-
lesterol total, colesterol LDL, triglicéridos, glucosa y
ácido úrico fueron más altas en los pacientes con EAC
que en los controles (P<0.001). Además, los indivi-
duos con EAC presentaron niveles más bajos de HDL-
C (P<0.001). Similarmente, se advirtió una diferencia
significativa en los valores promedio de presión arte-
rial sistólica (P<0.001) y diastólica (P=0.020) entre los
grupos EAC y controles

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Revista Chilena de Cardiología - Vol. 29 Número 2, 2010
Genotipos y frecuencias alélicas
La distribución de genotipos y frecuencia relativa de
alelos para el polimorfismo SNP-43 del gen CAPN10
en individuos del grupo casos y controles, se muestran
en la Tabla 2. La distribución de los genotipos están en
concordancia con el equilibrio de Hardy-Weinberg en
los controles (χ2 = 1,2225; P = NS), grupo casos (χ2
= 0,0023; P = NS) y para la totalidad de los pacien-
tes en estudio (χ2 = 0,7616; P = NS). La frecuencia
del genotipo A/A fue 5.9% en el grupo casos y 5.3%
en el grupo control. Sin embargo, no observamos di-
ferencias significativas en la frecuencia genotípica y
frecuencia alélica entre pacientes con EAC y controles
(P =NS). La OR calculada para el genotipo homocigo-
to A/A fue 1.17 (I.C. 95%, 0.50 – 2.72) confirmando
la ausencia de asociación. Por otro lado, dentro de los
grupos estudiados no se observaron diferencias signifi-
cativas entre las variables de laboratorio relativo a los
genotipos (P =NS).
Discusión:
Diabetes mellitus tipo 2 y enfermedad arterial coro-
naria frecuentemente se manifiestan juntas, pudiendo
existir una base genética común, pero pocos genes
predisponentes a ambas patologías han sido identifi-
cados, siendo CAPN10 un gen candidato. Nuestros re-
sultados muestran que no existe una asociación entre el
polimorfismo SNP-43 del gen CAPN10 y enfermedad
arterial coronaria. Al respecto, no existen reportes an-
teriores que den cuenta de una posible asociación entre
el SNP-43, por sí solo, y esta patología.
Sin embargo, Goodarzi et al. han reportado que un
haplotipo compuesto por los polimorfismos SNP-44,
-43, -56 y -63 del gen CAPN10, ha sido asociado, en
varias poblaciones, con DMT210, 15, y a aterosclero-
sis subclínica en población norteamericana11. Cabe
destacar que en el estudio mencionado, se consideró
como aterosclerosis subclínica al aumento del grosor
Polimorfismo SNP43 del gen de Calpaína-10 en individuos con enfermedad coronaria y controles
Cuevas A, et al.
Tabla 1: Características clínicas y demográficas de los sujetos con
enfermedad arterial coronaria (casos) y controles.
Edad, añ os
Hombres, %
Diabetes, %
PAS, mm Hg
PAD, mm Hg
IMC, kg/m2
Fumadores, %
Hipercolesterolemia, %
Hipertensión, %
Angina, %
IAM, %
Historia Familiar de EAC, %
Nú mero de vasos obstruídos, %
1
2
3
Colesterol total, mg/dL
LDL - C, mg/dL
HDL - C, mg/dL
Triglicéridos, mg/dL
Glucosa, mg/dL
Á cido Ú rico, mg/dL
Casos (218)
62 ± 10
64
32
140 ± 26
80 ± 18
28.2 ± 4.5
64
80
79
77
66
32
Controles (194)
42 ± 8
56
5
125 ± 23
75 ± 9
25.8 ± 4.5
41
20
26
0
0
0
P*
<0.001
0.084
<0.001
<0.001
0.020
<0.001
<0.001
<0.001
<0.001
<0.001
<0.001
<0.001












28%
24%
48%
214 ± 51
127 ± 42
32 ± 8
182 ± 193
113 ± 42
5.6 ± 1.6
0
0
0
175 ± 33
95 ± 27
49 ± 12
114 ± 86
94 ± 37
4.5 ± 1.5












---
---
---
<0.001
<0.001
<0.001
<0.001
<0.001
<0.001
Tabla 1. Número de individuos en paréntesis; IAM; infarto agudo al miocardio; IMC, índice de masa corporal; EAC, enfermedad
arterial coronaria; PAS, presión arterial sistólica; PAD, presión arterial diastólica; HDL-C, Colesterol de las HDL; LDL-C, Coles-
terol de las LDL. *Test t de Student o Chi-cuadrado.

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Polimorfismo SNP43 del gen de Calpaína-10 en individuos con enfermedad coronaria y controles
Cuevas A, et al.
mediointimal de la arteria carótida, medida indirecta
utilizada como screening16, y tal aumento se asoció a
un haplotipo integrado por el alelo mayor del SNP-43
(alelo G).
Por el contrario, el alelo menor (alelo A) fue aso-
ciado a un decremento del grosor mediointimal de la
arteria carótida. Posteriormente el mismo autor, al re-
plicar el estudio en una cohorte no hispana, encontró
los hallazgos descritos previamente, con excepción de
la disminución del grosor mediointimal de la carótida
asociado al alelo A17. Estos únicos reportes que dan
cuenta de una posible asociación entre variantes del
gen CAPN10 y aterosclerosis subclínica, sólo esta-
blecen una relación con un factor predictor de EAC
en un estudio de cohorte de individuos sanos (cuyos
padres padecen EAC), existiendo grandes diferencias
con nuestro trabajo, ya que evaluamos mediante un es-
tudio de casos y controles, la posible asociación entre
el SNP-43 y EAC confirmada por angiografía. Así, no
existe actualmente suficiente evidencia que pueda con-
firmar o rechazar una posible asociación, como factor
de riesgo o protector, entre el polimorfismo en cues-
tión y EAC, considerando que los antecedentes exis-
tentes son controversiales.
Por otro lado, tampoco encontramos una asociación
entre el SNP-43 y las variables clínicas y de laborato-
rio de los individuos en estudio (datos no mostrados),
coincidiendo con lo encontrado en otros reportes9, aun-
que algunos estudios difieren de nuestros hallazgos.
Carlsson et al., al estudiar este polimorfismo en una
cohorte de obesos, encontró una asociación significati-
va entre el alelo mayor G del SNP-43 y concentracio-
nes elevadas de triglicéridos18. Por otra parte, se ha en-
contrado asociación entre el genotipo G/G del SNP-43
tanto con concentraciones elevadas de colesterol total
en suero19, así como con concentraciones más eleva-
das de glucosa a las 2 horas, posterior a una prueba de
tolerancia a la glucosa, respecto a los genotipos G/A y
A/A20. Incluso, el genotipo G/G se ha relacionado con
hipertensión arterial en población asiática.21
Inicialmente, el SNP-43 del gen CAPN10 fue aso-
ciado a DMT21, hallazgo que ha sido confirmado por
algunos metanálisis10, 22 y desestimado por otros23,
restando fuerza a la idea de que podría estar asocia-
do a EAC. Esta doble postura puede deberse a un in-
adecuado poder estadístico de los análisis, diferencias
raciales/étnicas en la frecuencia de los alelos, y es-
pecialmente a interacción gen-gen o gen–ambiente23,
debido al carácter multifactorial de la DMT2 y EAC.
Estos problemas pueden extrapolarse a las diferencias
encontradas en la asociación de esta variante del gen
CAPN10 con EAC, entre los pocos trabajos existentes
respecto al tema. En lo que a nuestro trabajo se refiere,
las frecuencias alélicas fueron muy similares a las pu-
blicadas en población europea (alrededor de 0.75 para
el alelo mayor). Además, es necesario aumentar el ta-
maño muestral, para acrecentar el poder estadístico de
nuestros resultados y estudiar los haplotipos descritos
de CAPN10, debido a la amplia aceptación de la aso-
ciación DMT2 con el haplotipo SNP-43,-19, -63.
En suma, este polimorfismo se ha asociado a una ma-
yor susceptibilidad de padecer DMT2, enfermedad am-
pliamente asociada a EAC, así como a otros factores de
riesgo para EAC, como la hipertensión y concentracio-
nes elevadas de glucosa y triglicéridos. Sin embargo,
nuestros resultados sugieren que esta variante, por si
sola, no es suficiente para incrementar el riesgo de pa-
decer enfermedad coronaria en la población analizada.
Tabla 2: Distribución de genotipos y frecuencia relativa de
alelos para el polimorfismo SNP-43 de gen CAPN10 en
individuos con enfermedad arterial coronaria (casos) y controles.


Genotipo
GA
Alelo
G GG AA A
Casos
(218)
Controles
(194)
x2 = 2.95; 2 gl; P=0.228 x2 =1.64; 1 gl; P=0.200
51.4%
(112)
59.6%
(116)
42.7%
(93)
35.1%
(68)
5.9%
(13)
5.3%
(10)
0.730
0.770
0.270
0.230
Tabla 2. Número de individuos en paréntesis; gl, grados de libertad.

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Revista Chilena de Cardiología - Vol. 29 Número 2, 2010
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