Jhonny Demey

PhD, Applied Multivariate Statistics
Chief Biometry and Statistical Lab

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    ABSTRACT: ARTÍCULO ORIGINAL Diversidad genética de Trichoderma spp. en Venezuela, determinada mediante análisis combinado ITS-AFLP RESUMEN: Se estudió la diversidad genética entre 68 aislados de Trichoderma procedentes de diferentes cultivos, sustratos y localidades, mediante los análisis ITS-AFLP. Se secuenció la región ITS1-5.8S-ITS2 del ADN ribosomal amplificada con los cebadores ITS1 e ITS4 y en el caso de los AFLP se utilizaron cuatro combinaciones de oligonucleótidos. Las relaciones genéticas entre los aislados se analizaron mediante el uso combinado del Análisis de Coordenadas Principales, el Análisis de Conglomerados y el ajuste de un Biplot Logístico Externo sobre datos de disimilitud, utilizando los coeficientes de Jaccard, Emparejamiento simple, Dice y Rogers y Tanimoto. Se identificaron nueve especies y las más abundantes fueron Hypocrea lixii (anamorfoTrichoderma harzianum) y T. koningiopsis representadas por 22 y 20 aislados, respectivamente. Le siguen Hypocrea virens (anamorfo T. virens), Trichoderma ghanense; Trichoderma asperellum y Trichoderma brevicompactum con 7, 6, 4 y 4 aislados respectivamente. Las especies menos frecuentes fueron Trichoderma erinaceum con dos aislados y Trichoderma spirale y Trichoderma longibrachiatum con un aislado cada una. Los AFLP formaron cuatro grupos, correspondiendo uno de ellos al 99,52 % de los aislados de Trichoderma asperellum, otros dos agruparon al 85,54 y 50% de H virens y H. lixii, respectivamente. Las otras seis especies se ubicaron el cuarto grupo, y no pudieron ser diferenciadas entre si. El iniciador con mayor contenido de Información Polimórfica fue AG+CAG, que además permitió separar la especie H. lixii del resto. La combinación AG+CAG separó a T. asperellum de las otras especies. ABSTRACT: The genetic diversity among 68 Trichoderma isolates from different cultivars, substrates and localities was established by ITS-AFLP analysis. The ribosomal DNA region ITS1-5.8S-ITS2 was sequenced and amplified with the primers ITS1 and ITS4. In the case of AFLP, four oligonucleotide combinations were used. The genetic relationships between isolates were analyzed by the combined use of Principal Component Analysis, Cluster analysis, and the adjustment of an External Logistic Biplot over dissimilarity data using Jaccard, simple coupling, Dice and Rogers, and Tanimoto coefficients. Nine species were identified, and the most abundant were Hypocrea lixii (anamorf Trichoderma harzianum) and T. koningiopsis, with 22 and 20 isolates respectively. They were followed by Hypocrea virens (anamorf T. virens), Trichoderma ghanense; Trichoderma asperellum and Trichoderma brevicompactum, with 7, 6, 4 and 4 isolates, respectively. The *Autor para la correspondencia: Daynet Sosa. Correo electrónico:
    04/2014;
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    ABSTRACT: El aprovechamiento masivo de la Faja Petrolífera del Orinoco (FPO) genera una gran cantidad de ripios de perforación impregnados con CEP y fluidos de perforación a base de agua altamente salinizados. Las exoenzimas oxidativas (OE) presentes en hongos ligninolíticos catalizan la oxidación de una amplia gama de contaminantes tóxicos y recalcitrantes, sin embargo, se conoce muy poco sobre la degradación o biotransformación de CEP por hongos. Los objetivos de este trabajo fueron estudiar el potencial del hongo filamentoso Pestalotiopsis palmarum BM-04 para: i) sintetizar OE y; ii) biotransformar CEP. Estudios enzimáticos mostraron la capacidad de este hongo de producir altas cantidades de lacasa (LACp) o de lignina peroxidasa (LIPp) utilizando salvado de trigo o CEP como únicas fuente de carbono y energía, respectivamente. Análisis de espectroscopia FT-IR-ATR revelaron la oxidación enzimática, mediada por OE enriquecidas con lacasa, de átomos de carbono y azufre en la fracción de asfaltenos de los CEP biotratados. Dichos hallazgos fueron confirmados mediante análisis de espectrofotometría UV-visible, lo cual mostró la oxidación de la fracción de petroporfirinas presente en dichos asfaltenos. Estos resultados sugieren que P. palmarum BM-04, un hongo capaz de crecer hasta 50.000 ppm de CEP y 2000 mM de NaCl, presenta un alto potencial en la biotransformación de desechos de perforación de la FPO.
    XIX Congreso Venezolano de Catálisis., Maracaibo, Estado Zulia.; 11/2013
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    ABSTRACT: Large amount of drilling waste associated with the expansion of the Orinoco Oil Belt (OOB), the biggest proven reserve of extra-heavy crude oil (EHCO) worldwide, is usually impregnated with EHCO and highly salinized water-based drilling fluids. Oxidative exoenzymes (OE) of the lignin-degrading enzyme system (LDS) of fungi catalyse the oxidation of a wide range of toxic pollutants. However, very little evidences on fungal degradation or biotransformation of EHCO have been reported, which contain high amounts of asphaltenes and its biodegradation rate is very limited. The aims of this work were to study the ability of Pestalotiopsis palmarum BM-04 to synthesize OE, its potential to biotransform EHCO and to survive in extreme environmental conditions. Enzymatic studies of the LDS showed the ability of this fungus to overproduce high amounts of laccase (LACp) in presence of wheat bran or lignin peroxidase (LIPp) with EHCO as sole carbon and energy source (1300 U mgP(-1) in both cases). FT-IR spectroscopy with Attenuated Total Reflectance (ATR) analysis showed the enzymatic oxidation of carbon and sulfur atoms in both maltenes and asphaltenes fractions of biotreated EHCO catalysed by cell-free laccase-enriched OE using wheat bran as inducer. UV-visible spectrophotometry analysis revealed the oxidation of the petroporphyrins in the asphaltenes fraction of biotreated EHCO. Tolerance assays showed the ability of this fungus to grow up to 50 000 p.p.m. of EHCO and 2000 mM of NaCl. These results suggest that P. palmarum BM-04 is a hopeful alternative to be used in remediation processes in extreme environmental conditions of salinity and EHCO contamination, such as the drilling waste from the OOB.
    Microbial Biotechnology 07/2013; · 3.21 Impact Factor
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    ABSTRACT: Knowledge of the existing genetic diversity in sugarcane germplasm permits planning more effective crosses to achieve new cultivars. The aim of this study was to evaluate the genetic diversity in a sample of 62 genotypes obtained from the sugarcane germplasm bank at the National AgricultureResearch Institute (INIA) using inter-microsatellital molecular markers (ISSR). Five initiators were evaluated that generated 156 polymorphic bands in a range of 240 and 3430 pb. Principal Coordinates Analysis (ACOP) ranked the genotypes into three groups, with a mean genetic similarity of 0.46±0.0046, 0.42 and 0.46±0.0061±0.0085, respectively. Genetic diversity among the groups was low, however.Results suggest that genotypes with desirable agronomic traits in a group distant from another could be directed in crosses with the aim of generating more genetic variability. Keywords: ISSR, genetic similarity, molecular markers.
    Multiciencias. 01/2013;
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    ABSTRACT: Se estudió la diversidad genética de la colección venezolana de la familia Caricáceas a través de 15 iniciadores aleatorios de las series OPA, OPK, OPM, OPY, OPO y OPW, de Operon Technologies Inc., y se identificaron los fragmentos de amplificación asociados a la discriminación entre Carica papaya L y tres especies del género Vasconcellea: V. cundinamarcensis Linden, V. cauliflora Jacq y V. microcarpa Jacq (subespecies microcarpa y pil'ifera). Los 15 iniciadores RAPDs utilizados para la amplificación produjeron un total de 403 fragmentos polimórficos con tamaños entre 186-2550 pares de bases (pb), una proporción de reproducibilidad >90% y permitieron la separación de las cuatro especies, utilizando la disimilaridad debida al coeficiente de emparejamiento simple y los grupos obtenidos bajo el algoritmo UPGMA, aplicados a las tres primeras dimensiones del análisis de coordenadas principales (ACoP). Los fragmentos de amplificación seleccionados, después del ajuste del biplot log'istico externo (BLE), que intervienen directamente en la clasificación de las accesiones fueron: OPA-07(466pb), OPY-07(640pb), OPY-09(390pb), OPO-10(680pb), OPW-06(230pb) y OPW-06(420pb) que discriminan entre los dos géneros; y OPA-02(1111pb), OPA-07(675pb) y OPW-06(740pb) que separan las especies de Vasconcelleas. Los análisis no detectaron ningún patrón asociado al origen geográfico. Los resultados obtenidos para la colección de Caricáceas venezolana a través de los iniciadores RAPDs probados coinciden con los reportados por varios autores en estudios morfológicos, análisis bioqu'imicos y moleculares, y cruzamientos intergenéricos, y han generado información que facilita el manejo de la colección, la elección de progenitores y selección en programas de mejoramiento genético.
    Interciencia 01/2013; 38(3):171-178. · 0.28 Impact Factor
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    Barlin Olivares, Jhonny Demey
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    ABSTRACT: Hoy en día, debido al impacto económico, ambiental y social generado por las condiciones atmosféricas adversas, surge la necesidad de incorporar la información climática en diversas actividades de planificación y desarrollo agrícola. El presente trabajo tuvo como objetivo detectar los niveles actuales de uso de información agrometeorológica e identificar necesidades y demanda de los productores agropecuarios del estado Anzoátegui. Se realizó el análisis e interpretación de los sistemas de producción agropecuaria en el Estado, a través del método de análisis por componentes principales (ACP). Para ello, se aplicaron encuestas a 100 fincas distribuidas en 11 Municipios. Mediante el ACP se seleccionaron los primeros cinco componentes que explicaban el77%de la variación total.Unprimer componente asociado a las variables: uso, origen y resultados de pronósticos meteorológicos aportó el 31,0% de la varianza total. Esto permitió inducir que el uso de pronósticos meteorológicos y la fuente de información climática proveniente de los servicios agrometeorológicos son los factores de mayor incidencia en los sistemas de producción agrícola del estado.
    Revista Multiciencias. Univesidad del Zulia, Punto Fijo, Falcon. 10/2012; 12(4):372-381.
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    Barlin Olivares, Jhonny Demey
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    ABSTRACT: El uso de bioindicadores es una opción utilizada por los productores para enfrentar la variabilidad climática. Este trabajo tiene como objetivo determinar el uso de los bioindicadores climáticos sobre los sistemas de producción agrícola en Anzoátegui. Se encuestaron 100 fincas distribuidas al azar en 11 Municipios, las variables estudiadas fueron: experiencia del productor (EP); residencia del productor (RP); régimen legal de la tierra (RL); tipo de explotación (TIE); tamaño de la explotación (TE) y la capacidad de asociarse en organizaciones comunales (SO), se recurrió al análisis por componentes principales (ACP) para la interpretación de los datos, utilizando el tipo de bioindicador como criterio de clasificación. Se identificaron a: las Cabañuelas, pájaro Tijereta (Tyrannus savana), Chicharra (Tettigades chilensis) y fase lunar como bioindicadores climáticos. El 85,2%de la varianza total, estuvo explicada por dos CP. El primero resultó estar conformado porEP(71,3%) y SO(94,6%).LaEP, SO,TEyRLdeterminaron el tipo de bioindicadores, donde las fases lunares fueron mayormente utilizadas (18,0%). El TE y RL dan mayormente un sentido de propiedad y conservación de los saberes locales y ancestrales. El rescate de estos saberes locales puede ser considerado en planes de gestión de riesgo agrícola comunal.
    Revista Multiciencias. Universidad del Zulia, Punto Fijo. Falcon. 04/2012; 12(2):136-145.
  • V Congreso de Mejoramiento Genetico y Biotecnologia Agricola, CONVEME 2012; 01/2012
  • V Congreso de Mejoramiento Genetico y Biotecnologia Agricola, CONVEME 2012; 01/2012
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    BIT`s 3rd Annual World Congress of Petromicrobiology; 01/2012
  • V Congreso de Mejoramiento Genetico y Biotecnologia Agricola, CONVEME 2012; 01/2012
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    ABSTRACT: La explotación, producción, refinación y transporte de petróleo y sus derivados conlleva ocasionalmente accidentes técnicos y operacionales que causan severo deterioro al ambiente. Existen hongos capaces de biotransformar o biodegradar hidrocarburos que pueden ser utilizados como estrategia en la micorremediación de aguas y suelos impactados por la actividad petrolera. Con el objetivo de determinar la diversidad de hongos aislados de diferentes sustratos contaminados con hidrocarburos y sus derivados, as'i como determinar su capacidad degradativa, se realizaron meta-análisis utilizando la información disponible en las bases de datos cient'ificas Web of Science y SciFinder Scholar. Los resultados de los meta-análisis mostraron que, del total de hongos reportados como aislados de crudo, sus derivados, y sustratos impactados con hidrocarburos, 83% pertenecen al Phylum Ascomycota, 10% al Phylum Zygomycota, 6% al Phylum Glomeromycota y 1% al Phylum Basidiomycota. Los sustratos con mayor diversidad fúngica fueron los suelos impactados con crudo y asfalto natural, obteniéndose la menor diversidad en suelos contaminados con diesel y gasolina. Los géneros de mayor frecuencia fueron Penicillium (18%), Aspergillus (17%) y Fusarium (6%). En función del porcentaje de degradación de hidrocarburos totales de petróleo (TPH), el grupo que presentó mayor degradación fue el formado por los géneros Phanerochaete, Coriolus, Trametes, Pleurotus,Bjerkandera, Rhizopus, Emerciella y Aspergillus (TPH: 52±3.53) y, con respecto a las fracciones de saturados y aromáticos del crudo, los grupos formados por los géneros Phanerochaete,Coriolopsis, Trametes, Pleurotus, Emerciella, Fusarium y Beauveria (74.43±3.40%) y Trametes,Pleurotus, Fusarium y Coriolopsis (97.75±2.25%), respectivamente. As'i mismo, se encontraron evidencias de degradación de las fracciones de resinas y asfaltenos (10-28% y 10-40%, respectivamente) por los géneros Aspergillus, Candida, Emericella, Eupenicillium, Fusarium,Graphium, Neosartorya, Paecilomyces y Pichia. Este trabajo representa el primer meta-análisis sobre la diversidad fúngica aislada de ambientes contaminados con crudo y sus derivados, as'i como de su capacidad hidrocarbonoclástica, a través de la revisión detallada de trabajos cient'ificos publicados en los últimos 50 años y el análisis de sus resultados.
    Rev. Latinoam. Biotecnol. Amb. Algal. 01/2012; 3(1):1-39.
  • Barlin Olivares, Eunice Guevara, Jhonny R Demey
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    ABSTRACT: El uso de bioindicadores es una opción utilizada por los productores para enfrentar la variabilidad climática. Este trabajo tiene como objetivo determinar el uso de los bioindicadores climáticos sobre los sistemas de producción agr'icola en Anzoátegui. Se encuestaron 100 fincas distribuidas al azar en 11 Municipios, las variables estudiadas fueron: experiencia del productor (EP); residencia del productor (RP); régimen legal de la tierra (RL); tipo de explotación (TIE); tamaño de la explotación (TE) y la capacidad de asociarse en organizaciones comunales (SO), se recurrió al análisis por componentes principales (ACP) para la interpretación de los datos, utilizando el tipo de bioindicador como criterio de clasificación. Se identificaron a: las Cabañuelas, pájaro Tijereta (Tyrannus savana), Chicharra (Tettigades chilensis) y fase lunar como bioindicadores climáticos. El 85,2%de la varianza total, estuvo explicada por dos CP. El primero resultó estar conformado porEP(71,3%) y SO(94,6%).LaEP, SO,TEyRLdeterminaron el tipo de bioindicadores, donde las fases lunares fueron mayormente utilizadas (18,0%). El TE y RL dan mayormente un sentido de propiedad y conservación de los saberes locales y ancestrales. El rescate de estos saberes locales puede ser considerado en planes de gestión de riesgo agr'icola comunal.
    Multiciencias. 01/2012; 12(2):136-145.
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    ABSTRACT: Resumen La explotación, producción, refinación y transporte de petróleo y sus derivados conlleva ocasionalmente accidentes técnicos y operacionales que causan severo deterioro al ambiente. Existen hongos capaces de biotransformar o biodegradar hidrocarburos que pueden ser utilizados como estrategia en la micorremediación de aguas y suelos impactados por la actividad petrolera. Con el objetivo de determinar la diversidad de hongos aislados de diferentes sustratos contaminados con hidrocarburos y sus derivados, así como determinar su capacidad degradativa, se realizaron meta-análisis utilizando la información disponible en las bases de datos científicas Web of Science y SciFinder Scholar. Los resultados de los meta-análisis mostraron que, del total de hongos reportados como aislados de crudo, sus derivados, y sustratos impactados con hidrocarburos, 83% pertenecen al Phylum Ascomycota, 10% al Phylum Zygomycota, 6% al Phylum Glomeromycota y 1% al Phylum Basidiomycota. Los sustratos con mayor diversidad fúngica fueron los suelos impactados con crudo y asfalto natural, obteniéndose la menor diversidad en suelos contaminados con diesel y gasolina. Los géneros de mayor frecuencia fueron Penicillium (18%), Aspergillus (17%) y Fusarium (6%). En función del porcentaje de degradación de hidrocarburos totales de petróleo (TPH), el grupo que presentó mayor degradación fue el formado por los géneros Phanerochaete, Coriolus, Trametes, Pleurotus, Bjerkandera, Rhizopus, Emerciella y Aspergillus (TPH: 52±3.53) y, con respecto a las fracciones de saturados y aromáticos del crudo, los grupos formados por los géneros Phanerochaete, Coriolopsis, Trametes, Pleurotus, Emerciella, Fusarium y Beauveria (74.43±3.40%) y Trametes, Pleurotus, Fusarium y Coriolopsis (97.75±2.25%), respectivamente. Así mismo, se encontraron evidencias de degradación de las fracciones de resinas y asfaltenos (10-28% y 10-40%, respectivamente) por los géneros Aspergillus, Candida, Emericella, Eupenicillium, Fusarium, Graphium, Neosartorya, Paecilomyces y Pichia. Este trabajo representa el primer meta-análisis sobre la diversidad fúngica aislada de ambientes contaminados con crudo y sus derivados, así como de su capacidad hidrocarbonoclástica, a través de la revisión detallada de trabajos científicos publicados en los últimos 50 años y el análisis de sus resultados. Abstract Exploitation, production, refining and transportation of crude oil and its derivatives occasionally involves technical and operational accidents causing damage to the environment. Some fungi inhabiting oil-polluted environments are able to transform oil hydrocarbons so they have a high potential to be use in mycoremediation strategies of oil-polluted soil and water by the oil industries activities. In order to determine the fungal diversity isolated from crude oil, water and oil-polluted soils, and hydrocarbon contaminated environments, as well to determine their hydrocarbon degradative capabilities, meta-analysis using information reported in Web of Science and SciFinder Scholar scientific databases were performed. The results showed that the total of fungal diversity isolated is constituted by Phylum Ascomycota (83%), Zygomycota (10%), Glomeromycota (6%), and Basidiomycota (1%). The substrates with major diversity were oil-polluted soils and natural asphalt. Members of the genus Penicillium (18%), Aspergillus (17%) and Fusarium (6%) were the most predominant. The genus with a major percentage of total petroleum hydrocarbons (TPH) degradation were: Phanerochaete, Coriolus, Trametes, Pleurotus, Bjerkandera, Rhizopus, Emerciella and Asperguillus (52±3.53), respect to degradation of saturate and aromatic fractions of crude oil were obtained two groups formed by the genus: Phanerochaete, Coriolopsis, Trametes, Pleurotus, Emerciella, Fusarium and Beauveria (74.43±3.40%), and Trametes, Pleurotus, Fusarium and Coriolopsis (97.75±2.25%), respectively. Likewise, evidence of degradation of resins and asphaltenes fractions of crude oil (10-28% and 10-40%, respectively) were reported by the genus Aspergillus, Candida, Emericella, Eupenicillium, Fusarium, Graphium, Neosartorya, Paecilomyces and Pichia. This work represents the first meta-analysis of fungal diversity isolated from crude oil, its derivatives, and hydrocarbon contaminated environments, including their hydrocarbonoclastic capabilities, through a detailed review of scientific papers published in the last 50 years and analysis of results.
    Rev Latinoam Biotecnol Amb Algal. 01/2012; 3:1-40.
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    ABSTRACT: La disponibilidad de semilla de calidad representa uno de los principales problemas del cultivo de papa en Venezuela, lo cual conlleva necesariamente a la búsqueda de alternativas viables para la obtención de semilla prebásica. El objetivo de este trabajo fue evaluar biofertilizantes bacterianos en un sistema autotrófico para la multiplicación masiva de plántulas de papa, para lo cual se utilizaron microesquejes de plántulas in vitro de dos variedades (IDIAP 92 y ATLANTIC), los mismos fueron sembrados en turba esterilizada, colocados en invernadero durante 5 semanas, los tratamientos aplicados fueron: sin fertilización (control negativo); con fertilización inorgánica (control positivo); bacterias fijadoras de nitrógeno (FN); bacterias solubilizadoras de fósforo (SP) y la mezcla FN + SP. Los resultados mostraron que los tratamientos inoculados con bacterias tuvieron un efecto positivo en las plántulas, donde las tratadas con FN presentaron los mejores 'indices de desarrollo y crecimiento, as'i como una mayor tasa de multiplicación.
    XIX Congreso Venezolano de la Ciencia del Suelo; 01/2011
  • Valoración y análisis de la diversidad funcional y su relación con los servicios ecosistémicos, Serie Técn edited by Casanoves, Fernando and Pla, Laura and Di Rienzo, Julio, 01/2011: chapter 5: pages 47-59; CATIE., ISBN: 9789977575391
  • VII Congreso Latinoamericano de Micologia; 01/2011
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    ABSTRACT: Algunas especies del género Trichoderma, son utilizadas tradicionalmente como agentes de control biológico; debido fundamentalmente a su ubicuidad, a su facilidad para ser aisladas y cultivadas, a su crecimiento rápido en un gran número de sustratos y a que no atacana plantas superiores.Los miembros del género se encentran presentes en los suelos a nivel universal, aunque algunas de las especies pueden ser endófitas. El objetivo de este trabajo fue conocer la diversidad de especies asociadas al agroecosistema de cacao de distintas regiones productoras de Venezuela. Se identificaron 79 aislamientos mediante la secuenciación de las regiones del espaciador interno transcrito del ADN ribosomal y del gen que codifica para el factor de elongación α. Se detectaron 10 especies que representan las tres secciones y cinco de los 2 trece clados aceptados para Trichoderma. Las especies fueron: T. harzianum (H. lixii), T. spirale, T. 3 brevicompactum, T. virens (H. virens), T. asperellum, T. koningiopsis, T. erinaceum, T. ghanense, T. 4 longibrachiatum y T. reesei (H. jecorina). Las especies más abundantes fueron T. harzianum y T. 5 koningiopsis, que junto a T. virens (H. virens) fueron las de mayor distribución geográfica. Se encontraron 6 diferencias altamente significativas entre los distintos sustratos (planta, hojarasca, compost y suelo), 7 regiones cacaoteras (centro-norte-costera, nororiental y sur-occidental) y hospedantes (cacao y otras 8 especies cultivadas). El índice de diversidad general fue de 0,128.
    Revista de Estudios Transdisciplinarios (RET). 01/2011; 3(2).
  • Octava edicion del Congreso de Biotecnologia vegetal BIOVEG 2011; 01/2011

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